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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,866,187 | 0 | A | G | 13.9% | 603.7 / 58.3 | 243 | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
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Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
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1:6638904/1‑150 (MQ=255) ggCCCTCGGGC‑GGTGTTGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGa < 2:4902387/149‑1 (MQ=255) cccTGGGGG‑GGTTATGTCCCTGTGGGAGG‑GGGTTTACCCGCTAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAAc < 1:4227491/150‑1 (MQ=39) ccatatggC‑GGTGATGTACCTGAAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGCCCAGAACTCCCACACGCTGCTCTTTAGACTGGATCTGTCAGAGCATCTGGGTTAGCGAACGCCGCTCTAAc > 2:4074431/7‑150 (MQ=25) cTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTc > 2:4610667/1‑150 (MQ=255) cTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTc > 2:1927417/1‑150 (MQ=255) tAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 2:1567507/1‑150 (MQ=255) tAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 2:6918372/1‑150 (MQ=255) aGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga > 1:7397469/1‑150 (MQ=255) aGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga > 1:1708926/1‑150 (MQ=255) tGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACg > 1:5824109/1‑150 (MQ=255) gATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc > 1:1839991/1‑150 (MQ=255) aTGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCt > 2:2983971/1‑150 (MQ=255) tGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTg > 2:3187621/1‑150 (MQ=255) aCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCt < 2:5827599/92‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGt > 2:6839284/1‑150 (MQ=255) tAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGTAGt > 2:6428048/1‑150 (MQ=255) | GGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGTAGT > NC_002947/4866038‑4866335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |