Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 1,474,764 | A→G | 5.1% | V112A (GTG→GCG) | algK ← | alginate biosynthesis protein AlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,474,764 | 0 | A | G | 5.1% | 1290.7 / 34.4 | 388 | V112A (GTG→GCG) | algK | alginate biosynthesis protein AlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (187/181); new base G (12/8); total (199/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 |
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
CTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCG > NC_002947/1474616‑1474913 | tgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGccacc > 1:2717779/1‑150 (MQ=255) tgcGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGccacc < 2:6972039/150‑1 (MQ=255) gcgcGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGccacca < 1:114121/150‑1 (MQ=255) cgTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACcagca > 1:4652286/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACcagcag > 1:7118072/1‑150 (MQ=255) aCCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAggcgg > 1:2052633/1‑150 (MQ=255) aCCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAggcgg > 1:40200/1‑150 (MQ=255) ttGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCa > 1:1963865/1‑150 (MQ=255) tGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCGCCTGCTGGTGGCCaa < 1:6022899/150‑1 (MQ=255) gggAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAgg > 2:1320157/1‑150 (MQ=255) ggAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGgc < 2:5648595/150‑1 (MQ=255) ggAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGgc > 1:1024802/1‑150 (MQ=255) ggAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGgc > 2:4829024/1‑150 (MQ=255) aCTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGgcgcgc > 1:6237399/1‑150 (MQ=255) tctGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCtt > 1:1375659/1‑150 (MQ=255) tctGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCtt < 2:6574712/150‑1 (MQ=255) tctGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCtt > 2:2072311/1‑150 (MQ=255) ctGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTg < 2:5124047/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCTAAGGCGCGCTTgg > 2:5786090/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTgg < 2:366150/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTgg > 2:2797615/1‑150 (MQ=255) gggTATCTTAGGTAGAGCATTGCCAGAGGAATCAGGGTATTGCTTTGGACCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGgcg > 2:5884875/1‑150 (MQ=255) gggTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGgcg > 1:2151335/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGcgcg > 2:6074460/1‑150 (MQ=255) tAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGt < 2:2704159/150‑1 (MQ=255) tAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGt < 1:7191416/150‑1 (MQ=255) gCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTgg < 1:5636390/150‑1 (MQ=255) cTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGc < 1:4764717/150‑1 (MQ=255) tGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCg > 1:1491209/1‑150 (MQ=255) tGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCg > 1:503813/1‑150 (MQ=255) gTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGt > 2:7390018/1‑150 (MQ=255) tAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTg > 2:2097700/1‑150 (MQ=255) tAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTg > 2:4396436/1‑150 (MQ=255) 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cTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGAt < 2:6385432/150‑1 (MQ=255) tGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGAtt < 1:422202/150‑1 (MQ=255) tGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGAtt < 2:7291198/150‑1 (MQ=255) gTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGACGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGAttc < 2:3349890/150‑2 (MQ=255) cgcgGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGa < 1:4393663/150‑1 (MQ=255) 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tCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGcc > 1:3288880/1‑150 (MQ=255) tCACGTGCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGAGAGGTGGCCTCGGCTGGCTTGAGGTGCGCGGGGTCGCGGGTGGCCCGCGGGATGTCCGcc > 2:6641664/1‑150 (MQ=255) aCGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAg < 1:1615602/150‑1 (MQ=255) aCGTTCGGCCTGGGTGCTGGCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGAGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTGGATATGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAg > 2:1745475/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGc < 2:1103271/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACtt > 1:5900974/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACtt < 2:253554/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTg > 2:2451520/1‑150 (MQ=255) tGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATa > 2:1151242/1‑80 (MQ=255) gggTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTgcg < 1:3884866/150‑1 (MQ=255) cTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCg > 1:6384580/1‑150 (MQ=255) cTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCg < 1:5317982/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCt < 2:503813/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCt < 1:1817803/150‑1 (MQ=255) ccGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTgg > 1:2793181/1‑111 (MQ=255) cGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTa < 1:3039384/150‑1 (MQ=255) ggCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAg < 2:6237399/150‑1 (MQ=255) gCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGc > 1:550134/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCGCCTGCTGGTGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGc > 2:1605402/2‑150 (MQ=255) cTTGGCCGCCTGCTGGTGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGcc > 1:3311343/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCGCCTGCTGGTGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGcc > 2:3221335/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGcc < 1:4625883/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGcc > 1:4495739/1‑150 (MQ=255) caccaGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTg < 1:3374292/100‑1 (MQ=255) caccaGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTg > 2:3374284/1‑100 (MQ=255) caccaGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTc > 2:6722295/1‑150 (MQ=255) accaGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCg > 1:5169186/1‑150 (MQ=255) | CTGCGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCG > NC_002947/1474616‑1474913 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |