Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,639,457 | T→G | 5.1% | intergenic (+33/+350) | putA → / ← PP_5718 | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase/membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,639,457 | 0 | T | G | 5.1% | 1160.5 / 36.3 | 334 | intergenic (+33/+350) | putA/PP_5718 | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase/membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (156/161); new base G (7/10); total (163/171) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.22e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.22e-01 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
CACGGGCTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTT > NC_002947/5639308‑5639606 | aCGGGCTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTc > 2:7429211/1‑150 (MQ=255) cTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGctc < 1:1049932/150‑1 (MQ=255) cTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGctc < 1:1255707/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCGAGGCtctc < 1:1140602/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCGAGGCTCTcc < 2:1189665/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCt < 2:4836661/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCtt > 1:1402224/1‑150 (MQ=255) cAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCtt > 2:3189415/1‑150 (MQ=255) cAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCGAGGCTCTCCtt < 2:3461115/150‑1 (MQ=255) aGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAACGAGAGCCTCGGCTCTCCttt < 2:2473538/150‑1 (MQ=255) gCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCtttt > 1:4287049/1‑150 (MQ=255) gCGGGGATCACCAGATTGCGCGGGAGCGCCTGGACATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCtttt < 2:5892039/150‑1 (MQ=255) cGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCttttt < 1:241158/150‑1 (MQ=255) ggggATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCcttcttc < 2:6036943/150‑2 (MQ=255) gggATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTa < 1:1278007/150‑1 (MQ=255) ggATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTAt > 1:4046121/1‑150 (MQ=255) ggATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTAt < 1:6699691/150‑1 (MQ=255) aCCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTg > 2:4301532/1‑150 (MQ=255) aCCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTg < 1:1753619/150‑1 (MQ=255) aCCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTg > 2:1214931/1‑150 (MQ=255) cAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCa > 2:1430420/1‑150 (MQ=255) cAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCa > 2:2155628/1‑150 (MQ=255) cAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCa > 2:6504415/1‑150 (MQ=255) gATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATg > 2:7310254/1‑150 (MQ=255) tGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTcc < 2:4541002/150‑1 (MQ=255) gcTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAAAAGGAGAGCCGAGGCTCTCcttcttcttcaa > 1:4238918/1‑132 (MQ=39) ggAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGc < 2:3529396/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTTGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAgg < 1:27605/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAgg < 2:6735701/150‑1 (MQ=255) gcCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAgggg < 2:5266371/150‑1 (MQ=255) cTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCt > 1:6210084/1‑150 (MQ=255) ggTCATCGCGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTgg < 2:3021938/150‑1 (MQ=255) gTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGa > 1:5683211/1‑150 (MQ=255) aTCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTa > 2:5130303/1‑150 (MQ=255) aGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAg < 1:5050337/150‑1 (MQ=255) aGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAg < 1:3959496/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGt < 1:2657620/150‑1 (MQ=255) gAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCa > 1:3908775/1‑150 (MQ=255) gCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGa > 1:438711/1‑150 (MQ=255) cGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCACACCa < 2:2589535/147‑1 (MQ=255) cGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCACACCa > 1:2589535/1‑147 (MQ=255) gTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAAc > 1:6616012/1‑150 (MQ=255) tGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACa < 2:2348474/134‑1 (MQ=255) tGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACg < 2:1048526/150‑1 (MQ=255) aaCACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTg < 1:3566594/150‑1 (MQ=255) acacTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTgg < 1:4071938/150‑1 (MQ=255) cacTGAAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGt < 1:999831/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCAt > 2:7393792/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCAt < 1:5148276/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATg < 1:6308561/150‑1 (MQ=255) gtggtAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGa < 1:7072185/150‑1 (MQ=255) gtAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACtt < 1:3392145/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTgg > 1:4803704/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTgg > 1:4214158/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTgg < 1:6791339/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGgtg > 2:1415261/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGgtg > 2:4444162/1‑150 (MQ=255) gatgaCCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAGGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCtgt < 1:3552877/150‑1 (MQ=255) gatgaCCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAg > 1:4531418/1‑101 (MQ=255) atgaCCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCtgtt < 1:1900685/150‑1 (MQ=255) atgaCCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCtgtt < 2:1470784/150‑1 (MQ=255) atgaCCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCtgtt < 2:1684570/150‑1 (MQ=255) tgaCCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCtgttg > 2:5392041/1‑150 (MQ=255) gaCCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCtgtt < 1:227161/148‑1 (MQ=255) cATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGTCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCATCTGTTGTTAc > 2:7117726/1‑150 (MQ=255) cATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAAAGTg < 2:2832195/112‑1 (MQ=255) ttGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCg < 2:5426097/150‑1 (MQ=255) tGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGt < 2:4046121/150‑1 (MQ=255) tAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTAt > 2:2010650/1‑150 (MQ=255) gCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTAt < 2:6867209/145‑1 (MQ=255) cTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTg < 1:5551711/150‑1 (MQ=255) tGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTgg > 2:6904722/1‑150 (MQ=255) gttgttGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTGTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAAta > 1:5008227/1‑149 (MQ=255) ttgttgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATtc > 1:3154089/1‑150 (MQ=255) tgttgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATtct < 1:5434356/150‑1 (MQ=255) gttgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATtctc < 1:2075606/150‑1 (MQ=255) gttgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATtctc < 1:6921876/150‑1 (MQ=255) gttgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATtctc < 1:7429211/150‑1 (MQ=255) ttgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCg < 1:7246380/150‑1 (MQ=255) ttgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCg < 2:4125875/150‑1 (MQ=255) tgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCgg > 2:3708268/1‑150 (MQ=255) tgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCgg > 2:1832254/1‑150 (MQ=255) tgAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCgg < 2:2868547/150‑1 (MQ=255) gaagaagaaGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGc > 1:3331237/1‑150 (MQ=255) agaagaagGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTg > 2:5779027/1‑150 (MQ=255) agaagaagGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTg > 1:2144908/1‑150 (MQ=255) gaagaagGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGc > 2:2258180/1‑150 (MQ=255) aagaagGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGcc > 2:6945483/1‑150 (MQ=255) aagaagGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCAAGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGGTACCGTTTATCCCCTGGACATTCTCGGCTGcc > 2:6325265/1‑150 (MQ=255) gaagGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTg > 1:952117/1‑150 (MQ=255) gaagGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGGTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTg > 1:2006692/1‑150 (MQ=255) aagGAGAGCCGAGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTgg > 1:3697550/1‑150 (MQ=255) ggAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGt < 2:5590495/80‑1 (MQ=255) ggAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGc > 2:2968198/1‑150 (MQ=255) gagaGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACCGGGGCACACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGAGACTTGGGTGTCTTCTGTGGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGCCTGCCTGGGcc > 2:4233783/1‑150 (MQ=255) gagaGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGcc > 1:1068230/1‑150 (MQ=255) agagCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCg > 2:335176/1‑150 (MQ=255) gCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCCCCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTc < 2:4269087/150‑1 (MQ=255) tCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCtt > 1:5929414/1‑150 (MQ=255) tCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCtt < 1:292529/150‑1 (MQ=255) | CACGGGCTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTT > NC_002947/5639308‑5639606 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |