Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,717,071 | 0 | A | T | 11.4% | 507.2 / 35.5 | 218 | intergenic (+71/‑187) | ppc/adk | phosphoenolpyruvate carboxylase/adenylate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (116/52); new base T (5/20); total (123/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.96e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CGCTCTGGACAGCCCGTTGGAGCAGGCCTTGCTGGTGACCGTGGCGGGTATTGCCGCCGGGCTGCGCAACACCGGCTAAGGGCAAGCCCGGGTCATGTCTGGTGACGGCCATACAGGCCCGGCACAAGGACGGGGAGGGCGGTT‑GCGCCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTCGCCGAA > NC_002947/1716922‑1717220 | cGCTCTGGACAGCCCGTTGGAGCAGGCCTTGCTGGTGACCGTGGCGGGTATTGCCGCCGGGCTGCGCAACACCGGCTAAGGGCAAGCCCGGGTCATGTCTGGTGACGGCCATACAGGCCCGGCACAAGGACGGGGAGGGCGGTT‑GCGCCa < 1:5962412/150‑1 (MQ=255) gCTCTGGACAGCCCGTTGGAGCAGGCCTTGCTGGTGACCGTGGCGGGTATTGCCGCCGGGCTGCGCAACACCGGCTAAGGGCAAGCCCGGGTCATGTCTGGTGACGGCCATACAGGCCCGGCACAAGGACGGGGAGGGCGGTT‑GCGCCAg < 1:6131291/150‑1 (MQ=255) gCTCTGGACAGCCCGTTGGAGCAGGCCTTGCTGGTGACCGTGGCGGGTATTGCCGCCGGGCTGCGCAACACCGGCTAAGGGCAAGCCCGGGTCATGTCTGGTGACGGCCATACAGGCCCGGCACAAGGACGGGGAGGGCGGTT‑GCGCCAg < 2:3226260/150‑1 (MQ=255) 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ggtggggggTT‑GCGCCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACtt < 2:4931166/147‑1 (MQ=255) ggggggggGT‑GCCCCACGCGCCCCCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTg < 1:6557787/148‑1 (MQ=255) ggCGGTT‑GCGCCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGcc > 2:381678/1‑150 (MQ=255) cGGTT‑GCGCCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGGGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGAGGTATGGTCATACCCGATTTTACGGACTTGGCCCt > 2:6773289/1‑150 (MQ=255) ggTT‑GCGCCTGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTg > 1:1202597/1‑150 (MQ=255) ggTT‑GCGCCTGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTg > 1:6871057/1‑150 (MQ=255) gTT‑GCGCCTGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTgg > 1:5016134/1‑150 (MQ=255) t‑GCGCCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTc > 1:434489/1‑150 (MQ=255) t‑GCGCCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTc > 2:7409053/1‑150 (MQ=255) ccggcCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTc > 2:2418064/4‑150 (MQ=255) gcCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTCGcc > 1:1885859/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTgtgt < 2:3660178/84‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTCGCCg > 1:5135956/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACtt > 2:2382001/1‑135 (MQ=255) cAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCAGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTCGCCGa > 1:1022638/1‑150 (MQ=255) aGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTCGCCGaa > 1:3552923/1‑150 (MQ=255) aGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTCGCCGaa > 1:1708206/1‑150 (MQ=255) | CGCTCTGGACAGCCCGTTGGAGCAGGCCTTGCTGGTGACCGTGGCGGGTATTGCCGCCGGGCTGCGCAACACCGGCTAAGGGCAAGCCCGGGTCATGTCTGGTGACGGCCATACAGGCCCGGCACAAGGACGGGGAGGGCGGTT‑GCGCCAGGCGCAACCGCCTGCCCGGTCAGCCGCAAGTGGCGC‑ATTCCTGCAACTTTGGGACGCTTGTCTGGCTGCCGGGCGCTGTGTATCTTGAGCAGCCTTCTGACCGATTTATGGTCATACCCGATTTTCCGGACTTGGCCCTGGTCGCCGAA > NC_002947/1716922‑1717220 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |