| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,343,035 | 0 | A | G | 8.7% | 753.5 / 43.6 | 257 | intergenic (+45/‑239) | PP_4696/PP_mr53 | nitrogen regulation protein NR(I)/CrcZ ncRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (113/118); new base G (3/19); total (119/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.38e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.47e-01 | |||||||||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GAGACCGAACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACA > NC_002947/5342886‑5343184 | gagaccgaACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTgaga > 1:3643711/1‑150 (MQ=255)gagaccgaACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTgaga > 1:3643286/1‑150 (MQ=255) agaccgaACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGAc > 1:3279858/1‑150 (MQ=255) ccgaACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGTCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGa < 1:974647/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAgcg < 2:6715203/150‑1 (MQ=255) aCGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGccgcccg > 2:6447157/1‑150 (MQ=255) cAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCcgcgc < 2:2848074/150‑1 (MQ=255) aaGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCcgcgcg < 1:4907979/150‑1 (MQ=255) 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gcaccgcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTaa < 2:4971663/150‑1 (MQ=255) accgcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCAGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACa < 2:13363/150‑1 (MQ=255) gcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTc > 2:4539559/1‑150 (MQ=255) gcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCAAAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATATTTTACCCAAGCTTTCCGCCGTaaaattc > 1:582216/1‑145 (MQ=255) cacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTcc > 1:7311244/1‑150 (MQ=255) ccgcAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGa < 2:1478461/150‑1 (MQ=255) ccTATGCGGCGTCGGTGAGACAGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCGCGGCCACACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAAAACCACACCGCCCCGAAAAATCTGTTACCCAAGCGGTCCGCCGTCACAGTCCCCGAGGCgga > 1:786120/1‑148 (MQ=255) cTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTAc > 2:3001065/1‑150 (MQ=255) tATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACg < 2:231486/150‑1 (MQ=255) ggcgTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAAc < 2:6493330/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGAGACCGAGCGCCCCCCCCGCGGCGCGCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACCACCAACACCCCACGTAACACCACACCACCCCTAAAAATCAGTTACCCAACCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGaa > 1:4007871/1‑150 (MQ=255) gTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACgt > 2:7398334/1‑51 (MQ=255) tGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGc < 2:6662390/150‑1 (MQ=255) gaCCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGAc > 2:4180643/1‑150 (MQ=255) | GAGACCGAACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACA > NC_002947/5342886‑5343184 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |