Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 2,807,984 | A→T | 5.2% | K459M (AAG→ATG) ‡ | rbsA‑I → | ribose ABC transporter ‑ ATP‑binding subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,807,984 | 0 | A | T | 5.2% | 1104.4 / 34.5 | 324 | K459M (AAG→ATG) ‡ | rbsA‑I | ribose ABC transporter ‑ ATP‑binding subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (139/167); new base T (15/2); total (155/169) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.93e-01 |
Only 100 of 368 total aligned reads displayed.
GTCTGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGTTATC > NC_002947/2807835‑2808133 | gTCGGGCGGTAACCCGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCcaaggcaa < 2:5921585/150‑1 (MQ=255) tCTGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCcaaggcaag < 2:4956453/150‑1 (MQ=255) cGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGCGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCtt < 1:1006870/150‑1 (MQ=255) ggTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtg < 2:5940832/150‑1 (MQ=255) gTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCCGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtgg < 1:3000136/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtgg > 2:6082378/1‑150 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCTGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg > 1:6891972/1‑150 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg < 2:4306460/150‑1 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg > 1:2347221/1‑150 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg < 2:207827/150‑1 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtgg < 1:6119826/145‑1 (MQ=255) gcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTggtggtggt > 2:3752572/1‑150 (MQ=255) gcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTggtggtggt > 2:4341615/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTc < 1:626032/150‑1 (MQ=255) ggtggtGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAg > 2:1539609/1‑150 (MQ=255) ggtggtGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGGGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAg < 2:2558748/150‑1 (MQ=255) gATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCt < 1:4416867/150‑1 (MQ=255) gATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCt > 1:3591905/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTg > 2:3966959/1‑150 (MQ=255) tCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTgc > 2:3726732/1‑150 (MQ=255) cGGCCGCTGTCTGGAGCTCGATTTCCAGGTGCTTCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCATGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGTCAAGGCCTTGGTGGTGGTTTCCAGTGACCTgcg < 2:3543606/150‑1 (MQ=255) cGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTgcg < 1:5211755/150‑1 (MQ=255) cGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGaa < 1:1539609/150‑1 (MQ=255) gctggctgGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAAc < 1:4968196/150‑1 (MQ=255) gctggAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGAt < 1:5534469/150‑1 (MQ=255) gctggAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGAt < 2:6273596/150‑1 (MQ=255) gctggAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGAt > 2:1178723/1‑150 (MQ=255) aGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGa > 1:3408836/1‑150 (MQ=255) aGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGa < 2:1446007/150‑1 (MQ=255) gcgATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGAttt < 1:5251867/150‑1 (MQ=255) gcgATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGAttt < 2:5584144/150‑1 (MQ=255) gATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGAtttac < 2:784648/150‑3 (MQ=255) gATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGc > 2:6972421/1‑150 (MQ=255) 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tGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGa > 2:7258269/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGAcc > 1:1806929/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAg < 1:3849137/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGt < 2:2347231/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGttgctt < 2:1351649/150‑1 (MQ=255) 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gcgcCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCtt > 2:6576314/1‑150 (MQ=255) gcgcCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAATTGCTTGCCGCCGCCtt > 1:4161137/1‑150 (MQ=255) ccaccAAGGCCTTGCCTTGGCGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCtt > 1:6568564/4‑150 (MQ=255) caccAAGGCCTTGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTg > 1:5983129/3‑85 (MQ=255) gcCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCg > 2:5277073/1‑150 (MQ=255) accAAGGCCTTGCCTTGGCGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCg > 1:6426974/2‑150 (MQ=255) ccAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGc > 2:3022807/1‑150 (MQ=255) caaggcaaggCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGcc > 1:4895720/1‑150 (MQ=255) aaggcaaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCg > 2:3473765/1‑150 (MQ=255) aggcaaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCgg > 1:2519500/1‑150 (MQ=255) ggcaaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGt < 1:1939217/150‑1 (MQ=255) gcaaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGtt < 1:6972421/150‑1 (MQ=255) aggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGTCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGTTATc < 1:966127/150‑1 (MQ=255) aggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGTTATc > 1:67608/1‑150 (MQ=255) | GTCTGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGTTATC > NC_002947/2807835‑2808133 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |