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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,866,180 | 0 | T | C | 9.7% | 738.9 / 46.4 | 248 | intergenic (‑137/+100) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (142/80); new base C (7/17); total (151/97) | |||||||||||
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Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
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acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGt < 2:5852302/136‑1 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGt > 1:5852302/1‑136 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 2:5556070/1‑150 (MQ=255) caTGCCCTCGGGC‑GGTGATGTCCCGGTCGGAGG‑GGGTCTA‑CCCGCGACGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTc < 2:5353094/150‑1 (MQ=255) caTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt > 2:6195709/1‑119 (MQ=255) caTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt < 1:6195709/119‑1 (MQ=255) aTGCCCTTGGGG‑GTTGTTTTACCTGTTGGTGG‑GGTTTTA‑CCCGCGATGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCGGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCg < 2:1339413/150‑1 (MQ=255) tGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGa > 1:4109090/1‑150 (MQ=255) tGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGa < 2:4832624/150‑1 (MQ=255) ccatatggC‑GGTGATGTACCTGAAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGCCCAGAACTCCCACACGCTGCTCTTTAGACTGGATCTGTCAGAGCATCTGGGTTAGCGAACGCCGCTCTAAc > 2:4074431/7‑150 (MQ=25) tAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 2:1567507/1‑150 (MQ=255) aGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga > 1:5572959/1‑150 (MQ=255) ttttGTACCTGTTGGTG‑‑GGGTTTACCCCGCGACGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACg < 1:2247172/147‑1 (MQ=255) tGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACg > 1:5823957/1‑150 (MQ=255) gATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc > 1:1839991/1‑150 (MQ=255) tGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTg > 2:5668908/1‑150 (MQ=255) | TTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTG > NC_002947/4866031‑4866327 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |