| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,451,307 | A→C | 6.0% | Q152P (CAG→CCG) | thiE → | thiamine‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,451,307 | 0 | A | C | 6.0% | 914.9 / 8.2 | 292 | Q152P (CAG→CCG) | thiE | thiamine‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (150/117); new base C (22/2); total (173/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.97e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
CGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGCCGCGCCCGCGCCTTC > NC_002947/5451158‑5451455 | ggCTCCCCCTGCCACGCCAGCCTCGACCGGGCCGCCCTGGGTGCCAGCGACGGCGCCAGCTTCGTGGCGTTTGGCCGCTTGTTCACTTCGGTCCCCCCGCCGGGGGCGCCCGGTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAg < 2:6576700/150‑1 (MQ=255) ccACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGa > 2:6892868/1‑150 (MQ=255) ccTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAAc < 2:4893753/150‑1 (MQ=255) cTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCAGGCCCCCGCCCCCGGGAAAca > 1:4613768/1‑149 (MQ=255) accACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCAGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGc < 2:1792979/149‑1 (MQ=255) ccACGCCAGCCTCGAACGGGCCGCCCTGGCGGCCAGCGACGGCGCCAGCTAGGTGGCCTTGGGCCGCTTCTTCACTTGGGTCCCCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGcc < 2:2236324/150‑1 (MQ=255) cAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCCCGGGAAACGGCCGAgcgc > 1:353508/1‑150 (MQ=255) gCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGTGACCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCg < 2:881560/150‑1 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGa > 2:3392600/1‑150 (MQ=255) ttcgcTGGCAGCCTGGGCGGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGag > 2:2999580/5‑149 (MQ=255) ccggCCGCCCCGGCGGCCAGCGACGGCGCCAGCTCCGTGGCCTTCGGCCGCTTCTTCAATTGTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGt < 2:3547916/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGt < 2:2373318/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCCCCGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTCCAATTCTGCCACCACGCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTg < 1:2361253/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCGGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTgg < 2:1970443/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCCCGGCTGCCCGCGCCGGCGCCCGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGCCACCACGCGGGGCGCGCCCGCTGCCACCGGCGGCCGGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTgg < 2:1418884/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCCCGGCTGCCCGCGACGGCGCCCGCTACGTGGCCTTTGGCCGCGCCTACAATTCTGTCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCGGCCACCGCCGGCCCGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTgg < 1:1765985/150‑1 (MQ=255) tcgaatcAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGGCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGTCGGCCAGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGCAACAGCCGATCGCCGGGATCGGTGGc > 2:45846/7‑150 (MQ=255) cgccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCACGTGAAAAAGCCGATCGCCGGGCTCGGTGGCAt > 1:5604871/1‑150 (MQ=255) gccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGGCGGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCCCGGGACACTGCCCAGCGCCGGGAGCGGTGGcctg > 1:3181551/1‑147 (MQ=255) gccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTGCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGCTCGGGGGCCTc > 2:4345264/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCAc < 2:1040672/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCGGCCACCGCCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCt < 2:6226200/150‑1 (MQ=255) gCTGCCCGCGCTGGCGCCTGCTTGGTGGCCTTGGGCCGCTTCTTAAATTCTGCCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCCCCCCCCGGCGGCCGGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTc < 1:2264921/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGGGATCGGTGGCATCACCCACGa > 1:2977106/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGGCGGCCCGCGCCCCCGGGGAACGGCCGCGCGCCGGGAGCGGGGGCGGCACCCCCGa > 1:4564127/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGACACCACGCCGGGCGCGCCCGCCGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGa < 2:1306677/150‑1 (MQ=255) ccAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGCTCGGTGGCCTCACCCTCGACa > 2:4052967/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAAc > 2:7284254/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCACGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGAGCGCCGTGATAGGTGGCATCACCCACCACAAc > 1:851940/1‑150 (MQ=255) cgtcggCGCCAGCTCGGTGGCCTTTGGCGGATTCTTCACTTGTGCCACAACGCGGGGCGCGCCCGCCCCCACCGTCGGCCTGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAAcgc < 1:5201738/146‑1 (MQ=255) cgcCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGcccc > 2:3706405/1‑150 (MQ=255) gcCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCa < 2:3643308/150‑1 (MQ=255) gcCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACCCCGCCCCa > 2:2515050/1‑150 (MQ=255) aGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCGCCCCACTg > 1:6677981/1‑150 (MQ=255) ttGGACTTTGGCCTATTCTTCTATTCTGTCACCCCGCGGGGGGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTGGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGcc < 2:99207/149‑1 (MQ=255) gTGGCTTTTGGCCGATTCTTCAATTCTGTCACCCAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCCACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGcc < 1:7325089/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCCCTGGTCGccc > 2:1458890/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATAGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCCACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACgg > 2:2712613/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGGGCAACAGCCGATCGCCGGGCTCGGGGGCCGCACCCTCGCCCACGCCCCCCCCCAGGTCGccccccg > 1:4542798/1‑146 (MQ=255) ccGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCCCGTGAAACTGCCGATAGCCGTGAACGGTGGCAACACCCACGACAACCCCCCCCCACACGTCGCCCACCGCGCCGa > 1:6430657/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGAcc > 2:6701643/1‑150 (MQ=255) ttcttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGGGATCGGTGGCCTCACCCTCGACAACGCCCCCCCCCTCGTCGCCCACCGCGccccccgg > 1:4095463/1‑144 (MQ=255) ttcttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctg > 2:6085739/1‑150 (MQ=255) tcttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgc > 2:4762420/1‑150 (MQ=255) tcttcAATTATGTCACCCAGGCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCGTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgc < 2:7069247/150‑1 (MQ=255) cttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGcc > 2:6199560/1‑142 (MQ=255) cttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGcc < 1:6199560/142‑1 (MQ=255) cttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgct < 2:3495413/150‑1 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg > 2:5622709/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGCGCAGGCCCCCGCCCAGGGGAAACTGCCGCTCGCCGGGATCGGTGGCATCACCCACGACAACCCCCCCCCACAGGTCGCCCACCGCGCCCACcagcag > 1:3927252/1‑148 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGGTCGAGCAGGCCCCCGGCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCTTCACCCTCGTCACCGCCGCCCCCCGGGGCGCCCACGGCGCCGGCCTGCggg > 1:2642902/1‑150 (MQ=255) aaTACTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCAAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCg < 2:7428421/150‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACCCCGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGGCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCgg < 1:1105265/150‑1 (MQ=255) tCTGTCACCCCGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGCCCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTg < 2:211226/150‑1 (MQ=255) tCTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTg < 2:4158753/150‑1 (MQ=255) cccACGCCGGGCGCGCCCGCGGCCCCCGGCGGCCGGCGCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCCCTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc < 2:2880103/149‑1 (MQ=255) aCCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCCCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc > 1:4951994/1‑150 (MQ=255) aCCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCCTGATCGGTGGCATCACCCCCGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACCGCGCCGCCCTGCTGGCGGTGATCCAc > 1:2036779/1‑150 (MQ=255) ccACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGGCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACg < 1:6132797/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACATCCGATCGCCGTGATCGGTGGCCTCACCCACGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACCGCCCCGACCAGCTGGCGGTGATCCAcc > 1:5772119/1‑149 (MQ=255) ccacccGGCCGCCCCCCCTGCCCCCGTCGGCCGGCTCGCCCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACgg < 1:3436875/146‑1 (MQ=255) cAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACgg > 1:4309185/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCCCGCCGCCAACGCCGGCCTGCGGTAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTc < 2:67109/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCGGCGCCCCGCGGCGGCCGGCTCGCCCCGCCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg < 1:3807929/150‑1 (MQ=255) gcCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGc < 2:2437686/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCAACCGTCGGCCGGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGcc < 2:6983961/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCg > 2:5269697/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCg > 2:2897828/1‑150 (MQ=255) cGCTGCCAACGCCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGa < 2:6972463/150‑1 (MQ=255) cGCTCCCAACGTCGCCCTGATCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGa < 2:3875124/150‑1 (MQ=255) cGCTCCCAACGACCGCCTGCTCGACCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGa < 2:162445/150‑1 (MQ=255) acAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcg > 1:3688343/2‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCGTCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:3912942/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:549050/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 2:3739485/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 1:5874504/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCAGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCa < 2:5366555/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGa < 2:5935459/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 1:3072435/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAg < 2:465089/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGc < 1:1493209/86‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCAGGTCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCa > 1:6867119/1‑150 (MQ=255) cTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAcc > 1:2129306/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAccc > 2:2562357/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg > 1:120154/1‑121 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgc > 1:4773766/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgc > 1:3614894/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgc > 1:6468647/1‑150 (MQ=255) aGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgcc < 2:5754995/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCcgccgc > 1:5362916/1‑150 (MQ=255) gCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcgcc > 1:6033853/1‑150 (MQ=255) gCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcgcc > 2:3194730/1‑150 (MQ=255) cccGCGCCCCGGTGAAACGGCCGCTCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcgccc < 1:1636357/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcgcccg > 1:5068505/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcgcccg > 2:1156925/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcgcccg > 1:2802857/1‑150 (MQ=255) cgcgCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcgcccgc < 2:6367121/150‑1 (MQ=255) gcgcCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcgcccgcg < 1:7280871/150‑1 (MQ=255) gcCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGCcgcgcccgcgcc < 1:3239495/150‑1 (MQ=255) cAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGCCGCGCCCGCGCCTTc < 1:2495674/150‑1 (MQ=255) | CGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGCCGCGCCCGCGCCTTC > NC_002947/5451158‑5451455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |