Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,032,384 | T→G | 6.5% | L61R (CTG→CGG) | wbpL → | glycosyl transferase WbpL |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,032,384 | 0 | T | G | 6.5% | 611.7 / 2.1 | 224 | L61R (CTG→CGG) | wbpL | glycosyl transferase WbpL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (112/89); new base G (12/9); total (125/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
CTCGTGCTTGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCATTTTGCGGCGGCCGCTTGGGGGC > NC_002947/2032235‑2032533 | tCGTGCTTGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCtg > 1:4407294/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTTGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTGGCTGGGCGtg > 2:7107104/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTTGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCGTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCtg > 2:4657929/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTTGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTATCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCtg > 2:2649511/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTTGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCACGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCtg < 2:7079231/150‑1 (MQ=255) cGTGCTTGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCtgg > 1:4287582/1‑150 (MQ=255) ctGCATGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTcctgggcctggg < 2:760344/149‑1 (MQ=255) tgatgaCCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCtggggtggg < 1:5030838/150‑1 (MQ=255) gaCCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCgg < 1:143669/150‑1 (MQ=255) gaCCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCgg < 1:6948242/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCggg < 1:1393372/150‑1 (MQ=255) cgccgTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTa < 2:6705851/150‑1 (MQ=255) cgccgTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTa > 1:1659623/1‑150 (MQ=255) gccgTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCGGGGGTGGGGCGGGtcc > 2:6233403/1‑148 (MQ=255) cgTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGt < 1:2742026/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGt < 2:5753382/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGt < 1:957877/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGtt < 2:2316493/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGtt < 2:2870274/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTGGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGtt < 2:4407294/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCCGCTAGGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACGGTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTg < 1:4619627/150‑1 (MQ=255) tgcGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTc < 1:5776120/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTcc < 1:4208659/150‑1 (MQ=255) cgcTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCTTAGCTCGCATACATTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGATTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGATGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCa < 2:1162542/150‑1 (MQ=255) cgcTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCa > 1:476530/1‑150 (MQ=255) cgcTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCa < 2:6724191/150‑1 (MQ=255) cTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACCTCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTGTCGTGGTCGCTTTCCTCGCTGCGTAGCTGGGCCGGGGGTGGGGCGGGTACGGTGCTCCGGCAGt > 2:5418672/1‑150 (MQ=255) cTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCGGGGGGGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGt > 1:1929366/1‑150 (MQ=255) tATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTGTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTg > 2:3388408/1‑150 (MQ=255) tGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCt > 1:5713893/1‑150 (MQ=255) cTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGAcc < 2:4227362/150‑1 (MQ=255) tGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCa < 2:6544466/150‑1 (MQ=255) ccGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGAGAAGCTCGCCTACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTAGGCAGTCGTGGTCTCTGTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGGGGGGCGGGTACGGTGCGCCGGCCGTGCGGCCCCgtgt > 2:6466411/1‑150 (MQ=255) gTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCTCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAgtgtgt < 1:5412911/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTgg < 1:5811248/150‑1 (MQ=255) ccTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTggg > 1:5099289/1‑150 (MQ=255) ccTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGACAGTGCTGACCAGTGTGTTggg < 1:3676117/150‑1 (MQ=255) tGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGTCTGCGTTGCTGGGCCGGGGGTGGGGCGGGTCCGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGGGTTggggg > 2:1994350/1‑150 (MQ=255) tGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTAGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGCCTTTCGTGGTCGCTTTCCAGGCTGCGTTGCTGGTCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCAGGCAGTGCTGACCAGTGTGATggggg > 2:4931675/1‑150 (MQ=255) gTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGc > 1:4690280/1‑150 (MQ=255) aCATCCCCATTGCGCGTAGCTCGCATACGTTGCCACCCCCGCGAGGCGGGGGCTTGGCTTTGGTGGTCGCTTTCCGGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCggggg < 2:6897380/150‑1 (MQ=255) aCATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCACCCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCGGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCggggg < 2:2150233/150‑1 (MQ=255) aCATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGGTTTGGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCggggg < 1:5913824/150‑1 (MQ=255) aCATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCCGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCggggg < 1:6144541/150‑1 (MQ=255) cATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGATTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCggcgag < 2:5951564/150‑5 (MQ=255) tCCCCATGGCGGGTTGCTCGAATACGTTGCAAACCCCGGGGGGGGGGGGTTTGGCTTTGGTGGTGGCTTTCGTGGCTGGTTTGCGGGGCGGGGGGTGGGGGGGGTACGTTGCTCGGGCTGTGCTGACATGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGc < 1:3143946/150‑1 (MQ=255) tCCCCAATGCGCGTTGATCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGGGGGTTGTCTTTCGTGGTGGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTAGGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGc < 2:2507871/150‑1 (MQ=255) ccccAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCt > 2:2486516/1‑150 (MQ=255) cctttGCGCGTTGCTCGAATACCTTGCAAACCCCGCGAGGGGGGGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCGTGGCTGGGTTGCTGGGCGTGGGTTGGGGGGGTTAGGTTGCTCCGGCTGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTgg < 2:3762857/146‑1 (MQ=255) ccAATGCGCGTAGCTCGCATCCCTTGCCACCCCGGCGCGGGGGGGGCTGGGCTTTCGGGGTCGCTTGCCTGGCGGCGTTGCTGGGCGTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCTGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTgg < 2:5258857/150‑1 (MQ=255) ccAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTgg > 1:7102872/1‑150 (MQ=255) cattGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCACCCCCGCGTGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGGTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGGGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGt < 1:2438066/147‑1 (MQ=255) caTGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTCCGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGtt > 2:131138/2‑150 (MQ=255) atggcgcGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGGGTGGGGGGGGCTTGGCTTTGGTGGTCGCTTTCCTGGCTGGGTTGGTGGGCGTGGGGTGGGGGGGGTACGTTGCGCCGGCAGTGCTGACCTGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGtt < 2:3151312/147‑1 (MQ=255) aaTGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGAc > 2:1821142/1‑122 (MQ=255) aaTGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGAc < 1:1821142/122‑1 (MQ=255) tGCGCGTCGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGGGTGTTGGGGGCGGGGGGGCGGGGTgc > 2:4653133/1‑150 (MQ=255) tGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTgc > 2:4653488/1‑150 (MQ=255) gcgTAGCTCGCATCCGTTGCCACCCCCGGGCGGGGGCGGTTTGGCTTTGGGGGGCGCTTTCCTGGCTGCGTTGGTGGGCCTGGGGTGGGGGGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCGGACCAGTGTGTGGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCt < 2:5560836/150‑1 (MQ=255) gCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGACGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGGACGGTGCTCCGGCAGTGCTGCCCAGTGGGGGGGGGGCGGGGGGGCGGGTTGCGCTGAtcg > 2:1526872/1‑148 (MQ=255) tCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCtggggt < 2:3501687/79‑1 (MQ=255) tCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCtggggt > 1:3501687/1‑79 (MQ=255) tCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGa > 1:6307300/1‑109 (MQ=255) tCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGa < 2:6307300/109‑1 (MQ=255) tCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGc > 1:6673787/1‑150 (MQ=255) cGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCt > 1:1151621/1‑150 (MQ=255) gCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCCGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCtt > 1:3956759/1‑150 (MQ=255) gCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCtt > 1:1115941/1‑150 (MQ=255) gCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCGTGGCATTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTCGGGCGCGTCCGTTGCTCCGGACGTGCTGACCAGTGGGTTGTGGGCGGGGGGGCTGGTTTCGATGATAGGCtt > 2:7184797/1‑150 (MQ=255) cATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGGGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTc > 1:6761684/1‑150 (MQ=255) aTACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGAGAGGCTTCa > 2:7133938/1‑150 (MQ=255) tcccTTGCCACCCCCGGGTGGGGGGGGGTTGGCTTTGGTGGTCGCTTTCGTGGGTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCAt < 2:5213422/148‑1 (MQ=255) ccTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGGGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATgg > 1:7288385/1‑150 (MQ=255) cTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATTga > 1:4095042/1‑150 (MQ=255) ccAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCGGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGgacgac > 1:4985845/1‑150 (MQ=255) ccAACCCCGCGAGGCGGCGGCGTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGGTGCGGGGCCTGGGGGGGGGCGGGTCCGGTGCTCCGGCAGTGCTGGCCCGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGCGGGTTGCGCTGATCGGCTTCATGgccgac > 2:2306080/1‑150 (MQ=255) cAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGAcc > 1:2992897/1‑150 (MQ=255) aaCCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCa > 1:3326972/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTCCGTTGCTCCGGCCGTGCTGACCCGTGTGGTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGCCGACCACggg > 2:942640/1‑150 (MQ=255) cgcgAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTg > 1:2058506/1‑75 (MQ=255) gcgAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGca > 1:2131431/1‑150 (MQ=255) gcggcTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCGGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGGGCTGACCCGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGGTGCGCTGATAGGCTTCAGGGACGACCCCGGGGACGTcgccg > 2:1636273/1‑150 (MQ=255) gcggcTTGGCTTTCGTGGGCGCTTTCCGGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCGGAGAGGCTTCATGGACGACCCCGGGCACATcgccg > 2:2532042/1‑150 (MQ=255) ttggcttTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGc > 1:7183907/1‑150 (MQ=255) tttCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTggcg > 1:888086/1‑150 (MQ=255) ggcgcgTTCCGGGCGGCGTGGCCGGGCCGGGGGGGGGGCGGGCCCGCTCCCCCGGCCGCGCCCACCCGGGGGCGGCGGCCGGGGGCGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTg < 2:1878724/148‑1 (MQ=255) gTCGCTTTCCGGGGTGGGTGGCGGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCCCCGGCAGGGCTGCCCCGGGGGTGGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTg < 2:4266348/150‑1 (MQ=255) tttCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTGGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCAAATCGCCGCACGCGGGCGGCTGTTGGGGCa > 2:3462794/1‑150 (MQ=255) tttCCTGGCTGCGTAGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGTTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCAGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCa > 2:956890/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGAACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGTACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGGTGGGGCAtttt > 2:2088178/1‑150 (MQ=255) tGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCATTTTg > 1:2610076/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGCGGGGCCTGGGGCGGGGCGGGTACGTCCCCCCGCCCGGGCGGCCCAGCGACCCGGGGGCGCCCCCCCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCATTTTgcggc < 2:313084/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCATTTTGCggcggc > 1:813762/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCATTTTGCggcggc > 1:1232348/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGGCCAGGGGAGGGGCCGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGGGGTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCGGGTGGGGCAGTTTGCggcggc > 2:535881/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGGCCGGGGGTGGGGCGGGTCCGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCCGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGATGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCTCACGCTGGAGGCGGTTGGGGCATTTTGCGGCGGcc > 2:3197115/1‑150 (MQ=255) tGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCTCCGCACGGTGGCGGCTGTTGGGGCATTGTGCGGCGGCCGCtt > 2:3022913/1‑150 (MQ=255) tGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCATTTTGCGGCGGCCGCtt > 1:2111021/1‑150 (MQ=255) tGGGCCTGGGGTGGGGCGGCTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGGGTGGGGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCTCCTCGCCGCACGCTGGCGGCGGGTGGGGCCTGTTGCggcggcggcgt > 2:2047999/1‑148 (MQ=255) gggCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCATTTTGCGGCGGCCGCTTg > 1:4366079/1‑150 (MQ=255) | CTCGTGCTTGATGACCGCCGTGCTGCGCCGCTATGCGCTGTCCCGTAGCCTGTTGGACATCCCCAATGCGCGTAGCTCGCATACCTTGCCAACCCCGCGAGGCGGCGGCTTGGCTTTCGTGGTCGCTTTCCTGGCTGCGTTGCTGGGCCTGGGGTGGGGCGGGTACGTTGCTCCGGCAGTGCTGACCAGTGTGTTGGGGGCGGGGGGGCTGGTTGCGCTGATAGGCTTCATGGACGACCACGGGCACATCGCCGCACGCTGGCGGCTGTTGGGGCATTTTGCGGCGGCCGCTTGGGGGC > NC_002947/2032235‑2032533 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |