| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 967853 = | 245 (0.770) | 21 (0.070) | 9/242 | NT | 8.5% | intergenic (‑29/+139) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 967944 = | 232 (0.820) | intergenic (‑120/+48) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
TGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTC > NC_002947/967795‑968093 | tGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa > 1:429800/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATc > 2:2416926/1‑150 (MQ=255) ccGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCa < 2:5117326/150‑1 (MQ=255) ttGGGGCGGTGGGTCAGGTGCTTGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAGCCCGCCCCCACAGGTACTGCAAAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCt < 1:4491021/149‑1 (MQ=255) tGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTc < 1:3568979/150‑1 (MQ=255) tGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTc > 2:3811999/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTcaca < 2:6232354/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTcaca > 1:6649189/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTcaca > 1:2902809/1‑150 (MQ=255) cGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCAcatc < 2:1930465/150‑1 (MQ=255) gTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGc < 1:1026039/150‑1 (MQ=255) gTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGc > 2:5594978/1‑150 (MQ=255) ggTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCt > 1:3067788/1‑150 (MQ=255) cATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtcc > 1:1710663/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGACCCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccat < 1:63789/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccat < 2:4164286/150‑1 (MQ=255) gCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccatcc < 2:1218367/150‑1 (MQ=255) cAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCACACATCGTAGGCCGCTTtccatcca > 1:3430993/1‑150 (MQ=255) 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aGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGttt < 1:5398148/150‑1 (MQ=255) GGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTgg < 2:4585330‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTGAACCCCCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATACTGTGCAGGCCCAGTATCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTAACGGATTggc < 1:2524881‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCa < 1:1436195‑M1/150‑1 (MQ=255) ggGCGGGTTCACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCTCAGCCTCACATCAGAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCAc < 2:3360605‑M1/148‑1 (MQ=255) TCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCAc < 2:794407‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCg < 2:2033860‑M1/150‑1 (MQ=255) gggtaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGcc > 2:4336383‑M2/81‑150 (MQ=255) GGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCa < 2:647351‑M1/150‑1 (MQ=255) GGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCa < 2:1998441‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGc > 1:6658898/1‑150 (MQ=255) ccGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGTAGAGGCCATCAGCCTCACTTGATTGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCTCGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGcg > 2:1188876/1‑149 (MQ=255) ccGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGcc < 1:4391601/150‑1 (MQ=255) ccGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGcc > 2:6363588/1‑150 (MQ=255) cccccACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCttt < 2:3448245/150‑1 (MQ=255) 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ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc < 2:429800‑M2/137‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc > 2:1623285‑M2/14‑150 (MQ=255) cgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCg < 1:3865705‑M2/138‑1 (MQ=255) gcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGc < 1:6824579‑M2/139‑1 (MQ=255) gaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTc < 1:2396283‑M2/144‑1 (MQ=255) ggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCt > 1:190344‑M2/5‑150 (MQ=255) gccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCtt < 2:4823389‑M2/147‑1 (MQ=255) gccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCtt > 2:5037143‑M2/4‑150 (MQ=255) gccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCtt > 2:1298694‑M2/4‑150 (MQ=255) ccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTg > 2:3000534‑M2/3‑150 (MQ=255) 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aTCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTc > 2:5394211/1‑150 (MQ=255) | TGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTC > NC_002947/967795‑968093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |