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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 3,305,592 | 0 | C | T | 5.7% | 1079.3 / 34.7 | 335 | E103K (GAG→AAG) ‡ | lpxH | UDP‑2,3‑diacylglucosamine hydrolase |
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Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
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ccTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTg < 1:2016058/148‑1 (MQ=255) cTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCa > 2:203685/1‑150 (MQ=255) cTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCa > 2:1174339/1‑150 (MQ=255) gTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGa > 1:1930710/1‑150 (MQ=255) caccacCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCg > 2:2343307/1‑150 (MQ=255) acgaccccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTg < 1:4800727/114‑1 (MQ=255) accaccCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGa > 2:5363224/1‑150 (MQ=255) gaccccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGAc > 1:7266840/4‑150 (MQ=255) gaccccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGAc > 1:4235979/4‑150 (MQ=255) caccCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGAct > 1:252853/1‑150 (MQ=255) accccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGAct > 2:546060/3‑150 (MQ=255) ccccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActg > 2:7272369/2‑150 (MQ=255) accCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActg > 2:3126480/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgct > 2:4880150/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGACGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgct > 1:7027322/1‑150 (MQ=255) tCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGAAGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAg > 1:4118829/1‑150 (MQ=255) | TGCCAGCTTGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAG > NC_002947/3305443‑3305740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |