Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,653,983 | T→C | 5.5% | Q28R (CAG→CGG) ‡ | ygjP ← | metal‑dependent hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,653,983 | 0 | T | C | 5.5% | 1063.3 / 30.8 | 329 | Q28R (CAG→CGG) ‡ | ygjP | metal‑dependent hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (160/150); new base C (13/5); total (173/156) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.61e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.85e-01 |
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
GTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCGGATAAGCC > NC_002947/5653835‑5654132 | ttGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCa < 1:5851516/150‑1 (MQ=255) gcgcACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGt > 1:1845366/1‑150 (MQ=255) aCTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCAGGCGCAGGTGCgg < 2:2373184/150‑1 (MQ=255) tCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCggggg < 2:3337910/150‑1 (MQ=255) tCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCggggg < 2:6424836/150‑1 (MQ=255) gCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGt > 1:4890923/1‑150 (MQ=255) tACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCt > 2:558592/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCAACCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCaa > 2:6851168/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCAAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGt < 1:6599127/150‑1 (MQ=255) gcAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAAc > 2:1494432/1‑150 (MQ=255) gcAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCGTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAAc < 2:2508314/150‑1 (MQ=255) aGATCCGGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGTTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAgctcaag < 2:4985429/150‑7 (MQ=255) cTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTAc > 1:3628461/1‑150 (MQ=255) cTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTAc > 1:3702984/1‑150 (MQ=255) tGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACAGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACg < 1:5203697/150‑1 (MQ=255) gtcATAGCCATACACCGGCTTGTCGCTTTTCAGGTCATGGCGGTGATGGTAACGTCGCTGCAGGTATTCTCCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACGTGCGCGTTCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGGAGTACGGt < 2:4672789/148‑1 (MQ=255) ggCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGt < 1:2203366/150‑1 (MQ=255) aTAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCAt < 2:1679829/150‑1 (MQ=255) tAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTAGTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATg < 2:3200476/150‑1 (MQ=255) aGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGc < 1:2894598/128‑1 (MQ=255) ccATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGgcg > 1:1241110/1‑150 (MQ=255) aTACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCtt > 1:4708889/1‑122 (MQ=255) aTACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCtt < 2:4708889/122‑1 (MQ=255) aTACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCt > 2:4267146/1‑150 (MQ=255) aCAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGTTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGt < 1:6410809/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTa > 1:4541777/1‑150 (MQ=255) cgcCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTc > 2:4478895/1‑150 (MQ=255) gcCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCg > 2:2006437/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCg > 1:1341112/1‑150 (MQ=255) gTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGGAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTa > 1:1484953/1‑150 (MQ=255) cGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAAc < 2:6102344/150‑1 (MQ=255) cTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGa > 2:76330/1‑150 (MQ=255) tttGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGaa < 2:1371908/150‑1 (MQ=255) cACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGcc > 2:6992113/1‑150 (MQ=255) cGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGa < 2:5402775/150‑1 (MQ=255) tCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGAtt < 2:397503/150‑1 (MQ=255) tCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGAtt < 2:1778149/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCt > 2:6800411/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTa < 1:6018952/150‑1 (MQ=255) gCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCCGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGc < 1:2469773/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACTTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCa < 2:124517/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCa < 2:5516281/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCaa > 1:3472807/1‑150 (MQ=255) gTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCaa < 1:3366985/150‑1 (MQ=255) cAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATc < 2:1124572/150‑1 (MQ=255) aGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCa < 2:2939418/150‑1 (MQ=255) ggTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACg > 2:2174257/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTg > 2:5870930/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCa < 1:6252640/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGTAGTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCa < 2:6497292/150‑1 (MQ=255) gCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAgg < 2:378747/150‑1 (MQ=255) cAGGTATTCACCCTGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCGGCTGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGga < 1:40881/150‑1 (MQ=255) cAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGga < 1:2367243/150‑1 (MQ=255) aGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGgag > 1:3497160/1‑150 (MQ=255) ggTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGgaga < 1:3106185/150‑1 (MQ=255) ggTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGgaga > 1:7382575/1‑150 (MQ=255) cgTATTCACCCAGGCGGTCGCTGACGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGCTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGgaga < 2:6384073/149‑1 (MQ=255) tATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGaaa > 1:4293203/1‑150 (MQ=255) aTTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGaaaa > 2:4624456/1‑150 (MQ=255) 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ccAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCg > 1:5744091/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCg < 1:1964124/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGCGCTGTCGATCCTCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGGCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGCGAAACTTGCCggg > 2:2442/1‑150 (MQ=255) ggTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCggg < 2:2696038/44‑1 (MQ=255) gTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGcc < 2:7200020/150‑1 (MQ=255) cGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGc < 2:339677/150‑1 (MQ=255) tGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAg < 2:3591777/150‑1 (MQ=255) tGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAg > 2:1309572/1‑150 (MQ=255) gTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAAt > 2:5440320/1‑109 (MQ=255) gTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGc < 2:7356751/150‑1 (MQ=255) gTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGc < 2:4890923/150‑1 (MQ=255) tCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCg > 1:1059286/1‑150 (MQ=255) tCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCg < 1:6678773/150‑1 (MQ=255) gATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTc > 1:566242/1‑150 (MQ=255) atcatcTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCa > 2:5197257/1‑150 (MQ=255) tcatcTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCTAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAg > 1:7431955/1‑150 (MQ=255) atcTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTc > 2:3658663/1‑150 (MQ=255) tcTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTcg > 1:5295714/1‑150 (MQ=255) cccccGCACCTGCAGGCGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCGAGCGTCAGTcgc > 1:2762977/4‑150 (MQ=255) tGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTcgcg < 2:6649478/150‑1 (MQ=255) tGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTcgcg > 2:5758613/1‑150 (MQ=255) ccccGCACCTGCAGGCGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTcgcg > 1:5425156/3‑150 (MQ=255) cccGCACCTGCAGGCGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCgg > 1:352676/2‑150 (MQ=255) cccGCACCTGCAGGCGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCgg > 1:5577151/2‑150 (MQ=255) cccGCACCTGCAGGCGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCgg > 2:6932758/2‑150 (MQ=255) ccGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTa > 2:191990/1‑136 (MQ=255) gCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCa > 1:719263/1‑150 (MQ=255) aCCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATc < 2:5261486/150‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATc < 1:2671433/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCgg > 2:5096592/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCGGAt > 2:4369372/1‑150 (MQ=255) cgcCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGTTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCGGATa < 2:6253931/150‑1 (MQ=255) cgcCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCGGATa > 2:1965549/1‑150 (MQ=255) gcCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCGGATaa < 1:1623070/150‑1 (MQ=255) gcCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCGGATaa > 2:2125102/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCGGATAAGc > 1:3791374/1‑150 (MQ=255) | GTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACAGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAAGTAACGTAGTACGGTCATGGCGCTGTATTCGGCGTAACGAATGCCGATTCTAGCCAATCACGGCCCTGGCCAGGAGAAAATTGCCGGGAAGCCGCTAGCGTCAGTCGCGGTCATCGGATAAGCC > NC_002947/5653835‑5654132 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |