| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5518264 | 153 (0.480) | 32 (0.120) | 13/220 | NT | 18.9% | intergenic (+45/‑109) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 5518320 | 150 (0.580) | intergenic (+101/‑53) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
GCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAG > NC_002947/5518115‑5518413 | gACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AAccc > 2:1900607/1‑150 (MQ=255) gACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AAccc < 1:3795081/150‑1 (MQ=255) aCCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AAcccc < 1:6674842/150‑1 (MQ=255) aCCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AAcccc < 1:3531862/150‑1 (MQ=255) aCCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AAcccc < 2:3773157/150‑1 (MQ=255) tgtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGGCTGTTGGCGGGT‑GAgcccggtg > 1:6435262‑M1/1‑142 (MQ=255) tgtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGGTc > 2:390556/1‑150 (MQ=255) gACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTa < 1:6332712/150‑1 (MQ=255) gACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTa < 1:2166489/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTAc < 1:1559444/150‑1 (MQ=255) ccGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCATATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACa < 1:4838540/150‑1 (MQ=255) cGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGGCTCGTAGCGGGTGAACCCCGtgcaacag > 1:903240/1‑143 (MQ=255) gTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGt < 1:2691875/150‑1 (MQ=255) tgctgcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTg < 1:1117306/150‑1 (MQ=255) gcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCg > 2:7364455/1‑150 (MQ=255) cACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTc < 2:3326614/137‑1 (MQ=255) cAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAAt < 1:236027/150‑1 (MQ=255) cAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGAATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAAt < 2:5664682/150‑1 (MQ=255) ggggAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGc < 2:6420478/143‑1 (MQ=255) ggggAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCGGGTCGCGGGT‑GACCCCGGTGCGACAGTGGGCgggattg > 1:5275624/1‑144 (MQ=255) aGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATg < 2:5794399/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATggg < 2:2157972/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCGTCGCGGGT‑AACCCCCTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCAAggg > 2:1437242/1‑150 (MQ=255) gtgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATgggg < 2:4912057/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATgggg < 2:5140466/150‑1 (MQ=255) tgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGc < 1:2288963/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCg < 1:3068906/150‑1 (MQ=255) tGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGt < 1:5986244/150‑1 (MQ=255) 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cTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTa > 2:1625316/1‑150 (MQ=255) tCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCCTGGGGCGGTTCCCGTCGGAg > 2:6007072/1‑150 (MQ=255) tCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGGTACTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAg > 1:5575095/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCgg < 1:5025478/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGGTCCCGTCGTAGGAGCgg < 2:4180251/150‑1 (MQ=255) 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ttCGCGGGA‑AAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctg < 2:785476‑M1/150‑140 (MQ=255) TTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCAc < 1:550530‑M1/143‑1 (MQ=255) TTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGtact < 2:3127915‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGtact < 1:5287402‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGCGGGT‑AACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTcc > 1:2617853‑M1/1‑50 (MQ=255) cgcgGTT‑AAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcc < 2:1522957‑M1/150‑142 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |