New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1922213 = | 326 (1.030) | 16 (0.050) | 9/250 | NT | 5.4% | coding (1003/1083 nt) | PP_1718 | EAL domain‑containing diguanylate phosphodiesterase |
? | NC_002947 | 1922292 = | 259 (0.890) | coding (924/1083 nt) | PP_1718 | EAL domain‑containing diguanylate phosphodiesterase |
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
AGGTGGTTCGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAAT > NC_002947/1922064‑1922361 | tgaacaaccgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTa < 1:3678094‑M1/2‑1 (MQ=255) tgaacaaccgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTa < 1:4701175‑M1/2‑1 (MQ=255) gaacaaccgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTAt < 1:6438339‑M1/3‑1 (MQ=255) gaacaaccgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTAt < 1:2689374‑M1/3‑1 (MQ=255) gtTCGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTcg > 2:2597393/1‑150 (MQ=255) ttCGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTcgc < 2:6620577/150‑1 (MQ=255) aaccgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTATTcgc < 2:2937062‑M1/7‑1 (MQ=255) aaccgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTATTcgc < 1:3177641‑M1/7‑1 (MQ=255) accgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgctctgcctgtgccggccTATTcgcg < 2:6866119‑M1/8‑1 (MQ=255) accgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTATTcgcg > 1:3909290‑M1/143‑150 (MQ=255) cGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCgg < 1:1820689/150‑1 (MQ=255) cGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCgg < 2:477141/150‑1 (MQ=255) gggTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCggg > 1:5456105/1‑150 (MQ=255) gggTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCggg < 2:3290014/150‑1 (MQ=255) cGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTGGCGGGTAAAacc > 1:288457/1‑150 (MQ=255) gAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAaccc > 1:4994633/1‑149 (MQ=255) aGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGc < 1:6748687/150‑1 (MQ=255) tACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:722742/150‑1 (MQ=255) 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cTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGGTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCCCTCCAACGCCgcagtggtgagtg > 2:1973886/1‑150 (MQ=25) tGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCtgattggtgattgg < 2:4882506/150‑1 (MQ=255) gAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACGCCGGAGTGGTGATTggg > 2:1493765/1‑150 (MQ=255) aaGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGc < 2:6275828/150‑1 (MQ=255) gCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGcac < 2:5994042/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGcaca < 1:1455521/150‑1 (MQ=255) ttGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGGAAACCCCCAACAACCCCGGATTGGTGGTTGGGCCCAgg > 2:2522200/1‑150 (MQ=25) agctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTATTCGCGGGTTCACccgcgaa > 1:4282674‑M1/102‑120 (MQ=255) tGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGc < 1:3748281/150‑1 (MQ=255) gCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGcc < 1:4381399/150‑1 (MQ=255) 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ctgGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACTGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGa < 2:4437632/150‑1 (MQ=255) gCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACCCCGGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCCACCCGGGGAATc > 1:6645766/1‑150 (MQ=21) gCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAACCGCTCCAACGCCTGATTTGTGATTGGGCACAGGCCCCCGGAGGAGCGGGTTCACCCCCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCAACCCGGTGaaac > 1:7299419/1‑148 (MQ=37) aaaTTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACAGTATTAGCCGGTAAAAACCCTCCTAAGCCATATAGGTTAATGGGCCAAGGCCCCCGTAGGAGCGGGATCCCACGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCACAGGGAATaaa > 2:5785662/2‑150 (MQ=255) ttCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCg > 2:6673190/1‑150 (MQ=255) tCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCCGGTAAACCCGCTCCGACGCCGTATTGGTGGTTGGGCCCCGGCCCCCGGAGGAGCGGGTTCACCCCCGAAAATGCCGGCCCAGGCCGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGc > 2:3476521/1‑150 (MQ=25) aCCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCAcc < 2:4091042/150‑1 (MQ=255) ccGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCAcccc < 1:7051820/150‑1 (MQ=255) ccGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCCCACCAACCCCTGGTTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCCTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAAAGGGCGGCACCGGCAGCGCCTACCTGTGAATCAAaccccacccc > 1:543733/1‑150 (MQ=25) gtcgtTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCt > 2:2422505/1‑150 (MQ=255) tcgtTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCATGTGAATCAACCCGCACCCCCTg < 1:5917662/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATc < 2:5287251/150‑1 (MQ=255) gccgccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATcc < 1:853289/150‑1 (MQ=255) gccgccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATcc < 2:5560963/150‑1 (MQ=255) gccgccgccACCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCAGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTACACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATcc < 2:4263750/150‑1 (MQ=255) ccgccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCCCAGGCCGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCAGCCCTCGGCATcca > 2:6955692/1‑150 (MQ=37) cgccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACGCCGGGTTGGTGATTTGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCCCGAAAATGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCAGTGAATAAACCCCCACCCCCAGCCAACGGCATacac > 1:7262654/1‑150 (MQ=21) ccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATccacca < 1:1333355/150‑1 (MQ=255) cGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCaa < 1:1049110/150‑1 (MQ=255) cGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCaa < 1:4828498/150‑1 (MQ=255) gTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCAACCCTGTGAAACAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAAt > 1:3712605/1‑150 (MQ=255) | AGGTGGTTCGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAGCCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAAT > NC_002947/1922064‑1922361 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |