New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1030219 = | 184 (0.580) | 22 (0.090) | 12/218 | NT | 15.6% | intergenic (‑121/+108) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 1030312 = | 91 (0.360) | intergenic (‑214/+15) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACG > NC_002947/1030070‑1030367 | gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTg < 1:4644731/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTg < 1:3985460/150‑1 (MQ=255) agcggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccg < 1:2390080‑M1/1‑1 (MQ=255) agcggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccg > 2:6663350‑M1/150‑150 (MQ=255) agcggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccg > 2:5166926‑M1/150‑150 (MQ=255) gcggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccgg < 1:607330‑M1/2‑1 (MQ=255) cggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGc > 1:1566348‑M1/148‑150 (MQ=255) cggctcaagcagcagggaccgcttacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGc > 2:6754650‑M1/148‑150 (MQ=255) cAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGc > 1:7224247/1‑150 (MQ=255) gTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCct > 1:6896455/1‑150 (MQ=255) tcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCctct > 1:2294194‑M1/144‑150 (MQ=255) aagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTc > 2:4493664‑M1/142‑150 (MQ=255) gcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTcgc > 1:2642643‑M1/140‑150 (MQ=255) agcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCgg > 1:2128677‑M1/138‑150 (MQ=255) agcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCgg > 1:4456336‑M1/138‑150 (MQ=255) agcaggtaccgattacgccggtggcgcattccagcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcacggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCgg > 2:3330392‑M1/138‑150 (MQ=255) aaGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCgg > 1:6192804/1‑150 (MQ=255) aaGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCgg < 2:2783825/150‑1 (MQ=255) 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accgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCaa < 2:5031277‑M1/17‑1 (MQ=255) ccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGccc > 1:3146917‑M1/130‑150 (MQ=255) gattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGc < 2:3861710‑M1/23‑1 (MQ=255) tttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCt < 1:3598314/150‑1 (MQ=255) tttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCt > 2:1703685/1‑150 (MQ=255) 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tAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGt < 2:4259039/150‑1 (MQ=255) tAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCATTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGt < 2:541282/150‑1 (MQ=255) aaaGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTa < 2:1454433/150‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTcgcg < 2:2004484/124‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTcgcg > 1:2004484/1‑124 (MQ=255) ccTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCa < 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(MQ=255) gCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCCGGGTCCGAACCGGTCGAGATCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCgg > 2:5293843/1‑150 (MQ=38) ggggTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATGGGGGCTTGGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCCGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACt < 2:7303286/150‑1 (MQ=255) gcgGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACg > 2:4179695/1‑150 (MQ=255) gcgGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCGGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACg > 2:4581754/1‑150 (MQ=255) cgGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTGCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTGCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGGTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGc > 2:4441684/1‑150 (MQ=255) 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tCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCGCTCCCGCAGGGAGGGCGCAGTGTGCGAACCAGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCCCCAAGAGGACGGTACTGGCGAACGCTTAATAAAAACACACAcc > 1:3010819/1‑150 (MQ=37) gtgtTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCa < 2:2947822/150‑1 (MQ=255) gtgtGGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCTCCGGTCGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCa < 1:7406295/150‑1 (MQ=255) ttGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCCGCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGCACCTGTCGAGATACTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAAAGCTTAATAAACACTCACACCGGAAAAAACAttt > 1:4948585/1‑149 (MQ=38) ggCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAATCCCCCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGGACCTGTAGCGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAACGCATAAAAAAAAATAACACCGGGAAAATAATTgag > 2:1851851/1‑148 (MQ=21) 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GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACG > NC_002947/1030070‑1030367 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |