| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,527,788 | T→A | 5.4% | intergenic (+25/+15) | PP_4856 → / ← yhjG | Dps family ferritin/protein YhjG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,527,788 | 0 | T | A | 5.4% | 930.7 / 29.2 | 279 | intergenic (+25/+15) | PP_4856/yhjG | Dps family ferritin/protein YhjG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (146/115); new base A (6/9); total (154/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
CTACCGCGAGATCATTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGCCCTGCCACCAC > NC_002947/5527640‑5527937 | cTACCGCGAGATCATTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCtt > 2:1371293/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGATCATTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTg < 2:5560512/150‑1 (MQ=255) cgcgAGATCATTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGc < 1:3725508/150‑1 (MQ=255) cgcgAGATCATTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGc < 2:2320505/150‑1 (MQ=255) gaTCATTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGccc > 2:1271684/1‑150 (MQ=255) aTCATTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGcccc < 1:4468533/150‑1 (MQ=255) aTTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCtttt < 2:2811974/139‑1 (MQ=255) aTTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCtttt > 1:2811974/1‑139 (MQ=255) ttCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGc > 1:5072875/1‑150 (MQ=255) ttCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCAAAAGCGGCCCCTTga < 2:2780072/150‑2 (MQ=255) ttCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCAAAAGCGGCCCCTTga < 1:2510559/150‑2 (MQ=255) tCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCAAAAGCGGCCCCTTgag < 1:6484500/150‑3 (MQ=255) aaTACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTAt < 2:3975500/150‑1 (MQ=255) aaTACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCGTCGAAGCCATCCTGGCGCAGGAAGAGGCGCACGCGGACGAGATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCGTGTGCGGCCCCTGGCTAt > 1:3404228/1‑150 (MQ=255) tCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGt < 2:4053883/150‑1 (MQ=255) gggATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCt > 1:5132296/1‑150 (MQ=255) ggATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCtt > 1:933023/1‑150 (MQ=255) ccGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGt > 1:835979/1‑150 (MQ=255) cgacgaCCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCGATTTCCGTGCTTTCAccgcccag < 2:2190257/150‑4 (MQ=255) cccGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGcc > 2:687014/1‑150 (MQ=255) cgtcgtATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCtt < 2:2904496/150‑1 (MQ=255) aTCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTtgcctgc < 1:972750/150‑1 (MQ=255) tCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTtgcctgcc < 2:4405337/150‑1 (MQ=255) cTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTgcctgcct < 1:198915/150‑1 (MQ=255) ttCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCtt > 1:2423216/1‑150 (MQ=255) cGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCa < 2:5601945/150‑1 (MQ=255) cGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCa < 2:376658/150‑1 (MQ=255) gAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCAt > 2:1348992/1‑150 (MQ=255) gAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCAt < 1:4207227/150‑1 (MQ=255) aaGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGgcgc > 1:611727/1‑134 (MQ=255) aGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATct > 2:3497719/1‑150 (MQ=255) caCAGCCCGGCGCCGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATctg < 1:7310227/149‑1 (MQ=255) cATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATctgct < 2:6323449/150‑1 (MQ=255) aTCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATctgctg < 1:4572166/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCtgctgc < 1:4030675/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGcaac < 2:3167373/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATATGCTGcaacaa > 1:702263/1‑150 (MQ=255) cgcAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCaacaac < 1:1857235/150‑1 (MQ=255) gcAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACg < 2:372822/150‑1 (MQ=255) gcAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACg > 2:359656/1‑150 (MQ=255) aGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGgt < 1:2874741/150‑1 (MQ=255) aGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGgt > 2:3425117/1‑150 (MQ=255) gAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGgtgt < 2:589681/150‑1 (MQ=255) gAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGgtgt < 2:660930/150‑1 (MQ=255) gAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGgtgt > 1:1062681/1‑150 (MQ=255) gAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGgtgt > 1:295000/1‑150 (MQ=255) agagGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGc > 2:6182646/1‑150 (MQ=255) gaggagCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCa < 1:6429049/150‑1 (MQ=255) gaggagCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCa < 1:6171401/150‑1 (MQ=255) gagCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTg < 2:4892254/150‑1 (MQ=255) gcgGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCgg > 1:1109364/1‑150 (MQ=255) cgGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCggg < 2:1542964/150‑1 (MQ=255) ggACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGt < 2:2056706/150‑1 (MQ=255) gATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATc > 2:2437856/1‑150 (MQ=255) gATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATc > 1:7155020/1‑150 (MQ=255) tatGTCCGACATGTTGCAAGGCCTATGATTTCAGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATccc > 2:7226983/1‑150 (MQ=255) atGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATcccc < 1:1027148/150‑1 (MQ=255) tGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCg > 1:6554144/1‑150 (MQ=255) gTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCtttt < 2:5109310/53‑1 (MQ=255) gTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCgc > 1:2265513/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGctgctg < 2:4253193/150‑1 (MQ=255) aaGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATc > 2:4521805/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAg > 1:1631965/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAgc < 2:2245246/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAgc < 2:900020/150‑1 (MQ=255) tttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCCATCAGCGcc > 1:5266369/1‑150 (MQ=255) tttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGcc > 2:4639057/1‑150 (MQ=255) tttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGcc > 1:6682235/1‑150 (MQ=255) tttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGcc > 2:6412443/1‑150 (MQ=255) tttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGcc > 1:7009727/1‑150 (MQ=255) tttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGcc > 1:5428149/1‑150 (MQ=255) tttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGcc > 1:3436801/1‑150 (MQ=255) tttGATTTCTGACACACTCAAGGGGCCGCTTTTTCGGCCCCTTGCTATTTCCGTTCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATACCCGCAGCTGGGCGCAATCAGCGcc > 2:6255132/1‑150 (MQ=255) ttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGTGCGCAATCAGCGCCa < 1:4349624/150‑1 (MQ=255) ttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCa > 2:7272326/1‑150 (MQ=255) ttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCa < 2:3884252/150‑1 (MQ=255) ttGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCCTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCa > 1:4281739/1‑150 (MQ=255) aTTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCa > 2:6982176/1‑150 (MQ=255) tttCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCCGCGCCAGCac > 1:2093785/1‑149 (MQ=255) tttCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCaa > 1:3692514/1‑150 (MQ=255) tttCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCaa > 2:5795810/1‑150 (MQ=255) ttCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAAc < 2:1737420/150‑1 (MQ=255) ttCGGACCCCCTCAAGGGGCCGCGTGTGCGGCCCCGTGCTAGGTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCCTCTGCTGCAACACCGGTGTGCCCTGGGTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAAc < 2:3404228/150‑1 (MQ=255) tGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAAcccc > 1:3159837/1‑150 (MQ=255) acacCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTc < 1:1319010/76‑1 (MQ=255) acacCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCATGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGCTGTGCACAGGTTCGGGTCAACCCCGCAGCAGGGCGCAATCACCGCCCGCAAaccccc > 1:2639032/1‑148 (MQ=255) acacCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGATATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCccgc < 1:6344896/150‑1 (MQ=255) acCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCGTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACAGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACccccccc > 1:3094687/1‑149 (MQ=255) cTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCccgccgccg > 2:1968321/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCccgccgccg > 1:1528050/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCccgccgccg > 2:4784667/1‑150 (MQ=255) aaGGGGCCGCAAAAGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCa > 2:6081973/1‑132 (MQ=255) aaGGGGCCGCAAAAGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCa < 1:6081973/132‑1 (MQ=255) aGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGccc > 1:4843310/1‑150 (MQ=255) ggggCCGCTTTTGCGGCCCCTCGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGCCCt > 2:831984/1‑150 (MQ=255) gCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGCCCAGcc > 1:3150366/1‑150 (MQ=255) cGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGCCCTGccac > 2:5471222/1‑150 (MQ=255) ttttGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGCCCTGCcaccac > 1:4675389/1‑150 (MQ=255) ttttGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGCCCTGCcaccac < 1:561254/150‑1 (MQ=255) ttttGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGCCCTGCcaccac > 1:3834955/1‑150 (MQ=255) | CTACCGCGAGATCATTCAATACATCGGGGATAAAGACCCGACTACCCGTCGTATCTTCGAAGACATCCTGGCGCAGGAAGAGGAGCACGCGGACGATATGTCCGACCTGTTGCAAGGCCTTTGATTTCTGACACCCTCAAGGGGCCGCTTTTGCGGCCCCTTGCTATTTCCGTGCTTTCACCGCCGTCGGCGCCTTGCCTGCCTTCATCTGCTGCAACAACGGTGTGCACTGGTTCGGGTCATCCCCGCTGCTGGGCGCAATCAGCGCCAGCAACCCCGCCGCCGGCCCTGCCACCAC > NC_002947/5527640‑5527937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |