| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,875,317 | 0 | A | T | 6.1% | 664.0 / 7.9 | 218 | intergenic (+73/+61) | PP_5144/ptsP | hypothetical protein/phosphoenolpyruvate‑dependent regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (102/96); new base T (3/13); total (108/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.71e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
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ACAACGGCCTGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGtt < 2:4884092‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAACGGCCTGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGtt < 1:4725303‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAACGGCCTGGGA‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACACTCACAGGGTTTAATTAGCCCCAGGCCCAATAATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGtt < 2:945276‑M1/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCTGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAAc < 1:434638/73‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGttcttc < 2:6102419/137‑1 (MQ=255) cGGCCTGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAg > 1:4713526/1‑150 (MQ=255) cTGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAg > 1:6539917/1‑150 (MQ=255) tGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGc > 1:6955353/1‑150 (MQ=255) tGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGc > 2:2701439/1‑150 (MQ=255) gggT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCt > 2:5882819/1‑150 (MQ=255) ggT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCtg > 2:534060/1‑150 (MQ=255) ggT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCtg > 2:1370287/1‑150 (MQ=255) t‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCtgtg > 1:7117784/1‑150 (MQ=255) aaCCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGAt > 1:5123969/1‑150 (MQ=255) aaCCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGAt > 1:4827734/1‑150 (MQ=255) ccccA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCgg < 1:2721471/50‑1 (MQ=255) ccA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAAcc > 1:5746092/1‑150 (MQ=255) ccA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAAcc > 2:680140/1‑150 (MQ=255) ccA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGATGCAGCGAGCTGTGGATAAcc > 2:855103/1‑150 (MQ=255) | AGGGGCAAAGGCGGCTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGT‑CCAACCCCA‑GATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCT > NC_002947/5875168‑5875463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |