| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,261,933 | T→A | 6.3% | Q289L (CAG→CTG) | PP_4634 ← | alpha/beta family hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,261,933 | 0 | T | A | 6.3% | 1028.8 / 5.6 | 328 | Q289L (CAG→CTG) | PP_4634 | alpha/beta family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (144/148); new base A (24/3); total (177/151) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
ATCAAACACGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATGCGCAGGTGCTTTCGCTCGGCACCCTGTAGATAACCCAACAAACG > NC_002947/5261786‑5262081 | aTCAAACACGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGc > 2:6694550/1‑150 (MQ=255) tCAAACACGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGcc < 2:594633/150‑1 (MQ=255) tCAAACACGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGcc < 2:2794070/150‑1 (MQ=255) aaCACGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCa < 2:5804873/150‑1 (MQ=255) aaCACGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCa > 1:2450676/1‑150 (MQ=255) aaCACGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCCCCCCTCCAGCGCCCACCCGCAATCCATGATGGGGCCCCGCCCCCCCCCGTCCACCCGCCCCAGCCGcc > 1:308151/1‑149 (MQ=255) acacGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCGCCATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCGTCCAGCCGCCCCGGCCGCaa > 2:851378/1‑150 (MQ=255) acacGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCAGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCGTCCACCCACCCCAGCCGCaa > 2:7132/1‑150 (MQ=255) cacGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAAc < 2:3704527/150‑1 (MQ=255) cacGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAAc < 2:5473633/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACt < 1:3376764/150‑1 (MQ=255) ggcgggcgTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCaa < 2:2359184/150‑1 (MQ=255) gcgggcgTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCCCGTTTCGGCCCCCCCAACCAGCGCCCACCCACAAAACAAGATGGTTCCAGGCCCCCCCCCATCCACCCACCCCAGCCGCCACCCCAGCaac > 1:4057959/1‑149 (MQ=255) cgTGAAGTTTGCTGCGCTGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCAGCCGCAACCACTGCAAGGCCAc < 1:5284200/150‑1 (MQ=255) gTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCAcc < 2:5721337/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCg > 2:1137952/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCg < 1:3254038/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCGTTTCGGCCCCCCCATACAGCGCCCACCCACAAAACAAGAAGGTGGCCCGCCCCCCCCCCACCAGCCACCCCAGCCGCCCCCACAGCAACGCCAccc > 1:82443/1‑149 (MQ=255) tttGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCCACCACTGCAAGGCCACCGGCcac > 2:6161621/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAg < 2:1840075/150‑1 (MQ=255) gctgcGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCCCCGGCCCCAgg > 2:6460020/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCt > 2:5142051/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCCACGGTCCGGCGCCCACCCACAAACCCGGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCGTCCAGCCGCCCCCGCCGCAACCACGGCCAGGCCCCCCGCCCCACGCt > 2:2536776/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCCCCGATCCTGCGCCCCCCCCCAAACCATGATGGTGCCAGGCCCCCCCCCGTCCACCCGCCCCCGCCGCCACCCCCGCAAGGCCCCCCGCCCCAGGcgt > 1:5735965/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCCACGCTCCTGCGCCCCCCCGCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTACAGCCTCCCCAGCCGCAACCACGGCAAGGCCACCCGCCACAGGCtt > 2:1925514/1‑150 (MQ=255) gcgcgcAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATACTGCGCCCACCCGCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCGCCCCTGCCGCAACCCCTGCAAGGCCACCCGCCACAGGCTTTCGCGCAACCgg > 2:5629351/1‑150 (MQ=255) gcAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCAt < 2:4330214/150‑1 (MQ=255) gcAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCAt < 2:3411147/150‑1 (MQ=255) 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tGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAAc < 1:3714692/150‑1 (MQ=255) gagaTTGCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCCACGATCCAGCGCCCACCCACAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCCCCGTCCCGCCTCCCCGGCCGCAACCACAGCAACGCCCCCCGCCCCAGGCTTTCGCGAAACCGGGCAGGGAAAAAcg > 2:3516618/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCGGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGG‑AAAACGCGAAATgg > 2:1503810/1‑150 (MQ=255) cGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATgg > 2:6097164/1‑150 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAACTGGcc > 2:6346782/1‑150 (MQ=255) cGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAAtt > 1:2837336/1‑150 (MQ=255) cGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCACGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAAtt > 1:2938329/1‑150 (MQ=255) gCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAAttt > 2:3110413/1‑150 (MQ=255) gCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAAttt > 1:7086770/1‑150 (MQ=255) cTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTc < 2:5269652/150‑1 (MQ=255) tttGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTcc < 1:2097882/150‑1 (MQ=255) tttGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTcc > 1:4346401/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTc < 2:3007190/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCgg < 2:2216236/150‑1 (MQ=255) ggCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGc > 1:4827553/1‑150 (MQ=255) ggCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGACCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGc < 2:2101934/150‑1 (MQ=255) gCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGcc < 2:6872826/150‑1 (MQ=255) gCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGcc > 1:4436604/1‑150 (MQ=255) gCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCAGGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGcc < 1:3760347/150‑1 (MQ=255) cccACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCga < 2:4019064/150‑1 (MQ=255) 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ccTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATg > 1:5000046/1‑150 (MQ=255) cTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATgc > 1:7156492/1‑150 (MQ=255) cTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATgc > 2:3222020/1‑150 (MQ=255) tCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAAttt > 1:3873549/1‑119 (MQ=255) tCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAAttt < 2:3873549/119‑1 (MQ=255) aTCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATGCGCAg < 2:1901341/150‑1 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cGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATGCGCAGGTGCTTTCGCTCGGCACCCTGTa < 2:94833/150‑1 (MQ=255) gCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATGCGCAGGTGCTTTCGCTCGGCACCCTGTAg > 1:2327608/1‑150 (MQ=255) cTTCCACCCTCCCCACCCGCAACCACCCCAAGCCCACCGGCCACACGCTTTCGCCAAACCCGTCATGCAAAAACCCGAAATGGCCAATTTCCACGGCCGAGATATCCACACGTGCAATGCGCAGGTGCTTTCGCTCGGCACCCTGTAGAt < 2:7321272/150‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATGCGCAGGTGCTTTCGCTCGGCACCCTGTAGATa > 1:6427062/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATGCGCAGGTGCTTTCGCTCGGCACCCTGTAGATAAc > 1:6238742/1‑150 (MQ=255) 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ATCAAACACGGTCTGGCGGGCGTGAAGTTTGCTGCGCAGCCGCTTGCGCGCAAGGCTTGAGATTGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCACGATCCTGCGCCCACCCTCAATCCATGATGGTGCCAGGCCCCCCGCCTTCCAGCCTCCCCTGCCGCAACCACTGCAAGGCCACCGGCCACAGGCTTTCGCGAAACCGGTCATGGAAAAACGCGAAATGGCCAATTTCCTCGGCCGAGATATCCACAGGTGCAATGCGCAGGTGCTTTCGCTCGGCACCCTGTAGATAACCCAACAAACG > NC_002947/5261786‑5262081 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |