| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 3,305,597 | 0 | A | G | 5.6% | 1115.1 / 32.9 | 337 | V101A (GTG→GCG) ‡ | lpxH | UDP‑2,3‑diacylglucosamine hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (143/175); new base G (11/8); total (154/183) | |||||||||||
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Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
TTGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGCGT > NC_002947/3305450‑3305745 | ttGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACg > 2:1080713/1‑150 (MQ=255) tGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGc < 1:1040302/150‑1 (MQ=255) gTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCt > 2:5134914/1‑150 (MQ=255) 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ccTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGc < 2:532120/150‑1 (MQ=255) cTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCa > 2:790180/1‑150 (MQ=255) cTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCa > 2:1174339/1‑150 (MQ=255) cTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCa > 2:203685/1‑150 (MQ=255) cTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCa > 1:5128527/1‑150 (MQ=255) gTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGa > 2:5818313/1‑150 (MQ=255) ttCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGAt < 1:5282672/150‑1 (MQ=255) accaccCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGa > 2:5632081/1‑150 (MQ=255) gaccccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGAc > 1:7266840/4‑150 (MQ=255) caccCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGAct > 1:4265737/1‑150 (MQ=255) accCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActg > 2:4900494/1‑150 (MQ=255) cccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgc < 1:6368347/150‑1 (MQ=255) cccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgc < 2:1455621/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgct < 1:2171574/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgct > 2:4724321/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGACGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgct > 1:7027322/1‑150 (MQ=255) cTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGaa > 2:3799359/1‑150 (MQ=255) aTCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGc < 2:6111199/150‑1 (MQ=255) aTCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGc < 1:3748785/150‑1 (MQ=255) aTCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGc < 1:1867788/150‑1 (MQ=255) | TTGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGCGT > NC_002947/3305450‑3305745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |