Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,801,831 | A→C | 5.7% | intergenic (+23/‑109) | PP_t43 → / → PP_2449 | tRNA‑Val/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,801,831 | 0 | A | C | 5.7% | 1022.5 / 34.5 | 296 | intergenic (+23/‑109) | PP_t43/PP_2449 | tRNA‑Val/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (152/127); new base C (10/7); total (162/134) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 |
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
AAGAGCTTTACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGCCCTGG > NC_002947/2801683‑2801979 | aaGAGCTTTACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAAt > 2:3054456/1‑150 (MQ=255) gagCTTTACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGa < 2:4554704/150‑1 (MQ=255) gagCTTTACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGa > 1:2746582/1‑150 (MQ=255) agCTTTACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGAt < 2:6020488/150‑1 (MQ=255) tttACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATGGc > 1:3992579/1‑150 (MQ=255) tttACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGc > 1:6173214/1‑150 (MQ=255) tACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCATTTCTGATCGccc < 2:5704841/150‑1 (MQ=255) aGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAATGGGCGATCAGAAATGATCGCCCttt > 2:1884872/1‑150 (MQ=255) gTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCttttt < 1:3309916/150‑1 (MQ=255) cGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCa < 1:2225811/150‑1 (MQ=255) aTCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCAttt > 1:5192981/1‑150 (MQ=255) aTCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCAttt > 2:7274371/1‑150 (MQ=255) aTCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCAttt > 1:4512934/1‑150 (MQ=255) aTCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCAttt > 2:404155/1‑150 (MQ=255) cGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTgc > 2:1366508/1‑150 (MQ=255) ggCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTgcgc > 1:1703277/1‑150 (MQ=255) ccACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGccc > 1:3231252/1‑150 (MQ=255) aCTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGa > 2:1716201/1‑150 (MQ=255) tAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAag > 2:880761/1‑150 (MQ=255) tAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAag > 2:4989334/1‑150 (MQ=255) atGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAagcagc > 2:5796131/1‑150 (MQ=255) gcgcACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCCTTTGCGCCCGAAGCAGCgt > 1:3353368/1‑150 (MQ=255) gcgcACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCgt < 1:5319054/150‑1 (MQ=255) gcACCACACGACATGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCgtgt < 1:6609854/150‑1 (MQ=255) gcACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGcc > 2:3132000/1‑137 (MQ=255) caccacACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAGATGATCg > 2:7364854/1‑117 (MQ=255) caccacACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTa < 1:7222977/150‑1 (MQ=255) caccacACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTa < 2:69612/150‑1 (MQ=255) ccacACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAAc < 1:6032081/150‑1 (MQ=255) cacaCGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAAt < 2:1760930/109‑1 (MQ=255) acacGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGt > 2:204990/1‑150 (MQ=255) cacGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGtt < 1:3792983/150‑1 (MQ=255) cacGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGtt < 2:4162670/150‑1 (MQ=255) acGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAACTCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGttt < 2:5883877/150‑1 (MQ=255) cGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTg < 1:3431703/150‑1 (MQ=255) gACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTgg < 1:6854876/150‑1 (MQ=255) aCAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGt < 1:5713684/150‑1 (MQ=255) aCAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGt < 2:3199501/150‑1 (MQ=255) cAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTGTGGTc > 2:3250349/1‑150 (MQ=255) aGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCATTTCTGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTcg > 2:1953894/1‑150 (MQ=255) gCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTcgcg > 1:5862678/1‑150 (MQ=255) gCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTcgcg > 1:689562/1‑150 (MQ=255) cacaTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCgg < 2:5500613/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCgg < 2:282260/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCgg < 1:7037985/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGCCGCGGTCCgg < 1:1316919/150‑1 (MQ=255) cAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTcgcg > 1:5780697/1‑140 (MQ=255) ttGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAATCAGCGTGTAACGGTTGGTCGCGGTCCGGGCATAcc > 2:3738448/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATAcc > 1:2059653/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATAcc > 2:4719630/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGAATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATAcc > 1:3881307/1‑150 (MQ=255) gagCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGt < 2:479354/150‑1 (MQ=255) gagCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGt > 2:335001/1‑150 (MQ=255) accTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGaa < 1:4022443/150‑1 (MQ=255) ccTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAAt < 2:1247987/150‑1 (MQ=255) ccTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCAATTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGaaa < 1:547580/150‑2 (MQ=255) cTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATc > 2:4393769/1‑150 (MQ=255) cTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATc < 2:6130403/150‑1 (MQ=255) cTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATc > 1:474518/1‑150 (MQ=255) cTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATc > 1:2899363/1‑150 (MQ=255) cgcagaTGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAATGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATcc > 2:5584711/6‑150 (MQ=255) aCATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGcc > 2:5426293/1‑150 (MQ=255) cctggtggGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGccc < 2:761465/148‑1 (MQ=255) ggtggGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCtt > 2:1640208/1‑150 (MQ=255) ggggTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGaa > 2:5248598/1‑150 (MQ=255) gggTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAAt < 1:6764485/150‑1 (MQ=255) cGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTgg < 2:2332562/150‑1 (MQ=255) gTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGa < 1:6415374/150‑1 (MQ=255) ttGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAg < 2:3538891/150‑1 (MQ=255) ttGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAg > 2:363652/1‑150 (MQ=255) ttGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAg < 2:1458954/150‑1 (MQ=255) gAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACAcg > 1:2401539/1‑150 (MQ=255) tCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGt < 1:3663447/150‑1 (MQ=255) ccAATTGTGCCTACCAAATCGAAATAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTg > 1:4906533/1‑150 (MQ=255) aaTTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTgcg > 1:7390486/1‑150 (MQ=255) ttGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCa > 1:4105504/1‑150 (MQ=255) tACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGc > 2:5689424/1‑150 (MQ=255) aCCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCt < 1:5143519/150‑1 (MQ=255) ccAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCtg > 2:7096141/1‑150 (MQ=255) cAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCtgt > 2:3892201/1‑150 (MQ=255) aaaTCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCtgtg > 2:6387980/1‑150 (MQ=255) aaTCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTgg > 1:4291473/1‑150 (MQ=255) aaTCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTgg < 1:5959369/150‑1 (MQ=255) cGAAAAAGGGCTTTCAGAAATGTTCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTaa < 1:89403/150‑1 (MQ=255) cGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTaa < 1:2348100/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATg > 2:5137601/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATg > 1:2976941/1‑150 (MQ=255) aaaaGGGCGATCATTTCTGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTgc > 2:6462214/1‑129 (MQ=255) aGGGCGATCAGAAATGATCGCCCATTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCAGACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAg < 2:1067586/150‑1 (MQ=255) gggCGATCATTTCTGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGt > 1:1282961/1‑150 (MQ=255) gggCGATCATTTCTGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGt > 1:5209643/1‑150 (MQ=255) ggCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGACTCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTg < 2:6894882/150‑1 (MQ=255) aTCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCg > 2:2549451/1‑150 (MQ=255) tCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGc > 1:3383726/1‑150 (MQ=255) tCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGc < 1:4993159/150‑1 (MQ=255) tCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGc < 1:1884872/150‑1 (MQ=255) aGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGccc > 1:73582/1‑150 (MQ=255) gAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGCCCt > 1:4697121/1‑150 (MQ=255) gAAATGATCGCCCATTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGCCCt < 2:6602314/150‑1 (MQ=255) aaaTGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGCCCTg < 2:2772327/150‑1 (MQ=255) | AAGAGCTTTACAGGTACGCATCGGGCCACTAATATGCGCACCACACGACAGGCACATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGTGCCTACCAAATCGAAAAAGGGCGATCAGAAATGATCGCCCTTTTTGCATTTGCGCCCGAAGCAGCGTGTAACGTTTGGTCGCGGTCCGGGCATACCCCGGCGTGCTAGAATCCGCCCCTTCGAATCTGGAGGTACACGCGTGCGCAAACTGGCTGTGGTAATGGCAGTGCTCGCCCTGG > NC_002947/2801683‑2801979 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |