Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,039,340 | A→T | 5.2% | intergenic (+164/+1277) | pgi‑I → / ← PP_5477 | glucose 6‑phosphate isomerase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,039,340 | 0 | A | T | 5.2% | 962.9 / 17.7 | 278 | intergenic (+164/+1277) | pgi‑I/PP_5477 | glucose 6‑phosphate isomerase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (133/127); new base T (5/12); total (139/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
GCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGTTCACATCAAC > NC_002947/2039192‑2039488 | gCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTaa < 1:3791232/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTaa > 1:4570893/1‑150 (MQ=255) gctggaggaGCGTCAGATCGGAGCTGGTTGTCTCATGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTTAATAGCTGGCCGCTTTTCGACGCATATGTTGTACAGTCAACTGGGTAGGTAATTATCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTTATGctc < 2:503073/147‑1 (MQ=255) cggGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGctct < 2:1049087/150‑1 (MQ=255) cggGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGctct < 1:2873088/150‑1 (MQ=255) gggAGGAGCGTCCGAGCTGAGCTTGTGGTCGCCGGAAACACTAGCTCATCATGGAGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCTACTCAGAGGTGGTACAGTCAACTGTGTAGGTATTTCGCAGATTTTGTAATCCATCCAAGTGCTAATGCTCtt < 1:4885499/150‑1 (MQ=255) gggAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCtt < 1:2488750/150‑1 (MQ=255) aggagCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGAAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGa > 1:2103489/1‑150 (MQ=255) gagCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATg < 2:4902403/150‑1 (MQ=255) cGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATgggg < 1:4523539/150‑1 (MQ=255) cGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCACCCATCCAAGAGCATTAGCACTTGGATggat < 1:5722457/150‑3 (MQ=255) ccGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGAGCATTAGCACTTGGATggatgac < 2:3043633/150‑6 (MQ=255) cGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCa > 1:1038387/1‑150 (MQ=255) gAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGACTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAg > 1:5954973/1‑150 (MQ=255) aGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGt < 1:2610524/150‑1 (MQ=255) ggAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTccc > 1:1220831/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTccc > 2:2712639/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTccc > 2:1080206/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCa < 2:6574156/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCa < 1:3855750/150‑1 (MQ=255) ggtggtCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTtgt < 2:5416156/150‑1 (MQ=255) ggtggtCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGACTGAGCCCCatccaa < 2:3779969/150‑6 (MQ=255) gctggtCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTtgt > 2:5886330/3‑150 (MQ=255) gtggtCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATgggg > 2:4274169/1‑134 (MQ=255) gtggtCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATgggg < 1:4274169/134‑1 (MQ=255) tggtCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGa < 2:4486753/150‑1 (MQ=255) ggtCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGAc < 1:4033953/150‑1 (MQ=255) gCCTGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTaga < 2:3518129/150‑1 (MQ=255) gCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTaga < 2:1860834/150‑1 (MQ=255) gCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTaga > 2:2201078/1‑150 (MQ=255) ccGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTagag < 1:4608832/150‑1 (MQ=255) ccGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATGTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTagag < 2:6285260/150‑1 (MQ=255) cacTAGCGCCTCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGa < 2:6803815/150‑1 (MQ=255) acTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGaa > 1:7273772/1‑150 (MQ=255) acTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGaa < 2:201418/150‑1 (MQ=255) acTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGaa > 2:3380409/1‑150 (MQ=255) cTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCGTTTCGACGCTGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAAt < 2:2291936/150‑1 (MQ=255) cgcATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCGTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTAc > 2:7126155/1‑150 (MQ=255) catcatGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGACATCCATCCAAGTGCTTATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACaa < 2:5153072/150‑1 (MQ=255) catGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGc > 2:6973197/1‑150 (MQ=255) atGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCa < 1:3623750/150‑1 (MQ=255) ggTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCt < 1:3911163/150‑1 (MQ=255) gTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTg < 1:2360382/150‑1 (MQ=255) tGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGc > 1:5465234/1‑150 (MQ=255) tGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGc < 2:708558/150‑1 (MQ=255) ggAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGc < 2:6002036/149‑1 (MQ=255) gAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCt > 1:4974538/1‑150 (MQ=255) gAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCt < 2:3120842/150‑1 (MQ=255) tAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAAt > 1:5916807/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCt > 2:850412/1‑150 (MQ=255) ccGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCa > 1:1807750/1‑150 (MQ=255) cGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCaa > 2:2096512/1‑150 (MQ=255) gCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAAt > 1:3024266/1‑150 (MQ=255) cATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCCACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAAtt < 2:4828727/150‑1 (MQ=255) cATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAAtt < 1:4369224/150‑1 (MQ=255) ttCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGcc < 2:5798721/150‑1 (MQ=255) tCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGccc < 1:2722890/150‑1 (MQ=255) gagGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGa < 1:1321059/150‑1 (MQ=255) gagGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGa > 2:1973835/1‑150 (MQ=255) gtggtACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATgc > 2:3227120/1‑150 (MQ=255) gtACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCt < 1:3006531/150‑1 (MQ=255) tACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTg > 2:1604139/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTc < 1:6378979/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTc > 2:2869582/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTc > 2:7305165/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTc > 1:3415057/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTc > 2:3704218/1‑150 (MQ=255) ggtaggtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGaaa < 1:6032410/150‑1 (MQ=255) gtaggtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAAt < 1:4025960/150‑1 (MQ=255) taggtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGTGTCCTc < 2:6491115/143‑1 (MQ=255) aggtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGa < 1:6202275/150‑1 (MQ=255) ggtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGaa < 2:4155116/150‑1 (MQ=255) ggtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGaa > 2:6261079/1‑150 (MQ=255) ggtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGaa < 1:1718084/150‑1 (MQ=255) gtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAg > 1:6548246/1‑150 (MQ=255) gtaATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATATGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGaat > 1:5991845/1‑149 (MQ=255) aaTTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGAc > 2:614758/1‑150 (MQ=255) ttCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACgg < 2:4570893/150‑1 (MQ=255) ttCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACgg > 2:2905201/1‑150 (MQ=255) gCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTga > 1:3279651/1‑150 (MQ=255) aGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTgaga > 2:7247843/1‑150 (MQ=255) ttttGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGt < 1:6979798/150‑1 (MQ=255) tttGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAATACGGTGAGAGGTa > 1:2051507/1‑150 (MQ=255) catccatcCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACa < 2:5578698/150‑1 (MQ=255) atccatccAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAg > 1:2197411/1‑150 (MQ=255) atccatccAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAg > 2:5303633/1‑150 (MQ=255) atccatccAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAg > 1:1410460/1‑150 (MQ=255) atccatccAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAg > 1:6431251/1‑150 (MQ=255) atccatccAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAg > 1:3145330/1‑150 (MQ=255) atccatccAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAg < 1:5211478/150‑1 (MQ=255) cccatccaAGAGCATTAGCACTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAgg > 1:4676764/2‑150 (MQ=255) ccatccaAGAGCATTAGCACTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGTCTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTTATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTcc < 2:4029546/117‑1 (MQ=255) catccaAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCg > 2:608486/1‑150 (MQ=255) tccaAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGtt < 1:1590904/150‑1 (MQ=255) caAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGTTca < 1:88382/150‑1 (MQ=255) aaGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGTTcac > 1:6852011/1‑150 (MQ=255) aaGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGTTcac > 2:7264967/1‑150 (MQ=255) tGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGTTCACATc > 1:6606404/1‑150 (MQ=255) cTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGTTca > 2:5958943/1‑144 (MQ=255) cTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGTTCACATCaa > 1:2235341/1‑150 (MQ=255) | GCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGCGTTCACATCAAC > NC_002947/2039192‑2039488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |