| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,430,856 | T→G | 7.3% | E33D (GAA→GAC) ‡ | PP_2126 ← | LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,430,856 | 0 | T | G | 7.3% | 800.6 / 12.1 | 279 | E33D (GAA→GAC) ‡ | PP_2126 | LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (93/155); new base G (24/3); total (121/158) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.27e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
ACAGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACA > NC_002947/2430708‑2431005 | gATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGcc > 2:1808170/1‑150 (MQ=255) gATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGcc > 2:3504461/1‑150 (MQ=255) gATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTCGcc > 1:382733/1‑150 (MQ=255) tCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGccca > 1:6716589/1‑148 (MQ=255) aGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGAcc > 1:5905661/1‑150 (MQ=255) gCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GAAGCCGAcga < 2:7386947/150‑3 (MQ=255) cTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTAGCCGACCACgg > 1:2230678/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCa > 2:4358787/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCAt < 1:3769809/150‑1 (MQ=255) cAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCATGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAg < 1:4553763/150‑1 (MQ=255) aGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCAAAGc > 2:3351834/1‑150 (MQ=255) gTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCg < 2:1263901/150‑1 (MQ=255) gTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCg < 1:804502/150‑1 (MQ=255) gTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCg < 2:73107/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGata > 2:2548521/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGata < 1:6080138/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATc < 1:2482975/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATc < 2:5413953/150‑1 (MQ=255) gCTGGCACGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCAGGTCGAACGAATGGAGATGTCCAGCAAGAAGATGTCGGGCGCCAGAGAGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTAGCCGTCGTCGGC‑ATATACGAACACGACATATCCCGGTatata > 2:5247287/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTAGCCCCCCACAGCAAAGCCGGGGatatag > 1:1002539/1‑148 (MQ=255) cTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTAGCCCACCCCCGCCAAGCCCGGGGTATCg > 1:1002676/1‑150 (MQ=255) tGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGGCATAGCCGGGGATATAGc > 1:6757094/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCa < 1:2857717/150‑1 (MQ=255) cccGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGa < 2:1660048/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGAc < 1:131797/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCCCCCACCACCGCCTAGCCGGGGGTAACGCaacc > 1:5623896/1‑147 (MQ=255) tGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGcc < 2:3708531/150‑1 (MQ=255) gggTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGccc < 1:5436962/150‑1 (MQ=255) gggCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGCTATCGCAGACCAGTGCCCGCAccc > 2:832217/1‑150 (MQ=255) gggCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCa < 1:7285205/133‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTGGGCGTATGCCG‑CCACCGCCTATACGGGGGTATAGCAGACCCGTGCCCCCACCCCcgcg > 1:1280820/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTCGCCCACCACCGCAAAACCGGGGATATAGCAAAAAAGTGCCCCCACCCCCCcgcg > 1:6421790/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGgctatg < 2:4110296/150‑5 (MQ=255) aGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCgg < 2:6493085/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTGGGC‑TTGGCCGACCACCTCAAAGCCGGGGGTATAGCAGAACACTGCCCGCACCCCCGCCCGGag > 1:3885831/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGATCGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGc < 1:3537008/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTGGGG‑GTGGCCGGCCCCGGCAAAGCCGGGGGTATCGCAGCACAGAGCCCGCACCCCGGCGCGGGTCAGc > 1:681053/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGc < 1:5407626/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGc < 2:3939253/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGc < 2:6910638/150‑1 (MQ=255) gTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAg < 1:6162546/150‑1 (MQ=255) gTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAg > 2:4732586/1‑150 (MQ=255) gTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTAGCCCCCCACCGCAAAGCCGGGGGTAAAGCAGAACACTGCCCGCCCCCCCGCGCGGCTCAGcccc > 1:1990369/1‑147 (MQ=255) tCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGt < 2:3249275/150‑1 (MQ=255) gAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTgg > 2:7445827/1‑150 (MQ=255) aCGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTc < 1:2974283/150‑1 (MQ=255) cGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCa < 2:5801675/150‑1 (MQ=255) cATGGAGATGTCCAGCAAGATGAGGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATc < 2:5642101/150‑1 (MQ=255) aTGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCAACt > 2:6298309/1‑150 (MQ=255) tGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCCCCCCCGGCCAAGCCCGGGGTATCGCACAACACTGCCCGCCCCCCCGCGCGGCTCAACCGGGGGTCAACTa > 1:5820552/1‑150 (MQ=255) tGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCCCCGACCACGTCATAGCCGGGGCTATCGCACACCAGTGCCCCCACCCCGGCGCGGATCACCGAGTGGTCATCTa > 2:5015817/1‑150 (MQ=255) ggAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGG‑GGGGCCCGACACGGCATAGCCGGGGATATAGCCAAACAATGCCCCCCCCCCCGCGCCGCTAAGCGAGGGGTGAACTAc > 1:7056487/1‑150 (MQ=255) ggAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTAc < 1:3044248/150‑1 (MQ=255) ggAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTAc > 2:5994978/1‑150 (MQ=255) ggAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTAc < 1:5155471/150‑1 (MQ=255) agaTGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACca < 1:6969186/150‑1 (MQ=255) tGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACcagca < 1:6708522/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTCGCCCACCACCTCAAAGCCGGGGATATAGCAGACCACTGCCCGCACCCCCGCGCGGATCACCCAGGGGTCATCGACccgcag > 1:1183643/1‑150 (MQ=255) tCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTAGCCCACCACGTCATAGCCCGGGGTATCGCCCACCAGTGCCCCCACCCCCGCGCGGATCAGCGAGTGGTCAACAACCAGCagt > 1:4827743/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCagta < 2:4286890/150‑1 (MQ=255) gatgatGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACa < 1:464506/150‑1 (MQ=255) gatgatGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACa < 2:4946464/150‑1 (MQ=255) gatgTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTAGCCCACCACGTCATATCCGGGGATATAGCAGAACAGAGCCCGCACCCCCGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATAAAACACCAGTATTCTACAGGt > 2:1519458/1‑150 (MQ=255) gatgTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGCTATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCCGCGCGGATCAGCGAGGGGTGCTCTACCAGCAGGATTCTTAAGGt > 2:5584462/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtgg < 1:3311729/150‑1 (MQ=255) cgcCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggttgg < 1:399772/150‑1 (MQ=255) cgcCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggttgg < 1:1105429/150‑1 (MQ=255) cgcCAGTGTGCGTACCGGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggttgg < 1:3602090/150‑1 (MQ=255) gcCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGGCCACGTGATATCCGGGGCTATCGCAGTCCAGTGCCCGCCCCCCGGCGCGGCTCCGCGAGGGGTCATCTAACAGCCGGAGTCTACCGGTGCttgttggt > 2:307587/1‑150 (MQ=255) ccAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTa < 2:7182355/150‑1 (MQ=255) cAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTaa < 2:2063240/150‑1 (MQ=255) aGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGa < 1:4884502/49‑1 (MQ=255) aGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAAt < 2:169547/150‑1 (MQ=255) gtgtGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATa < 1:7167746/150‑1 (MQ=255) gtgtGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCCACCACGGCATAGCCGGGGATATCGCCGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCCGTAGTGTACAGGTCCTGGGTGGTAATa > 2:193002/1‑150 (MQ=255) gCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTcc < 2:4619705/150‑1 (MQ=255) cGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCt < 1:1771833/150‑1 (MQ=255) gTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑GTCGCCCCCCACCTCATAGCCGGGGATATCGCACACCACTGCCCCCACCCCCGCGCGGAACAGCGAGTGGTCAACTACCAGCAGGAGTCTACACGTCATGGTTGGTAAAACAccag > 1:4244592/1‑148 (MQ=255) cTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGgcgc < 1:4344200/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGAACACCTCATAGCCGGGGGTATCGCACACCACTGCCCGCCCCCCCGCGCGGAAAAGCGAGTTGTCAACAAACACCAGTAGTCGACACGTAATGGGTGGTAAAACTCCATgcgc > 2:2818954/1‑150 (MQ=255) gAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCt < 1:1808170/150‑1 (MQ=255) gAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCt < 2:1579487/150‑1 (MQ=255) gAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCt < 1:2670644/150‑1 (MQ=255) gAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCt > 2:4675725/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTgg < 2:7032443/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTgg < 1:495071/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTgg < 1:855358/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCCCCCACCACCGCAAAGCCGGGGATATAGCACACCAGTGCCCCCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCAACCAGCAGTAGTCAACAGGTCAGGGTTGGTAATACACCTGGCGCGTTGCTgg > 2:143953/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGt < 2:10232/150‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTAGCCGAACACGTAATAACCGGGGATAACGCAGACCAGTGCCCCCACCCCGGCGCGGATCACCGAGTGGTCATCAACCACCAGTAGTCTACAGGTCAAGGTTGGTAATAATCCAGGCGCGGTTCTGGGTg > 2:2939358/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑ATCCCCGACCACGACAGCGCCGGGGAAATCGCATACCACTGCCCCCCCCCCGGCGCGGCTCCGCGAGTGGTGATCTACCAGCACTAGTCTACAGGTCATCGTGTGTAATACTCCTGGCGCGGTGCTGGGTg > 2:6685518/1‑150 (MQ=255) tgacgtggtCGGC‑GAAGCCGACGACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAGGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCggg > 2:4864351/4‑150 (MQ=255) tcgtcgGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAg < 2:6165268/102‑1 (MQ=255) tcgtcgGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCa < 2:3025117/150‑1 (MQ=255) cgGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACggg > 1:1431749/1‑150 (MQ=255) ggC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGa > 2:2716602/1‑150 (MQ=255) ggC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGa > 1:660332/1‑150 (MQ=255) gC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGaa > 1:3298925/1‑150 (MQ=255) c‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAAc > 1:6189590/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACa > 2:4762075/1‑150 (MQ=255) | ACAGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGC‑TTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACA > NC_002947/2430708‑2431005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |