Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_002947 | 5,451,286 | T→G | 12.5% | L145R (CTG→CGG) | thiE → | thiamine‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,451,286 | 0 | T | G | 12.5% | 595.3 / 11.2 | 292 | L145R (CTG→CGG) | thiE | thiamine‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (142/102); new base G (27/18); total (171/121) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
TCGGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCA > NC_002947/5451139‑5451435 | ggCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGcgc > 1:3946468/1‑148 (MQ=255) ccGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCCGCGAAGGCGCCCGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCgc > 2:7321305/1‑149 (MQ=255) ccGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTTGCCGCTTCTTCTATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGa < 2:7367010/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGa > 2:5067386/1‑150 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAgg < 2:6463556/150‑1 (MQ=255) ggCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCCGGc > 2:371704/1‑150 (MQ=255) gCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGTGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCAGGcc > 1:2057055/1‑150 (MQ=255) gCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCGTTGGCCGCTTCTGCAAGTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGcc > 2:5480637/1‑150 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCcg > 2:6558194/1‑150 (MQ=255) tcagcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGccgacg < 2:5226999/150‑5 (MQ=255) catcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCgcgc > 1:1779044/1‑150 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCCCGccc > 1:5643883/1‑150 (MQ=255) gggCTCCACCTGCCCCGCCAGCCTCGTACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGATGGCGCCTGCTTGGTGGCCTTTGGCGGCTCCTTAATTTCTGTCACCACGCGGGGCGCGCCG‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCa < 1:3544276/149‑1 (MQ=255) cGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTCCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCa > 2:3544276/1‑150 (MQ=255) ggCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAg < 2:4815580/150‑1 (MQ=255) gCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCCGCTACGTGGCCTGTGGCCGCGTCTTCCATTCTGTCCCCCAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGGCGGCCGGCGCGCGCCCGCCCGCGcccccg > 2:4214461/1‑147 (MQ=255) gCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAgg > 2:3247484/1‑150 (MQ=255) cACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGaa > 1:6267433/1‑150 (MQ=255) tGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGGCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCCCGGGAAACTg > 1:4571376/1‑150 (MQ=255) accACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCAGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGc < 2:1792979/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATc < 2:7068324/150‑1 (MQ=255) aGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAAATGCCGATCGcc > 2:3417557/1‑150 (MQ=255) gCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGTGACCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCg < 2:881560/150‑1 (MQ=255) ccTCGAACTGGTCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCGGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGt < 2:4707855/150‑1 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCCCGCCCAGGTGAAACAGCCCGGCGCCGTg > 1:6099373/1‑150 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTg > 1:3075569/1‑150 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGa > 2:2355322/1‑150 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCCGGCCCGCGCCCCGGGGAAACAGCCGATCGCCGGGa > 1:3440800/1‑150 (MQ=255) ttcgcTGGCAGCCTGGGCGGCCAGTGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCCTGAt > 2:4635114/5‑150 (MQ=255) aaCTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTGGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGGAAATGCCGATCGCCGTGAtag > 1:2889923/1‑148 (MQ=255) ggCCGCCCTGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCGGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTgg < 2:1970443/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCCCGGCTGCCCGCGCCGGCGCCCGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGCCACCACGCGGGGCGCGCCC‑GCTGCCACCGGCGGCCGGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTgg < 2:1418884/150‑1 (MQ=255) tcgaatcAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGc > 2:3679572/7‑150 (MQ=255) gccgccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGc > 2:3843190/1‑150 (MQ=255) gccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGGCGGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCCCGGGACACTGCCCAGCGCCGGGAGCGGTGGcctg > 1:3181551/1‑147 (MQ=255) gccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTGCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGCTCGGGGGCCTc > 2:4345264/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGCAACTGCCGATCGCCGGGATCGGTGGCATCAc > 2:2164413/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCAc < 2:1040672/150‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTCCTTCAAGTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTc < 2:6952654/150‑1 (MQ=255) cTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGGGAAACTGCCCCTCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACg > 1:5987132/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGACACCACGCCGGGCGCGCCC‑GCCGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGa < 2:1306677/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCACGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGAGCGCCGTGATAGGTGGCATCACCCACCACAAc > 1:851940/1‑150 (MQ=255) cgtcggCGCCAGCTCGGTGGCCTTTGGCGGATTCTTCACTTGTGCCACAACGCGGGGCGCGCCC‑GCCCCCACCGTCGGCCTGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAAcgc < 1:5201738/146‑1 (MQ=255) 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ggCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCAACATCGGTGGCATAACCCACGACAACCCCCCCCCACAGGGCGCCCa > 1:7316145/1‑150 (MQ=255) ccTTTGGCCTCTTCTTAAATTCTGTCACCACGCCGGGCGCGCCC‑GCGGCCACCGGCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTTGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACg < 1:4211165/150‑1 (MQ=255) cTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATAGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCCACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACgg > 2:2712613/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCCCCCACGTGAAAAAGCCGAAAGCCCTGATAGGTGGCATCACACACGACAAACCCCCCCCCCAGGTCGCCCAccc > 1:4542967/1‑148 (MQ=255) tttGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGgc > 2:661818/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGa > 2:5293369/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCTACAAATCGGTCACCACCCCGGGCGCGCCC‑GCGGCCACCGCCGGCCTGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGa < 1:2344504/150‑1 (MQ=255) cGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGAc > 2:3895275/1‑150 (MQ=255) cGCTTCTTCAATTCTGGCCCCCAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGAc < 2:4157683/150‑1 (MQ=255) cttcttCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGACct > 2:2448685/1‑150 (MQ=255) ttcttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGGGATCGGTGGCCTCACCCTCGACAACGCCCCCCCCCTCGTCGCCCACCGCGccccccgg > 1:4095463/1‑144 (MQ=255) ttcttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctg > 2:6085739/1‑150 (MQ=255) cttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGcc > 2:6199560/1‑142 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGCGCACGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg > 2:253970/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTCGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg > 1:1333280/1‑150 (MQ=255) tacAATTCTCTCACCAACCCGGCCCCGCCC‑GCTCCCAACGCCGCCCTGCACCAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTTATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg < 2:6221165/148‑1 (MQ=255) atttCTGTCACCCAGCGGGGCGCGCCC‑GCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCg < 1:2220342/148‑1 (MQ=255) aaTACTGTCACCACGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCAAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCg < 2:7428421/150‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACCCCGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCACCGGCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCgg < 1:1105265/150‑1 (MQ=255) cTGTCCCCACGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGa < 2:6876790/150‑1 (MQ=255) 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cAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACgg > 2:7270314/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACgg > 1:4309185/1‑150 (MQ=255) cccccGGGCGCGCCC‑GGGGCCACCGGCGGCCGGCCCGCCGCCGCCCGCGCCCCCGTGAAACGGCCGATCGCCGTGATCGGTTGGCTCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGc < 2:5609321/147‑1 (MQ=255) aaGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCCCCCCACAGGTCGCCCACCGCGCCGCCCAGCTGGCGGTGATCCACGGc > 1:6452035/1‑150 (MQ=255) cgCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCACCGGCGGCCTGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCt < 2:4046008/149‑1 (MQ=255) gggCGCGCCC‑GCTGCCCCCGTCGGCCGGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGtt < 1:4647880/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTc > 1:19938/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCG‑GCGCCCCGCGGCGGCCGGCTCGCCCCGCCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg < 1:3807929/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg > 2:2424700/1‑150 (MQ=255) c‑GCTCCCAACGACCGCCTGCTCGACCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGa < 2:162445/150‑1 (MQ=255) ccAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcg > 1:2991338/1‑150 (MQ=255) acAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcg > 1:3688343/2‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 2:3739485/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 2:2036069/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 1:5874504/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAAAGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 1:1676365/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGa < 2:5935459/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 1:5394402/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa > 1:3219161/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTc > 2:3562712/1‑150 (MQ=255) tGCTCGAGCAGGTCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCa > 1:6867119/1‑150 (MQ=255) tGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCa > 2:5703424/1‑150 (MQ=255) | TCGGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCA > NC_002947/5451139‑5451435 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |