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ccGCGAATGCGTC‑G‑GCAAATTCAATGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAcc > 2:2517657/1‑109 (MQ=21) ccGCGAATGCGTC‑G‑GCAAATTCAATGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAcc < 1:2517657/109‑1 (MQ=21) ccGCGAATGCGTC‑G‑GCAAATTCAATGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTcg > 1:2981085/1‑150 (MQ=37) ccGCGAATGCGTC‑A‑TTGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTcg > 2:500970/1‑150 (MQ=255) aaTGCGTC‑A‑TTGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCt > 1:6029498/1‑150 (MQ=255) aTGCGTC‑A‑TTGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCtt < 2:3639385/150‑1 (MQ=255) tGCGTC‑A‑TTGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTg < 1:7280102/150‑1 (MQ=255) tGCGTC‑A‑TTGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTg < 1:2367835/150‑1 (MQ=255) cGTC‑A‑TTGATTTTGCCGACGCTTTGGG‑GGTAAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTc < 1:4987275/150‑1 (MQ=255) cGTC‑A‑TTGAATTTGCCGACGCATGCGG‑GGTTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTc < 1:2192605/150‑1 (MQ=255) gTC‑A‑TTGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCa > 1:2900942/1‑150 (MQ=255) 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ctttGAATTTGCCGACGCTTTCGC‑GGTTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCAtt < 1:4207697/148‑1 (MQ=255) a‑TTGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTAGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTg > 1:5516308/1‑150 (MQ=255) ttGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGa < 2:4888901/150‑1 (MQ=255) ttaaTTGGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGAg < 1:7135055/148‑1 (MQ=255) aTTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGAGCtt > 1:1157106/1‑150 (MQ=255) tttGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGAGCTTg > 2:3342972/1‑150 (MQ=255) | GCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTT‑A‑CCCGCGAATGCGTC‑A‑TTGAATTTGCCGACGCATTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGAGCTTG > NC_002947/4680189‑4680484 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |