| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,349,481 | C→G | 23.9% | intergenic (+59/‑119) | pgi‑II → / → acsA‑II | glucose 6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,349,481 | 0 | C | G | 23.9% | 366.0 / 101.7 | 169 | intergenic (+59/‑119) | pgi‑II/acsA‑II | glucose 6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (76/50); new base G (19/21); total (97/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCC > NC_002947/5349332‑5349630 | ccAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTc < 2:7129714/150‑1 (MQ=255)ccAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACGTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTc < 1:5763312/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTa < 1:5237301/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTa < 2:6689147/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTa < 2:5836184/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTa < 2:1410452/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTa < 2:1607096/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTa < 1:1086497/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAggc < 1:4700173/150‑2 (MQ=37) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCgg < 1:5634403/150‑1 (MQ=255) tCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCggg < 2:699250/150‑1 (MQ=255) cGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAggcgggt < 2:5720971/150‑6 (MQ=25) cGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑t < 2:6158607/150‑1 (MQ=255) ggTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑tt < 2:6318946/150‑1 (MQ=255) gTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑ttt < 2:1882982/150‑1 (MQ=255) tAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTa < 2:7408707/150‑1 (MQ=255) ccTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTAccc < 2:3888676/150‑1 (MQ=21) tGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCgg < 1:566670/140‑1 (MQ=255) ggAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCcgcg < 2:1166156/150‑1 (MQ=21) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGaa < 1:647917/150‑1 (MQ=255) gACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑ACCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGGagg > 2:5075304/1‑149 (MQ=255) aGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAggc < 2:3839378/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCGCGTGGCGGGGTAAA‑‑ACCC‑‑CCAACCAGCCCACCCGTAACGACGGGGGGGGGGG‑TTTACCCCCCAAgggg > 1:1855229/1‑150 (MQ=19) cgcCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAggccg < 2:2947240/150‑1 (MQ=255) gcCGAAGACGGTCCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTGCGC‑GGGTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAggccgg < 2:7167190/150‑1 (MQ=18) cTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAg < 2:2209953/99‑1 (MQ=255) cTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAg > 1:2209953/1‑99 (MQ=255) cactaccCCCGCGGCCGGCCCCGCGGTGGACCCGTGCTTGGGCCGCCGTCTGCGC‑GGGTAAC‑‑CCCG‑‑CCTACCCGGCAACGCGTGACGGCGTAGGCGCGGG‑TGTCCCCGGGAAGGGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACt < 2:4514472/149‑1 (MQ=255) ctactTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGt < 2:6795962/150‑1 (MQ=255) tactTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑ACCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTTAACAACGCACCCAGCTACACTGTc > 2:1096868/1‑150 (MQ=255) ttCCGCGGCCGTCCCCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCAACCCGGCAACGCGGTAACTCGTGGGAGCGGG‑TTTACCCGCGCACAGGCCGGCCCCGGTTGAACACCGCTCCCCGCAACACAGTCGTa > 2:5243886/1‑150 (MQ=37) ttCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTAGC‑GGGTAAA‑‑ACCG‑‑CCTAACAGGCAACGCGTTACCTAGTAGGAGCGGG‑TTTAACCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTTAAAAACGCTACCAGCTAAAATGTATTa > 2:1638718/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCTTTACCTCGTAGGTGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATc < 2:4220153/150‑1 (MQ=255) cacgggggTTGACCCGCGGTTGTGCCGGCCTCTGCGG‑GGGAAAC‑‑CCCG‑‑CCTCCCCGGCAAGGGGTTCCCTGGTTGGCGGGGG‑TTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGt < 2:1611925/144‑1 (MQ=255) cgggggTTGATCCGCGCTTGGGCCGGCCTGTTCGC‑GGGTAAC‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGAAACGCTTTACCTCTTTGGAGGGGT‑TTTCCCCGCTAAGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTg < 2:5741524/146‑1 (MQ=255) gttttaTCCGGTCTTGTGCCGGCCTTTGCGG‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTCCCCGGAACCGGGTTACGTGGTTGGGGCGGT‑TTTACCGGCTAAGCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGt < 2:3454148/145‑1 (MQ=255) gTTGATCCGTGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAC‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTCGGTGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTc < 2:234344/150‑1 (MQ=255) tCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTAGC‑GGGTAAA‑‑ACAG‑‑CCTACCACGCAAAGCGTTACCTCGGAGTAGAGGG‑TTTACCCCCGAAGAGGCCCGCCCAGGTTTAACAACGCACCCACCTAAAATGTATTAAAGAATAGCCGTTGGAGTCCATcc > 2:6478169/1‑149 (MQ=255) tCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTCGC‑GGGTAAA‑‑ACCC‑‑CCAAACAGGCAAAGCGTTTGCGGGGTGGCGCGGG‑GTTACCCGCGAAGAGGGCGGCCCACGGTTTACACCCCCCCCAGCTACCCATTCTTATAGAATATCCCGTGGAGTCCATCg > 2:4438617/1‑150 (MQ=255) cgCTTGTGCCGCCCTCTCCGG‑GTGAAAA‑‑CCCC‑‑CCT‑CCCCGCAACGGCGTACCCTGTTGGTTGGGTTTTTACCGGCTACGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGcccc < 2:1440341/149‑1 (MQ=255) ttGTGCCGGCCTCTTCGG‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCTGGAAACGCGTTACCTGGTAGGAGCGGT‑TTTACCCGCGATGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTa < 2:1683869/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGAAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTAc < 2:6640836/150‑1 (MQ=255) tgCCGGCCTCTTGGC‑GGGAAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTTGGTGGGGT‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACaa < 2:4812899/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCCCT‑‑CCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCACGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAAAAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCGTACAagg > 2:4605321/1‑149 (MQ=17) ctggtaggc‑gGGTTTA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAg > 1:2550380/8‑150 (MQ=255) tctTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGa > 1:3516193/1‑150 (MQ=255) tctTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGa > 2:4592040/1‑150 (MQ=255) ttCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGacc > 2:3477773/1‑150 (MQ=255) ggc‑gGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAaga < 2:2820604/139‑1 (MQ=255) gc‑gGGTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATa > 1:6921697/1‑110 (MQ=11) gc‑gGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGAAGGaccacc > 2:5503795/1‑150 (MQ=255) gggTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCg > 1:821631/1‑150 (MQ=21) gggTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTCCACGAGCAGGACCACCCg > 2:4343674/1‑150 (MQ=18) gggTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCa > 1:3627674/1‑140 (MQ=18) gggTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCg > 2:5746308/1‑150 (MQ=21) ggTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGc > 2:1865062/1‑150 (MQ=255) ggTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGc > 1:7281345/1‑150 (MQ=255) gTAAA‑‑CCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGcc > 2:4089125/1‑150 (MQ=21) gTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGcc > 2:5324119/1‑150 (MQ=255) tAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACaa > 1:3897300/1‑132 (MQ=255) acccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGt > 2:3673367/8‑150 (MQ=25) cccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGtt > 2:6506385/1‑150 (MQ=255) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGt < 2:1550870/106‑1 (MQ=18) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGt > 1:1550870/6‑111 (MQ=18) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGt > 1:1550863/6‑111 (MQ=18) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATc < 1:7339799/111‑1 (MQ=18) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATc > 2:7339799/6‑116 (MQ=18) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGtgc > 1:5374058/6‑148 (MQ=25) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 1:1105572/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 1:4466406/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:3351778/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 1:4394509/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 1:6234883/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 1:430710/1‑150 (MQ=255) cG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCg > 1:1781001/1‑150 (MQ=255) tccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAg < 1:5397095/128‑1 (MQ=25) ccTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGat > 1:305046/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGatat > 1:1759749/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGatat > 1:2340511/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATc > 1:1825889/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATc > 2:2481281/1‑150 (MQ=255) ccAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATcc > 1:1355578/1‑150 (MQ=255) gaGGTAACGCGTTGCCTGGTA‑‑AGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCa > 2:2222967/2‑150 (MQ=38) cAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCg > 1:4671232/1‑150 (MQ=255) cAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCg > 2:2889783/1‑150 (MQ=255) cAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCg > 2:3146603/1‑150 (MQ=255) cAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCAGGTTCGATATCCg > 2:5886898/1‑150 (MQ=255) gCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACCAGAGCAGGACCACCCGCCCTGTTCGAGATCCGCaa > 2:6041376/1‑150 (MQ=255) aaCGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAAt > 1:1637747/1‑150 (MQ=255) aaCGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAAt > 2:4664005/1‑150 (MQ=255) cgcgTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAgg < 1:3086937/119‑1 (MQ=255) cgcgTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAgg > 2:3086937/1‑119 (MQ=255) gcgTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATAcc > 2:4840281/1‑150 (MQ=255) cgTTACCTCTCTGGAGGGGT‑TTTCCCCGCTACGGGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATAccc < 1:7071325/150‑1 (MQ=255) tttcccTCGTTGGTGGGGG‑TTTCCCCGCTAATCGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATAcccc < 2:6219223/146‑1 (MQ=255) aaCCTCCTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCa < 2:3628200/149‑1 (MQ=255) cTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGc > 1:3180406/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAaga < 2:2158170/105‑1 (MQ=255) tCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAaga > 1:2158170/1‑105 (MQ=255) tCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGcc > 2:4556559/1‑150 (MQ=255) | CCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAA‑‑CCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGG‑TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCC > NC_002947/5349332‑5349630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |