Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_002947 | 5,451,295 | A→C | 13.3% | Q148P (CAG→CCG) | thiE → | thiamine‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,451,295 | 0 | A | C | 13.3% | 596.2 / 18.3 | 288 | Q148P (CAG→CCG) | thiE | thiamine‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (155/86); new base C (17/29); total (172/116) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.72e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGCCGC > NC_002947/5451147‑5451443 | aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAgg < 2:2563951/150‑1 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAgg < 2:6463556/150‑1 (MQ=255) cAATCATCGGATACACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTAAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGccc < 1:3105354/150‑1 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCCATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGCGCCGGcccc > 1:3886261/1‑149 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCcg > 2:6558194/1‑150 (MQ=255) gggCTCCACCTGCCCCGCCAGCCTCGTACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGATGGCGCCTGCTTGGTGGCCTTTGGCGGCTCCTTAATTTCTGTCACCACGCGGGGCGCGCCGGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCa < 1:3544276/149‑1 (MQ=255) ggCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAg < 2:6742724/150‑1 (MQ=255) gCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCCGCTACGTGGCCTGTGGCCGCGTCTTCCATTCTGTCCCCCAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGGCGGCCGGCGCGCGCCCGCCCGCGcccccg > 2:4214461/1‑147 (MQ=255) gCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCacg > 1:6367121/1‑148 (MQ=255) cTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCACGCGGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGt < 2:3460042/150‑1 (MQ=255) tCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGcccccgtg > 1:6116676/1‑145 (MQ=255) tGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCACGCCCGCCCCCCGCTGAAACTg > 1:6462433/1‑150 (MQ=255) gCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCCGGTGACACAGc > 1:7226572/1‑150 (MQ=255) gCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTGTGGCCGCTTCTTCCATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGc > 2:2330768/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTCGAACGGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGTGGCCTTGGGCCGCTTCTGCAATTCGGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCGGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCg < 2:3544728/150‑1 (MQ=255) gCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGTGACCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCg < 2:881560/150‑1 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGa > 1:6151795/1‑150 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCCGGCCCGCGCCCCGGGGAAACAGCCGATCGCCGGGa > 1:3440800/1‑150 (MQ=255) ttcgcTGGCAGCCTGGGCGGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGag > 2:2801273/5‑149 (MQ=255) gcTGGCAGCCTGGGCGGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCCGGCCCGCGCCCACGTGAAACAGCCCATCGCCGTGAGCgg > 1:454388/2‑150 (MQ=255) ggCCGCCCCGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTAGGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTgg < 1:1766137/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGACGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTgg < 2:493406/150‑1 (MQ=255) ccgccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCa > 2:1001236/1‑150 (MQ=255) gccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTGCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGCTCGGGGGCCTc > 2:4345264/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGGGATCGGTGGCATCACCCACGa > 1:2977106/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGa > 2:368019/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGGGGCATCACCCGCGACaa > 2:25274/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGGCGGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACGGCCGCTCGCCGGGAGCGGGGGCGTCACCCACgcccac > 1:2069853/1‑145 (MQ=255) aGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGCTCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAAc > 2:6931501/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAAc > 2:7284254/1‑150 (MQ=255) cgtcggCGCCAGCTCGGTGGCCTTTGGCGGATTCTTCACTTGTGCCACAACGCGGGGCGCGCCCGCCCCCACCGTCGGCCTGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAAcgc < 1:5201738/146‑1 (MQ=255) gcgcCCGCTAGGTGGCATTTTGCCGCTACTTCAATTCTGTCACCATGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAAGGTCGGCCTGCTCTAGGCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGccc < 2:6708781/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGAACGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACCCCGccc > 2:3325108/1‑150 (MQ=255) gcCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTATTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCCCCCCCAGGTGAAACTGACGCTCTCCCTGCTCGGTGGCCTCACCCACGACAACGCCCCCCCa > 2:6288599/1‑150 (MQ=255) ttGGACTTTGGCCTATTCTTCTATTCTGTCACCCCGCGGGGGGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTGGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGcc < 2:99207/149‑1 (MQ=255) gTGGCTTTTGGCCGATTCTTCAATTCTGTCACCCAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCCACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGcc < 1:7325089/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCAACACCCTCGACAACGCCGCCCCACTCGTCGcc > 2:3717117/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCGTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGccc < 2:4655953/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCa > 2:1432335/1‑150 (MQ=255) ccTTTGGCCTCTTCTTAAATTCTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCGGCCACCGGCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTTGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACg < 1:4211165/150‑1 (MQ=255) cTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGCCCCGCGCCCAGGTGAAAATGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATAACCCACGACAAAGCCCCCCCACAGGTCGCCCACgg > 1:4458417/1‑150 (MQ=255) tttGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGgc > 2:661818/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGcc > 2:1655819/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATAGGTGGCATCAACCACGACAAAGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGa > 1:2399251/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCACGCCCCCGCCCCCGGGAAACAGCCGAACGCCGGGCTCGGTGGCATCACCCACGACACCCCCCCCCCACAGGGCGCCCACGccgccgc > 1:4595255/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCTACAAATCGGTCACCACCCCGGGCGCGCCCGCGGCCACCGCCGGCCTGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGa < 1:2344504/150‑1 (MQ=255) cGCTTCTTCAATTCTGGCCCCCAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGAc < 2:4157683/150‑1 (MQ=255) tcttctATTCTGTCACCACGCGGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGGTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAATCTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgc < 2:7069927/150‑1 (MQ=255) tcttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCCACGTCGGCCGGCGCCAGCAGGCCCCCGCCCAGGTGAAACTGCCGCTCGCCGGGATCGGTGGCCACACCCACGACAACGCCGCCCCACTGGGCGCCCACGGCGCCGACctgc > 2:608/1‑150 (MQ=255) tcttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgc > 2:4762420/1‑150 (MQ=255) cttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGcc > 2:6199560/1‑142 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg > 2:5622709/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCCAGCCGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCCCCCCACGGGTCGCCCACGGCGCCGACcggcag > 1:1675200/1‑148 (MQ=255) tacAATTCTCTCACCAACCCGGCCCCGCCCGCTCCCAACGCCGCCCTGCACCAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTTATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg < 2:6221165/148‑1 (MQ=255) atttCTGTCACCCAGCGGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCg < 1:2220342/148‑1 (MQ=255) aaTACTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCAAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCg < 2:7428421/150‑1 (MQ=255) cttCTGCCCCCACGCCGGCGCCCCCCGCTGCCCCCGTCGGCCTGCCCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCgg < 1:5697345/149‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACCCCGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGGCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCgg < 1:1105265/150‑1 (MQ=255) ttCTGACACCCCGCGGGGCGCGCCCGCGGCCAACGGCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGt < 1:6651111/150‑1 (MQ=255) gcggTCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCTCCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTg < 2:211332/147‑1 (MQ=255) cTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCAACAATGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGa > 2:2977197/1‑150 (MQ=255) tGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGAt > 2:3635168/1‑150 (MQ=255) gTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCCCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGGGGCATCACCCGCGACAACGCCGCCCCACAGGGCGCCCACCGCGCCGGCCAGCTGGCGGTGATc > 1:371090/1‑150 (MQ=255) 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cccGCTCCAACCGTCGGCCGGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGcc < 2:6983961/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCg > 2:5269697/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCg > 1:5909265/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCAACGTCGCCCTGATCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGa < 2:3875124/150‑1 (MQ=255) tcccAACGTCGCCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAg < 2:2889923/148‑1 (MQ=255) gCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgc > 1:5509611/1‑150 (MQ=255) ccAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcg > 2:1477455/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCGTCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:3912942/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:549050/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 2:2036069/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 2:3739485/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCAGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCa < 2:5366555/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGa < 2:5935459/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 2:1832494/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 1:3072435/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa > 1:3219161/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 1:4074992/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAg > 2:239474/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGc < 1:1493209/86‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCAGGTCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCa > 1:6867119/1‑150 (MQ=255) cTCGACCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAcc < 1:6098993/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGCCCGCGCCCGGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAccc > 1:776032/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg > 1:120154/1‑121 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg < 2:120154/121‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgc > 1:3614894/1‑150 (MQ=255) cgCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgcc < 2:4613768/149‑1 (MQ=255) aGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgcc < 2:5754995/150‑1 (MQ=255) | CAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGCCGC > NC_002947/5451147‑5451443 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |