| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 86750 = | 154 (0.480) | 26 (0.090) | 13/240 | NT | 16.2% | intergenic (‑33/+112) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 86841 = | 133 (0.470) | intergenic (‑124/+21) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein | |||||
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
GCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCTGATCT > NC_002947/86693‑86989 | ggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccacgCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTg > 1:4893190‑M1/57‑150 (MQ=255) cagcagTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGTGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACTCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTg < 1:789386/150‑1 (MQ=255) cagcagTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTg < 1:5826809/150‑1 (MQ=255) cagcagTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTg > 2:2915793/1‑150 (MQ=255) gcatTAAAGAGAGGCGATGCATGGTTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCTGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt < 1:7159716/150‑1 (MQ=255) gcagTAAAGAGAGGCGAGGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt < 2:4704127/150‑1 (MQ=255) tAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCCACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgggtgt > 2:411490/1‑150 (MQ=255) gagGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCttt < 2:1316373/150‑1 (MQ=255) gagGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCttt < 1:7005393/150‑1 (MQ=255) ctaTGCATGGGTTATCCTCAATCCTTAAGGGTGCGCGAAGCCCGGGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCATCGCGTTGCTTTGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTga < 1:3836192/148‑1 (MQ=25) cGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTga < 2:2232458/150‑1 (MQ=255) aTGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTgaga < 1:1479089/150‑1 (MQ=255) aTGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTgaga < 1:602474/150‑1 (MQ=255) gCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGAtt < 2:5885226/150‑1 (MQ=255) gCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGAtt < 1:5075484/150‑1 (MQ=255) gTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGtt > 2:693909/1‑150 (MQ=255) aTCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTgg < 1:2605252/150‑1 (MQ=255) tCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGc > 1:6109922/1‑150 (MQ=255) cacaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCtt > 2:6571551/1‑150 (MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCCACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTGGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCttt > 2:4820738/1‑150 (MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGttt > 2:7298413/1‑144 (MQ=255) aaTCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGa < 1:2915793/150‑1 (MQ=255) aaTCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTAAAGTTTGGCtttta > 1:4645930/1‑148 (MQ=255) 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gTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAggg > 2:3585216/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATcc > 2:1191880/1‑150 (MQ=255) CTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCg > 1:3585216‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTGGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCg > 1:3310661‑M1/1‑150 (MQ=255) tgtgggagcgggcgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggTTGGGGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCgg > 1:4732819‑M2/89‑150 (MQ=255) ggagcgggcgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCt > 1:3499216‑M2/86‑150 (MQ=255) gggcgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcTTGGTGTGTTGCTTTGGGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtg > 1:5205726‑M2/81‑150 (MQ=255) CGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtg > 1:7345243‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTa > 2:2018680‑M2/78‑150 (MQ=255) GCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTGTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCGTGGTGGTa < 2:5676859‑M1/150‑1 (MQ=255) 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gcgcgcCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGcc > 1:5903514/1‑150 (MQ=255) gcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCtt < 2:3314597‑M2/134‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCa > 1:4933975‑M2/15‑150 (MQ=255) tcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGa > 1:3653824‑M2/11‑150 (MQ=255) cccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCTGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGaa < 1:1257745‑M2/141‑1 (MQ=255) cccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGaa < 1:693909‑M2/141‑1 (MQ=255) cccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGaa < 1:1352011‑M2/141‑1 (MQ=255) cacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGc > 1:5056170‑M2/8‑150 (MQ=255) cacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGc > 2:6611787‑M2/8‑150 (MQ=255) cacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGc > 2:6731630‑M2/8‑150 (MQ=255) cacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGc > 2:3396953‑M2/8‑150 (MQ=255) acagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCt > 1:6546521‑M2/7‑150 (MQ=255) acagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCt > 2:4561771‑M2/7‑150 (MQ=255) ggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCTGATc < 1:5493524‑M2/148‑1 (MQ=255) gTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCTGATCt > 2:2143482‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCTGATCT > NC_002947/86693‑86989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |