| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,739,066 | 0 | A | T | 9.7% | 540.7 / 9.2 | 216 | intergenic (‑87/+70) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (78/103); new base T (2/19); total (93/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.09e-03 | |||||||||||
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Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |