Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,408,546 | T→C | 21.3% | intergenic (‑57/+24) | PP_1227 ← / ← PP_1228 | membrane protein/methyl‑accepting chemotaxis transducer |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,408,546 | 0 | T | C | 21.3% | 494.6 / 133.6 | 264 | intergenic (‑57/+24) | PP_1227/PP_1228 | membrane protein/methyl‑accepting chemotaxis transducer |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (88/105); new base C (27/27); total (119/145) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.45e-02 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GTGGCGATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCAC > NC_002947/1408398‑1408695 | cGATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCcg > 1:6842231/1‑150 (MQ=255) gATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCcgc < 2:6966726/150‑1 (MQ=255) gATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCcgc > 2:2132519/1‑150 (MQ=255) tGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGa < 1:3570173/150‑1 (MQ=255) tGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGa < 1:1087899/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAACAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGaa < 1:788818/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGCTCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGaa < 1:1013357/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGaa < 2:1667970/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGaa < 2:777551/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGaa < 1:6010082/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGaa < 1:4758452/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGaa < 2:6520187/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGaa < 1:2731628/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGAGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGaa < 1:1196421/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCCTAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 2:7002170/149‑1 (MQ=255) aCAGGGTGGCGGCGATCGTGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCTAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 2:365572/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 1:2951290/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 1:4385412/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGAaga < 2:1077946/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGAaga < 1:734151/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGAaga < 1:6059681/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTGCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCGCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGAagag < 1:2367391/150‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAgg < 1:4999854/150‑1 (MQ=255) 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gCGTAAACGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAATGTGTATCGGGTTGGATTCGGCATAAGTTGTGCTCAATAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGa < 1:7133193/150‑1 (MQ=38) cGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGaa > 1:5200667/1‑150 (MQ=255) aaaaGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACt > 2:1286822/1‑150 (MQ=255) ttGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATc > 2:2256557/1‑150 (MQ=255) tGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCa < 2:4866493/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAgc > 2:4625157/1‑150 (MQ=255) cTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCct < 2:507042/150‑1 (MQ=255) tgaggccGAAGAACGTGGAGCGGGTTGGATCCGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCGGCCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCctgctg < 1:5964571/144‑1 (MQ=38) gATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTCCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCctgctgc < 2:1866336/150‑1 (MQ=255) tCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGt > 2:3814772/1‑150 (MQ=255) 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gaagaaAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCAGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg > 1:3203412/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGGTCCCCCGAAGGGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACAGCGCCAACAGCGCCAGCGGCTGGTTGGccc > 1:858414/1‑149 (MQ=255) ggggATCGGGTTGGATGAGGCATCCGGTGTGCTCAAGAATACCGAGGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCGTCGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGcc < 2:7299902/148‑1 (MQ=38) gTGGATCGGGTCGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGcc > 2:910046/1‑150 (MQ=255) gATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGt < 2:4997971/150‑1 (MQ=255) aTTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTgg < 1:3610217/150‑1 (MQ=255) ttAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGc < 2:2267187/150‑1 (MQ=255) ttAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGc < 2:1991512/150‑1 (MQ=255) ggCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGa > 1:4333614/1‑150 (MQ=255) gCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGAt < 2:3419027/150‑1 (MQ=255) 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ctctTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGtctc < 2:5200667/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCg > 2:1946867/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGa < 1:1714332/135‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGa > 2:5485753/1‑135 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGa < 1:5485753/135‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCg > 2:5833613/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCg > 2:1343285/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCg > 2:3040438/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGaa > 1:3738388/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCa > 2:4362358/1‑78 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGaa > 1:4833678/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAAt > 2:7110494/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAAt > 2:3281190/1‑150 (MQ=255) cgcgGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATg > 1:206034/1‑150 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGc > 1:3092889/1‑150 (MQ=255) gggCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCg < 1:1905259/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCgg > 1:262226/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCgg < 2:2868582/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGc > 1:2857384/1‑150 (MQ=255) cGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGcc < 1:3687132/150‑1 (MQ=255) gTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGt > 2:4572530/1‑95 (MQ=255) tGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCAc > 1:2494065/1‑150 (MQ=255) | GTGGCGATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCAC > NC_002947/1408398‑1408695 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |