| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,560,480 | T→C | 14.4% | K109E (AAA→GAA) | PP_1366 ← | transcriptional regulator MvaT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,560,480 | 0 | T | C | 14.4% | 865.9 / 109.6 | 329 | K109E (AAA→GAA) | PP_1366 | transcriptional regulator MvaT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (160/119); new base C (22/25); total (183/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
AGGAACGCTATTCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGTTTCGACTCTGGAT > NC_002947/1560331‑1560629 | aGGAACGCTATTCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCttt < 2:4302055/150‑1 (MQ=255)aGGAACGCTATTCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCGTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCttt > 2:7097575/1‑150 (MQ=255) gAACGCTATTCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTcc > 2:5006072/1‑150 (MQ=255) tATTCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCGCCCCCACGTGGCTTTCCActct > 2:6101603/1‑150 (MQ=255) ttCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑c > 2:1269176/1‑150 (MQ=255) ttCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTGGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGAGAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTGT‑c > 2:3652017/1‑150 (MQ=255) tCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑Ca < 1:5006072/150‑1 (MQ=255) tCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑Ca < 2:2755104/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACGCTTT‑CAggg > 1:5082731/1‑150 (MQ=255) cTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTtg < 2:5823148/150‑1 (MQ=255) gATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGATTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCTCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTtgtg < 2:6403559/150‑1 (MQ=255) ttcgcacaaCAAAAACGCCGGCACATTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCTCAAGTGGCTTTCCACTCTGT‑CAGGGTCTTGTGGTTg > 2:4082167/8‑150 (MQ=38) aGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTgcc > 1:5520843/1‑150 (MQ=255) aaCAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTTCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCtt > 1:4607844/1‑150 (MQ=255) aCAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGGGGTTGCCGCCttt > 2:6869943/1‑150 (MQ=255) cAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTC‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTg > 2:1781340/1‑150 (MQ=255) cAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGATTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGGTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTg < 1:3155044/150‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTgg > 1:2139522/1‑150 (MQ=255) aaaaaCGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGAGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCGTGTGGTAGCCGCCTTTgg > 2:7127152/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGCACATTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCCCTATTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCGTTGGTTTc > 2:6311579/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGCACATTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTc > 1:1605379/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGCACATTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTc > 2:391427/1‑150 (MQ=255) ggCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGGTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCa > 2:1950772/1‑150 (MQ=255) aaTGTGCCGGCGTTTTTGTTTTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCGGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACtt > 1:1572099/1‑150 (MQ=255) cGGCGTTTTTGTTTTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCTAAGAGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTACACCGtt > 2:4413171/1‑150 (MQ=255) cGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAATAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGtt > 1:385497/1‑150 (MQ=255) cGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGtt > 2:1035908/1‑150 (MQ=255) cGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTCGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGtt < 2:2520181/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTCGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGtt < 2:285531/150‑1 (MQ=255) gCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCTCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTtgt < 1:1765070/150‑1 (MQ=255) gCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTtgt < 1:1316516/150‑1 (MQ=255) gCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTACAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCATT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCGGTGGTTTCGATCACATCACCGTtgt > 2:1672510/1‑150 (MQ=255) cGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTtgtg < 2:1633997/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGc > 1:4237937/1‑150 (MQ=255) tttttGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCg > 1:6066006/1‑150 (MQ=255) tttGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCGGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCggg < 2:5929843/150‑1 (MQ=255) gttgtGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTc > 1:4335097/1‑150 (MQ=255) ttgtGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGTCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCt > 2:5799058/1‑150 (MQ=255) tgtgCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTTCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCtt < 2:3606448/150‑1 (MQ=255) tgtgCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCtt < 1:3808940/150‑1 (MQ=255) tgtgCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTAGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCtt < 2:7322905/150‑1 (MQ=255) tgCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCTGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGt > 1:114109/1‑150 (MQ=255) tgCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTTCACTCTTT‑CAGGGTGTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCAGCGTTGTGCGGGTTCTTGt > 2:5343892/1‑150 (MQ=255) cGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTAt < 2:1605379/150‑1 (MQ=255) cGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTAGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTAt > 1:6367073/1‑150 (MQ=255) gAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTTTAtt > 1:5753420/1‑150 (MQ=255) gAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTAtt > 2:3302188/1‑150 (MQ=255) gAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTAtt < 2:4349300/150‑1 (MQ=255) gAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTAtt > 1:2324477/1‑150 (MQ=255) aGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCGGCTTACAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGc > 1:2731479/1‑150 (MQ=255) aGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGc < 2:6606226/150‑1 (MQ=255) aGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTC‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGc < 2:776963/150‑1 (MQ=255) aGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGc < 1:6763946/150‑1 (MQ=255) gCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCt < 2:2634384/150‑1 (MQ=255) cAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTTTATTGCtt < 1:4057140/150‑1 (MQ=255) aaGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTg > 1:4132501/1‑150 (MQ=255) gagGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGAc < 2:3433702/150‑1 (MQ=255) ggCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGGTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGTCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCtt < 2:6520416/150‑1 (MQ=255) cGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTtgc < 1:5725845/150‑1 (MQ=255) cGTATGCGGATAATCAGGCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTtgc < 2:2241819/150‑1 (MQ=255) gTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTAAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCtt < 1:1004321/147‑1 (MQ=255) gTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTAAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCtt > 2:1004321/1‑147 (MQ=255) gCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTtgcgtgcg > 1:824191/1‑150 (MQ=255) cGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCGAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTgcgc > 1:3353774/1‑150 (MQ=255) cGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTCGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTgcgc < 2:4134142/150‑1 (MQ=255) tAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCTGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCtt < 1:186519/150‑1 (MQ=255) aaTCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCACCCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CCGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTg < 2:462912/150‑1 (MQ=255) aTCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTAGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTgg < 1:2412040/150‑1 (MQ=255) aTCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTgg > 1:1695204/1‑150 (MQ=255) aGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTCGCCGCCTTTGGTTTCGa < 1:7204661/93‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTTCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGAc > 2:4568229/1‑150 (MQ=255) ggTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCtt < 2:1537001/150‑1 (MQ=255) ttGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGC‑CGCTTGGTGACGGTAGTCTTGAc < 2:2170781/150‑1 (MQ=255) cccAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCTACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCg < 2:5074968/150‑1 (MQ=255) cccAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTg < 2:3809219/131‑1 (MQ=255) cccAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCg > 1:3222791/1‑150 (MQ=255) cccAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTGGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCg > 1:6961373/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTTACAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCg > 2:4523266/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTCGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGa > 1:4836240/1‑150 (MQ=255) cAGCTTTCAACCATGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACC‑TGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCtt > 1:5873440/1‑142 (MQ=255) cAGCTTTCAACCACGTCGCCGCCCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGa > 1:6752509/1‑150 (MQ=255) cAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTAGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGaa > 2:3113266/1‑150 (MQ=255) aGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCCTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAAc < 1:2682160/150‑1 (MQ=255) gCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAAcc < 1:7100217/150‑1 (MQ=255) tttCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTATTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCAc > 2:6725108/1‑150 (MQ=255) tCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGa < 2:5032860/150‑1 (MQ=255) cAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAg < 2:1712405/150‑1 (MQ=255) cGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCt > 1:7397528/1‑150 (MQ=255) gccg‑ccCCAAGTGGCTTTCCACTCTTC‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCt > 2:5474149/1‑150 (MQ=255) ccg‑ccCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTc > 2:474686/1‑150 (MQ=255) g‑ccCCAAGTGGCTTACCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAg < 2:4786492/150‑1 (MQ=255) ccccAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTC‑TGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGtt < 1:6583136/150‑1 (MQ=255) aaGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCGTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGTTTCg > 1:2895590/1‑150 (MQ=255) gTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTtgc > 1:6199014/1‑91 (MQ=255) gTGGCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTtgc < 2:6199014/91‑1 (MQ=255) ggCTTCCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGTTTCGActc < 1:5448024/150‑1 (MQ=255) cTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGTTTCGACTCTg < 2:1131945/150‑1 (MQ=255) cTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCCCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGTTTCGACTCTg > 1:3608575/1‑150 (MQ=255) tttCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGACGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGTTTCGACTCTgg > 1:881944/1‑150 (MQ=255) tttCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTCGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGTTTCGACTCTgg > 1:5279800/1‑150 (MQ=255) | AGGAACGCTATTCAATCGGCTGATGGCAGATAAACAAAAACGCCGGCAATGTGCCGGCGTTTTTGTTGTGCGAAGCAAGAGGGCGTATGCGGATAATCAGTCCAGCAGGGTTGCCCAGCTTTCAACCACGTCGCCG‑CCCCAAGTGGCTTTCCACTCTTT‑CAGGGTCTTGTGGTTGCCGCCTTTGGTTTCGATCACTTCACCGTTGTGCGGGTTCTTGTATTGCTTGACCTTGCGTGCGCGCTTGGTGACGGTAGTCTTGACCGAACCACGAGGTGCCTTGCTCAGTTTCGACTCTGGAT > NC_002947/1560331‑1560629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |