Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,542,066 | C→T | 14.9% | intergenic (+46/+57) | nadE → / ← PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,542,066 | 0 | C | T | 14.9% | 361.1 / 48.7 | 148 | intergenic (+46/+57) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/68); new base T (7/14); total (66/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.83e-01 |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
ATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGT > NC_002947/5541917‑5542215 | aTGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAAc < 2:5549213/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAAc < 1:3564079/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAAc < 1:3205221/150‑1 (MQ=255) cTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCCCGACAACCAGGGTGAACCCAc > 2:4619169/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAAGAGGGTGAAcccccc > 2:1476290/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTGGCCCGCGCCTAGGTGGGGGGACCCAcc > 1:4162532/1‑150 (MQ=255) tCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTGACCCGCCAAAAACGGGGTGGACCCCCCg > 2:2566368/1‑150 (MQ=255) gggCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTc < 2:7021840/150‑1 (MQ=255) gggCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACCCaatg > 2:1571746/1‑147 (MQ=255) cAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTcgcg < 2:5678685/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTCCCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:4038140/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:1717864/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:2294925/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:522313/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:5334277/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:5334414/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:542946/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:4370029/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:5512352/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:4956411/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATACGCgg < 2:1662057/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCggg < 2:6491413/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGt < 2:4528426/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGt < 2:7233694/150‑1 (MQ=255) gTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:4270111/145‑1 (MQ=255) gTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg > 1:4270111/1‑145 (MQ=255) gTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGaa > 2:4648403/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCCACGCATTCGCGGGTGAACCCg > 2:488346/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACCAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAACCGCTcc > 2:2374291/1‑150 (MQ=255) gCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCt < 2:6059133/150‑1 (MQ=255) gTTCGACACCATCGCCGCCACCCCCCGAACCACCCAGCACACGCGCGAACTGCGGTTCGCTCCTTTTTACGGGGCCTGCTGGAGGGGTTTCACCCGCTAATACTAGGTTGAACCCACCGACGAATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAgg < 2:4436251/150‑1 (MQ=255) cacacCATCGCCGCCACCAACCGCACGACCCAGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGCCGCGGGTTCACCCGCTAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCATCGGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTc < 2:1645715/149‑1 (MQ=255) catcatCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCGCGAATACGAGGGTGGACCCACCGACGCAATCGCGGGTGAACCCCCGCCGGCCggggtggc > 2:5256925/1‑145 (MQ=255) tcatcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTGACCCGCGCATAAGAGGGTGGACCCCCCCACGCCTTGGCGGGTGTAACCGCGCCGGCAggggtgggcg > 1:4546799/1‑143 (MQ=255) cagcggcgCCACCTCCCCCACGCCCCCGCCCCCGCGCGACCGGCCGTGCGCTCCTTGATATGGGGCCTGCAGGAGGGGGTGCACCCGCTAAGACGCGGGGGACCCCACCGCCGCATGCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGt < 2:5119424/144‑1 (MQ=255) tggtcgCCACCTACCCCACGACCCCCCACACGCGCTACGTGCGGTTGGCTCCTTTTTATGGGGCCTGCCGGCGGGGGTTCCCCGGCGAATCCGCGGGTCAACCCCCCGCCGCTTGGGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCa < 2:123181/148‑1 (MQ=255) tcgtcgCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGCGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCa > 2:3214287/1‑150 (MQ=255) gtcgCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCCCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg > 2:254552/1‑118 (MQ=18) gCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:5087222/115‑1 (MQ=18) gCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg > 1:5087222/1‑115 (MQ=18) ccACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCGTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCGCGCAAACGAGGGGGGACCCCCCCCCGCAATCGCGGGTGGACCCCCTCCGGGAGGGGTCGCCGGCAGCCatt > 2:3985134/1‑150 (MQ=255) cTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg > 1:3117100/1‑110 (MQ=255) cTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:3117100/110‑1 (MQ=255) tACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:3980811/109‑1 (MQ=17) tACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg > 1:3980811/1‑109 (MQ=17) tACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTGACCCCCCAAAACGAGGGTTTACCCACCGCCCCAGTCGCGGGGGTACCCCCGCCAGCCGGGGTGGCCGGCCGCCGTTGGTTa > 2:346898/1‑150 (MQ=255) cccgccccACCACACGCGCGAAGGGCGGTTCGCTCCTTTATACGGGCCGGGCAGGCGCGGTTCCACCCGCGAATCGGCGGGTGAACCCACCGCCGCATTCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGa < 2:822107/145‑1 (MQ=255) cAAGACCCTGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGATCCTTGATACGGGGCCTGCTGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACTTGGGTTAACCCACCTACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGa < 2:2345496/150‑1 (MQ=38) caAGCGCGAACGGCCGTTCGCTCCTTTATATGTGGCCTGCAGGAGGGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTTAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGc < 2:6366829/150‑1 (MQ=38) gcccccaCTGCCGTTCCCTCATTTATATGGGGCCGGCTGGAGCGGTTCCACCCGCCAATACGCGGGTGACCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCtt < 1:1129412/144‑1 (MQ=25) gcgAACTGCCTTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCTGGAGGGGGTTCACCCGCGAATACGTGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtc < 1:7347620/150‑1 (MQ=255) gcgAACTGCCGTTCGCTCCTTTATATGTGGCCTGCTGGAGCGGGTTCACCCGCTAATACGCGGGTTAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtc < 2:3393853/150‑1 (MQ=39) cgAACTGCCGTTCGCTCCTTGATACGGGGCCGGCAGGAGCGGGTCCACCCGCGAATACGTGGGTGACCCCACCGCCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtca < 2:2259685/150‑1 (MQ=37) gCCGTTCGCTCCTTGACACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTACACCCGCGACTCCGAGGGTGAACCCACCGCCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCATTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCg < 2:4270051/150‑1 (MQ=38) ccGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTAACCCCCCAAAAAGATGGTTAAACCAACCACGCAATAGCGGGTGAACCCCCACCGGCAGGGTTCGCCGGCACCCATTTATTAAATTAAGATGAACATTCCATTAATCATAga > 2:3495908/1‑150 (MQ=255) cGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCTAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCATGCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCgag < 2:2269096/150‑1 (MQ=255) ggATAAGTGGCCGGCAGTAGCGGGGTCAGCCGCTATTACTAGGGTGAACCCACCGAGGCATGGGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGGCTTTGATTAGTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCTTCGAGATGTGGCCCgg < 2:4759394/149‑1 (MQ=255) ccggggCCTGCTGGCGCGGGTTCACCCGGTAATCCGGGGGGGACCCCCCGGCCGCATTGGGGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAg < 1:4913335/146‑1 (MQ=255) cggggccggccGGCGCGGGTTCCCCCGCGAATCCGCGGGTGCCCCCACCGACGCCGGCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAgg < 2:4678995/147‑1 (MQ=255) cgccgccggccgGCGCGGGGCCCCCCGCGACTCCGCGGGTGCACCCACCGCCGCAGGCGCGGGGGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCCTCATCGAGAGGTGGCCCGGGAAgg < 2:5724388/146‑1 (MQ=255) gCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCAt < 1:6299842/52‑1 (MQ=255) ggcgggggTTCACCCGCTAATACGTGGTTTACCCCACCGACGCATTCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGaagaag < 1:2305563/145‑1 (MQ=255) gcgggggTCCCCCCGCGAATACGCGGGTGACCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGc < 2:3762592/146‑1 (MQ=39) gAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCCACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCGTTGATTACTTGTCGATGACCTTGCCTTTCATCATAGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGc > 2:2757502/1‑150 (MQ=255) tgggggTTCACCCGCTAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCt < 1:2391734/147‑1 (MQ=255) aGCGGGTACACCCCCCAAAACGCGGTACAACCCACCTACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCt < 2:7039242/150‑1 (MQ=255) gggggTTCACCCGCGAATCCGCGGGTGACCCCACCGACGCATGCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTg < 1:6756091/148‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTg < 2:5164822/150‑1 (MQ=255) gCGGGTACACCCGCGAATACGAGGGTCAACCCACCGACGAATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTg < 2:1835592/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 2:929464/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 1:2127910/1‑150 (MQ=255) ttCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTc < 1:5450829/150‑1 (MQ=255) aCCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGaagaag > 1:1102443/1‑139 (MQ=21) aCCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcacc > 2:1435426/1‑150 (MQ=25) aCCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcacc > 2:6134975/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCa < 1:5174832/55‑1 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAggc < 1:7184210/58‑2 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAggc > 2:7184210/1‑57 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCCTCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:1085133/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTa > 2:3141033/1‑142 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:7329282/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:1824776/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:7050781/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:3566633/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCATTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:3350257/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGACTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:2428556/1‑150 (MQ=255) gctaaTCCGTGGGTGCCCCCCCCGCCGCATGGGCGGGGGCACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCg < 1:3812529/147‑1 (MQ=255) gcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCg > 1:6424253/1‑150 (MQ=255) aTACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCtt < 2:5568306/150‑1 (MQ=255) tACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCCTCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc < 2:6897519/150‑1 (MQ=255) gcgggTGAACCCACCTACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAg < 2:3717102/148‑1 (MQ=255) gAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAg > 1:5508061/1‑150 (MQ=255) gAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAg > 2:4144575/1‑150 (MQ=255) ggtgccccccccGCCGCATGCGGGGGTCAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCtt < 1:1571746/144‑1 (MQ=255) ggTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCtt < 2:5968311/150‑1 (MQ=255) ggTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCtt > 2:1336504/1‑150 (MQ=255) ggaccccacccaCGCATCCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTgg < 1:2761148/146‑1 (MQ=255) aaCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGaa < 2:4162532/150‑1 (MQ=255) aaCCCACCCACGCATTCGCGGTTTACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGaa < 1:1476290/150‑1 (MQ=255) cccACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGATGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgt > 2:844128/1‑150 (MQ=255) | ATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGT > NC_002947/5541917‑5542215 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |