| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,549,495 | 0 | T | G | 41.3% | 172.8 / 306.6 | 234 | intergenic (+63/+51) | mdfA/ampG | multidrug MFS transporter/muropeptide permease AmpG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/83); new base G (51/45); total (105/129) | |||||||||||
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Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
CGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAGGCACC > NC_002947/1549347‑1549642 | ggggggggggggCGGGGGCGTGGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCttt < 2:4640738/146‑1 (MQ=255)cgggggGGGGGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGGGGTGTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCttt < 2:7171520/150‑1 (MQ=255) ggggggggggCGGGGGGGTGGGCGCTGTGGCCGCTGTGTTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAA‑CCCGCTCCTACAAAGCGGCGCGGCCCTgtgt < 1:12532/148‑1 (MQ=25) 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acacAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcag > 1:5048512/1‑150 (MQ=255) acaGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTg < 1:5788251/136‑1 (MQ=255) acaGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcagga > 1:3292570/1‑150 (MQ=255) aaagcggcgcggcccTGTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcagga > 1:7071549/8‑150 (MQ=38) aaagcggcgcggcccTGTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcagga > 1:6815307/8‑150 (MQ=38) ccgggCCGCGCCGCTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATCGCCCTGCAGTGGcatcaggaa < 2:5695832/148‑2 (MQ=38) aagcggcgcggcccTGTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcaggat > 2:6227502/7‑150 (MQ=38) agcggcgcggcccTGTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCCGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcaggatc > 1:3368844/6‑150 (MQ=25) agcggcgcggcccTGTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcaggatc > 1:7040148/6‑150 (MQ=255) agcggcgcggcccTGTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcaggatc > 2:3240916/6‑150 (MQ=255) aGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcaggatc > 1:625811/1‑150 (MQ=255) aGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCgatcaggatc > 2:7169692/1‑150 (MQ=255) gccgcgccgcTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGc > 2:2985426/1‑150 (MQ=255) ccgcgccgcTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAg < 2:5399980/65‑1 (MQ=255) ccgcgccgcTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAg > 1:5399683/1‑65 (MQ=255) gcgccgcTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTa > 1:3775328/1‑150 (MQ=255) cgccgcTTTGTAGGAGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAg < 2:2085081/150‑1 (MQ=255) gccgcTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAgg > 1:3924952/1‑150 (MQ=255) | CGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAGGCACC > NC_002947/1549347‑1549642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |