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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,866,177 | 0 | A | T | 9.4% | 653.0 / 8.8 | 254 | intergenic (‑134/+103) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
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Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
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ccggggCGCCACTTGCCCTTGGGG‑GGTTTTGTACGTGTAGGTGG‑GGTTTTCCCCGCGACGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgc < 2:1318917/147‑1 (MQ=255) cccgggCGTCACCTGCCCTCGGGC‑GGTGTTGTACCGGTCGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgc < 2:5057257/147‑1 (MQ=255) cacgggCGTCACTTGCCCTTGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCTAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgc < 2:3013421/147‑1 (MQ=255) caAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcgc < 1:898772/138‑1 (MQ=255) gCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACg > 1:5262102/1‑150 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGt > 1:5852302/1‑136 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 2:5556070/1‑150 (MQ=255) tGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGa > 1:4109090/1‑150 (MQ=255) ggCCCTCGGGC‑GGTGTTGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGa < 2:4902387/149‑1 (MQ=255) ccatatggC‑GGTGATGTACCTGAAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGCCCAGAACTCCCACACGCTGCTCTTTAGACTGGATCTGTCAGAGCATCTGGGTTAGCGAACGCCGCTCTAAc > 2:4074431/7‑150 (MQ=25) aGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga > 1:5572959/1‑150 (MQ=255) aGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga > 1:1708926/1‑150 (MQ=255) gggg‑ggTGTTGTACCTGTAGGCGC‑GGTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcgac < 2:5718216/150‑1 (MQ=39) tGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACg > 1:5823957/1‑150 (MQ=255) gATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc > 1:1839991/1‑150 (MQ=255) | GGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCT > NC_002947/4866028‑4866326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |