Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,798,750 | 0 | G | T | 10.2% | 584.2 / 39.6 | 189 | intergenic (+67/+60) | PP_2445/PP_2446 | membrane protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (77/92); new base T (6/14); total (83/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
CCATGGCGTTCTCGACGGCTATCGAGGTCCTCAACATCCTGGCCCGTCGAGCGCGTTTGAAGCGTGAGGCGGCTGAAGGTTGATGTAAAAAGGGGCGCCTCGCGCCCCTCTTGCGGACAAGCCCGCTGCACAGGTATTCGCGTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCA > NC_002947/2798601‑2798898 | cATGGCGTTCTCGACGGCTATCGAGGTCCTCAACATCCTGGCCCGTCGAGCGCGTTTGAAGCGTGAGGCGGCTGAAGGTTGATGTAAAAAGGGGCGCCTCGCGCCCCTCTTGCGGACAAGCCCGCTGCACAGGTATTCGCGTGGCACTgg < 1:6628076/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTTCTCGACGGCTATCGAGGTCCTCAACATCCTGGCCCGTCGAGCGCGTTTGAAGCGTGAGGCGGCTGAAGGTTGATGTAAAAAGGGGCGCCTCGCGCCCCTCTTGCGGACAAGCCCGCTGCACAGGTATTCGCGTGGCACTGGc < 2:6487329/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCTCGACGGCTATCGAGGTCCTCAACATCCTGGCCCGTCGAGCGCGTTTGAAGCGTGTGGCGGCTGAAGGTTGATGTAAAAAGGGGCGCCTCGCGCCCCTCTTGCGGACAAGCCCGCTGCACAGGTATTCGCGTGGCACTGGCaa < 1:5877224/150‑1 (MQ=255) 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ttCGCGTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGtgtg > 2:5390604/1‑150 (MQ=255) ttCGCGTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGtgtg > 1:4929004/1‑150 (MQ=255) ttCGCGTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGtgtg > 1:5598975/1‑150 (MQ=255) ttCGCGTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGAGCAACCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGtgtg > 1:615510/1‑150 (MQ=255) tCGCGTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGtgtgt > 1:2122777/1‑149 (MQ=255) gcgTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCAt > 2:3358758/1‑150 (MQ=255) gcgTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCACGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCAt > 1:6749856/1‑150 (MQ=255) gTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGa < 1:7319287/150‑1 (MQ=255) gCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGAcgc > 1:411088/1‑150 (MQ=255) aCTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGAcgccg > 2:905788/1‑150 (MQ=255) cTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGAcgccgc > 2:5849979/1‑150 (MQ=255) tGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCa > 1:5064170/1‑150 (MQ=255) tGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCa > 2:2573103/1‑150 (MQ=255) | CCATGGCGTTCTCGACGGCTATCGAGGTCCTCAACATCCTGGCCCGTCGAGCGCGTTTGAAGCGTGAGGCGGCTGAAGGTTGATGTAAAAAGGGGCGCCTCGCGCCCCTCTTGCGGACAAGCCCGCTGCACAGGTATTCGCGTGGCACTGGCAACGCGAATACCTGTGCAGCGGGCTTGTCAGTCAGTGGGCTTCGGGAAATCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCA > NC_002947/2798601‑2798898 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |