| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,100,184 | 0 | G | C | 5.6% | 665.1 / 22.5 | 195 | intergenic (‑243/+74) | htpX/alaA | protease HtpX/glutamate‑pyruvate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (94/90); new base C (6/5); total (100/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
TGTGTACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGCAAGGTC > NC_002947/2100035‑2100333 | tgtgTACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcgg > 1:4808921/1‑150 (MQ=255) gtgtACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcggg < 2:524159/150‑1 (MQ=255) tgtACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcgggc < 2:6961081/150‑1 (MQ=255) 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tgtgAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCGTCAGG‑CAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCGTCCAgg > 1:5493636/1‑150 (MQ=255) tgAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGCACCTCGCGTAGCCCCCGGCGCCCCCCTCGAACCCGACAGCGAATAACCCTTCAGG‑AAAATGCCCATCCCGCCAATTTCCGCTTACAGGTc > 1:1571577/1‑150 (MQ=38) gcagaTCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCCCGTCGGACCACTCGTAGCCCCCCGCGCCCCCGGCGAACCCCACGGCGGAAAAACCATCAGGCAAATTG‑CGATCCCGCCAATTGCCGCATACAGGTc > 1:2988863/3‑150 (MQ=255) aTCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCg < 1:6647015/120‑1 (MQ=255) tCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCa < 2:6124307/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCa < 2:1297371/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCGACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCGTCCAGGTCATccc > 1:2305024/1‑149 (MQ=255) tCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCAACACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCCGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCa > 1:854324/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCCGCGCCCCCGTCGAACCCTACGGCGAAAAACCCGTCAGG‑GAATTGCCGATCCGGCCCATTGCCGCGTCCACGTCATCCAc > 1:5908031/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTGCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCAcc > 2:62693/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGGCGAACCCGACAGCGAAAAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCAcc > 2:6539008/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGGAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCCGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCGTCCAGGTCATCCAcc > 1:185769/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCCCCACCACCCCCCCGTCGAACCACTCGGAGCCCCCCGCGCCCCCGGCCAACCCGACTGCGAATAACCCGTCAGG‑AAATTGCCGAACCGGCCAAATGCCGCGTCCAGGTCATCCAccc > 1:3655498/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCCCGTCGAACCACTCGTAGCCCCCCGCGCCCCCCGCGAAACCTACAGCGAAAAACCCGTGAGG‑AAAATTCCGATCCGGCCAAATGCCGCGTCCAGGTCATACAccc > 1:2876237/1‑150 (MQ=255) cgccgcGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCCCCCCCGCGGCGAACCTCTCCGAGCCCCCCGCGCCCCCGGCGAACCCGACGGCGCAGAACCCATCACG‑GAAATGCCCCTCCCGCCCAATGCCCCGTCCCGGTCAACCCCCcgc > 2:6939512/1‑150 (MQ=255) cgccgcGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCcgc < 2:414791/150‑1 (MQ=255) ccgcGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAAACTCTCGTATCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACAGCGAATAAACCATAAGG‑AAATTTACGATCCGGCCAATTTCCGCTTCCAGGTAATACACCCGCgg > 1:6610147/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCCGCGCCCCCGTCGAACCCTACAGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGc > 2:2207848/1‑150 (MQ=255) ggcggcGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGCAAGGTc < 1:7049152/150‑1 (MQ=255) ggcggcGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCGACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGCAAGGTc < 2:3343629/150‑1 (MQ=255) | TGTGTACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGTCGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGG‑AAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGCAAGGTC > NC_002947/2100035‑2100333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |