Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 539,661 | A→G | 100% | D679G (GAC→GGC) | rpoB → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 539,661 | 0 | A | G | 99.4% | 1195.9 / ‑3.6 | 333 | D679G (GAC→GGC) | rpoB | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (172/158); total (174/159) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
CAAGAAGCAACTGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGACGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCATGGAGCGCAACGTTGCCCGTGACTCCGGTGTCTGCGTGGTTGCTCGCCGCGGTGGTG > NC_002947/539515‑539807 | aagaagCAACTGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCacggcgac < 2:1792949/150‑1 (MQ=255) aagaagCAACTGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCacggcgac < 2:5759781/150‑1 (MQ=255) aagaagCAACTGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCacggcgac > 2:6856988/1‑150 (MQ=255) aagaagCAACTGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCacggcgac > 1:2653747/1‑150 (MQ=255) aagaagCAACTGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCacggcgac < 2:5870400/150‑1 (MQ=255) aagCACCTGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGcc > 2:4917189/1‑150 (MQ=255) gCAACTGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCaa > 1:5816265/1‑150 (MQ=255) tGATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTg > 2:281469/1‑150 (MQ=255) gATCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGc < 2:5180640/150‑1 (MQ=255) aTCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCg > 1:4818271/1‑150 (MQ=255) tCGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGt < 2:2372994/150‑1 (MQ=255) cGATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGtt < 2:5055351/150‑1 (MQ=255) gATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTg > 2:6178453/1‑150 (MQ=255) gATGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTg > 2:1362746/1‑150 (MQ=255) tGAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGAt < 2:388704/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATg < 2:4813292/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATgg < 1:42812/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCGGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGt < 1:79826/150‑1 (MQ=255) tGGTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGtt > 1:3476343/1‑150 (MQ=255) gTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCg > 1:4928297/1‑150 (MQ=255) gTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCg > 1:101637/1‑150 (MQ=255) gTAGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCg > 2:7255612/1‑150 (MQ=255) aGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGaa > 1:6990334/1‑150 (MQ=255) aGCAGTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGaa < 1:6814763/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATg < 2:275817/150‑1 (MQ=255) gTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGc < 1:39670/150‑1 (MQ=255) gTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGc > 2:39670/1‑150 (MQ=255) gTCACCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGc > 2:6383798/1‑150 (MQ=255) aCCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTc < 2:4309039/150‑1 (MQ=255) aCCTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTc > 1:4597129/1‑150 (MQ=255) cTGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAg > 1:7060425/1‑150 (MQ=255) tGAACGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAgg > 2:5257415/1‑150 (MQ=255) aaCGAATTCACCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCt > 2:714336/1‑150 (MQ=255) 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aCCGTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGAcc > 1:5551310/1‑150 (MQ=255) gTCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTg > 1:3116561/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGc < 1:3821353/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCg > 2:4507343/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTg < 1:5073346/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGc < 2:7113488/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGcc > 1:2169628/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGcc < 1:419949/150‑1 (MQ=255) cgcCGGAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCg < 2:3056709/150‑1 (MQ=255) ggAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACaa > 2:7413348/1‑150 (MQ=255) ggAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACaa > 1:4074064/1‑150 (MQ=255) gAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAg < 1:5401649/150‑1 (MQ=255) gAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAg > 2:4655240/1‑150 (MQ=255) gAAGACGTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAg > 2:3007869/1‑150 (MQ=255) gTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTg < 2:6969515/150‑1 (MQ=255) gTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTg < 2:1933992/150‑1 (MQ=255) gTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTg < 1:4505170/150‑1 (MQ=255) gTCACCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTg < 1:7204089/150‑1 (MQ=255) aCCCTGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTggta < 1:1764398/150‑1 (MQ=255) tGATGGACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTggtaggta < 1:4456180/150‑1 (MQ=255) ggACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCgg < 2:3326830/150‑1 (MQ=255) gACGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGc > 2:417417/1‑150 (MQ=255) aCGTTTCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCa > 1:3731785/1‑150 (MQ=255) tttCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCATgg > 2:5392769/1‑150 (MQ=255) tttCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCATgg > 2:1628682/1‑150 (MQ=255) tttCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCATgg > 1:6062429/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCATGGa < 1:6356544/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCATGGa < 1:6600264/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAGCAGGTTGTGTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCATGGa < 2:7185973/150‑1 (MQ=255) gCCGAAGCAGGTTGTTTCCGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTCCTCGAGCACGGCGACGCCAACCGTGCGTTGATGGGTTCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTACCGACCCTGCGTGCCGACAAGCCGCTGGTAGGTACCGGCATGGAgcg < 2:3769904/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |