| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,703,797 | G→A | 5.6% | intergenic (+82/‑85) | hslU → / → PP_5002 | protease HslVU ATPase subunit/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,703,797 | 0 | G | A | 5.6% | 509.7 / 13.6 | 159 | intergenic (+82/‑85) | hslU/PP_5002 | protease HslVU ATPase subunit/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (75/75); new base A (2/7); total (77/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GGCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCACCTACGC > NC_002947/5703649‑5703946 | ggCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGGCAGCCCCCTCCAGCACGCGCCCCCACAACCCGGGGGCCGGGGGGGATCCGGGCGGGGg < 2:7272367‑M2/150‑2 (MQ=255) cGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcg > 1:5771900‑M2/1‑147 (MQ=255) gTATGTGAACAGCCTCCTGGGTGATCTGGCACAGAAAGAAGACCTTTCTCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGGGGGCAAGCCCGCTGCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgg > 1:1865250‑M2/1‑146 (MQ=255) gTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgg > 1:6977949‑M2/1‑146 (MQ=255) gTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgg > 2:4282851‑M2/1‑146 (MQ=255) gTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgg > 1:6978024‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggc > 2:3337711‑M2/1‑144 (MQ=255) gtgAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggctt > 1:2747718‑M2/1‑142 (MQ=255) tgAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGCAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttg > 2:1813155‑M2/1‑141 (MQ=255) gAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggc > 2:2077668‑M2/1‑140 (MQ=255) aaCAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcc > 1:950000‑M2/1‑139 (MQ=255) aCAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGGCAGCCCCCCCCCCGACCCCCCCCCCCAAACCCAGGGGCCGGGGTGTTCCGTGgggggggggggcgggcc > 1:1635350/1‑143 (MQ=255) ccACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCCAGCCCCCACCTGCACCCGCCCCCACAACCCATGGGCCGGTGGTGTTACGGGCGGGGgcgggctggcccccgc < 2:7211525‑M2/150‑17 (MQ=255) ccACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCAGCACCCGCCACCCCAACCCGTGGGCCCGGGGTGCTCCCTGCGGGGgcgggcgtgcccgcca < 2:6118910‑M2/150‑17 (MQ=255) cACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaa > 2:4488519‑M2/1‑133 (MQ=255) ccTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCCAGCCCGCACCAGCACCCGCCACCCCAAACCTTGGGCCGGGGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcggaga < 2:3079328‑M2/150‑20 (MQ=255) gggTGAGCTGGCACAGAACGACGACCTGTCGCGTTACTTTCTGTAAGACCGGTTTCGACTGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACACCCCTGGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGc < 2:1612306/150‑1 (MQ=255) tGGAACAGAACGAAGACCTGTCGCTTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCGGGTGGTGATCCGGGGGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAAt < 1:3566255/150‑1 (MQ=255) aGACCGAAGCCCTGTCGGTTTACATTCTGTAAGACGGGTTTCGACTGTTTGGCGGGCACGCCCGCTCCTGCAGGCGCCACCCCACCCGTGGGGCCTGTGGTGACCGGGGGGGGGGGGGGCTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAAtccctcc < 1:5397642/150‑1 (MQ=255) aaCGAAGACGTGTCGCGTTACATGCTGTATGACGGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTcccc < 2:5323958/150‑1 (MQ=255) aaCGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCCCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggc < 2:1034303‑M2/118‑7 (MQ=255) aaCGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCCCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggc > 1:1034303‑M2/1‑112 (MQ=255) aCGAAGACCTGTCGCGTTACTTTGTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGTTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTccccc < 2:5051372/150‑1 (MQ=255) aCGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACACCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTccccc < 2:7353559/150‑1 (MQ=255) gctgACCTGTCGGGTTACTTTCTGTAAGACCGGTTTCGACTGTTTCGGGGGCATGCCGGCTCCTGCAGGCGCCACCACAACCGTTGGGCCTGTGGTGATCGGTGGGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCAt < 2:457966/147‑1 (MQ=255) ccTGTCGCTTTACATTGTTTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGGGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCGTGTGGTGATCGGTGGGGGGGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCt < 1:539790/150‑1 (MQ=255) cTGTGGCTTTAAATTCTGTAAGACGGGTTCCGACTTTTTCGGGGGAAAGCCCGCTCCGGCCCGCGCCACCAAAACCGTTGGGCGTGTGGTGCGCCGTGGGGGGGGGGGGTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTg < 1:1412977/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGTTTACATTCTGTAAGACGGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCGGTGGGGGGGGGGGGTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTg < 2:839776/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTTTACATTCTGAAAGACCGGTTTCGACAGTTACGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTgg < 2:3928980/150‑1 (MQ=255) tCGCGTTACTGTGTGTACGACGGTTTTCGACTGTTTCGGGGGCAAGCCGGCGCCTGCCCGCCCCACCCCAACGCTTGGGCCGGGGGTGAGCGGGGGGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGaa < 1:6646131/150‑1 (MQ=255) tCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGaa < 2:3837238/150‑1 (MQ=255) gTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACTGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCtg < 2:4575929/150‑1 (MQ=255) ttACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCtgt < 2:1658028/150‑1 (MQ=255) aCATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACACCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGc < 2:4927775/150‑1 (MQ=255) ttttAAGACGGTTTTCGACTTTTTCGGGGGCAAGCCCGCCCCGGCCCGCGCCCCCCCAACCGTGGGGCGGGGGGTGCTCGGGGGGGGGGGGGGGTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTtcat < 1:5118704/147‑1 (MQ=255) tttAAGCCCGGTTTCGACTGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTCCACGCGCCCCCACAACCCTGGGGCCGGGGGTGATCGGTGGGGGGGGGGGCTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTtcatc < 1:5041593/148‑1 (MQ=255) tGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACACCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTtcatc < 2:6736409/150‑1 (MQ=255) gTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGGGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTtcatca < 2:5054525/150‑1 (MQ=255) gACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGGAACCCCCCGCCAGCCACCCCCCCCCCAACCCGGTGGCCGGGGGGGGTCCCTGGGGGGGGGGGGGTGCCCGCGCAGAGGCCCGTGAAACACGCCCCCCGAAGCTGGGAGCGGTGGGTCATGAGcga > 2:2290343/1‑148 (MQ=255) ccGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTccc < 2:4738664/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCCCGCCAGCACCCGCCACCACCAACCTTTGGCCGGTGGTGATACCGGCCGGGGCGGGCGTGCCCCCCCACAGGCCCATGAAACCCGCCCCCAAAAGCAGGAAGCGGGGCGTCAGCACCTcccc > 2:7374678/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGCCTGTTGCGGGGGCACCCCCGCCCCGGCCCGCCCCCCCCCCCCCCTGGGGCCGGGGGTGACCGGGGGGGGGGGGGGGTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCga < 1:3487792/150‑1 (MQ=255) gactttttCGCGGGCACGCCCGCTCCGCCACGCCCCCCCACACCCCTGGGGCCTGTGGTTATCGGTGGGGGGGGGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGAtt < 1:3852641/145‑1 (MQ=255) gACAGTTTCGCGGGCAAGGCGGCTCCTGAACGCGCCACCACAACCATTGGGCCTGTGGTGATCCGTGGGGGGGCGGGATTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGAtt < 2:2375929/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGccc > 1:1657181/1‑150 (MQ=255) gCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGccc > 2:2816052/1‑150 (MQ=255) aaGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgc < 2:614542/150‑1 (MQ=255) aaGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgc > 2:3284016/1‑150 (MQ=255) gCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcct < 2:4968551/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacata < 1:6512742‑M2/150‑97 (MQ=255) cccGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcctg > 2:716711/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatac < 1:4507444‑M2/150‑98 (MQ=255) ccGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCGGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCCGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcctgc > 2:6488491/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGAgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacg < 1:5014268‑M2/150‑99 (MQ=255) gCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgc < 2:4461500‑M2/150‑100 (MQ=255) gCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcctgcct > 2:3158424/1‑150 (MQ=255) gCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcctgcct > 1:4307458/1‑150 (MQ=255) cTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgcc < 1:6366666‑M2/150‑101 (MQ=255) tCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTAc > 2:5706621/1‑150 (MQ=255) cTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCg > 1:4392984/1‑150 (MQ=255) cTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCg < 2:7043806/150‑1 (MQ=255) tGCACGCGCCCCCACACCCCTTGGGCGTGTGGTCATCGGTGGGGGGGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGc < 1:2104402/150‑1 (MQ=255) tGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCga > 1:4003786/1‑118 (MQ=255) tGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGAgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgt < 1:5801498‑M2/150‑105 (MQ=255) gCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGcc < 2:2201333/150‑1 (MQ=255) gcCACCACACCCGTGGGGCCTGTGGTGTTCGGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAAc < 1:7330486/150‑1 (MQ=255) gcCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGGGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAAc < 1:6765070/150‑1 (MQ=255) gcCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAAc > 2:1300983/1‑150 (MQ=255) gcCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCAGGAgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatct > 1:6763413‑M2/1‑39 (MQ=255) gcCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCAGGAgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatct < 2:6763413‑M2/149‑111 (MQ=255) cccaccaccaCCCTTGGGCCGGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGGTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAAc < 1:5310545/149‑1 (MQ=255) ccaccaCAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAAcc > 1:5469403/1‑150 (MQ=255) caccacAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCgaga < 2:606066/111‑1 (MQ=255) caccacAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCgaga > 1:606066/1‑111 (MQ=255) accacAACCCTTGGGCCTGTGGTGACGCGTGCAGGAgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatctggat < 1:1739321‑M2/150‑115 (MQ=255) ccacAACCGTTGGGCCTTTGGTGATCGGGGGGGGGGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGc < 1:2170951/150‑1 (MQ=255) ccacAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGc > 1:2110439/1‑150 (MQ=255) cacaCCCCTTGGGCCTGGGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGca < 2:131931/150‑1 (MQ=255) acaACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGcac > 2:4420038/1‑150 (MQ=255) caACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGcaca > 1:1850541/1‑150 (MQ=255) caACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGAgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatctggatcggc > 2:5801498‑M2/1‑32 (MQ=255) cccgttGGGCCTGGGGTGATCCGTGGGGGGGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACaaa < 1:1940793/146‑1 (MQ=255) tggggCTTGTGGTTACCGGTGGGGGGGGGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCt < 1:892550/148‑1 (MQ=255) gggttgtgGTGGTCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCa > 1:5860832/5‑150 (MQ=255) gCCTGTGGTTATCGGTGCGGGGGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCACGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCaa < 1:4876601/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTg < 1:4658980/102‑1 (MQ=255) ggggtgACCCGTGCGGGGGCGGGCTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGAcc < 1:687945/148‑1 (MQ=255) tggtgATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGAccc > 2:2204809/1‑150 (MQ=255) ggtgATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCt > 2:2652071/1‑150 (MQ=255) gtgATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTc > 1:2681346/1‑150 (MQ=255) ttttcggTGGGGGGGGGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCa < 1:3093204/144‑1 (MQ=255) aTCCTTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGc < 1:4322047/150‑1 (MQ=255) aTCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGc < 1:6729351/150‑1 (MQ=255) aTCCGGGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGc < 2:216746/150‑1 (MQ=255) tCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAACCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGcc > 2:1991026/1‑150 (MQ=255) tgggggggCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCAc < 1:4923664/147‑1 (MQ=255) tGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCAc > 2:1245913/1‑150 (MQ=255) cGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCt < 2:2493312/85‑1 (MQ=255) cGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCt > 1:2493312/1‑85 (MQ=255) ggcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatctggatcggcgcttcgtcatgggtgctggccaggtcgcccg > 1:4461500‑M2/1‑1 (MQ=255) | GGCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCACCTACGC > NC_002947/5703649‑5703946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |