Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 3,305,598 | 0 | C | A | 5.6% | 1154.8 / 41.7 | 337 | V101L (GTG→TTG) ‡ | lpxH | UDP‑2,3‑diacylglucosamine hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (143/175); new base A (11/8); total (154/183) | |||||||||||
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Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
TTGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGCGTCA > NC_002947/3305450‑3305747 | ttGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACg > 1:6675851/1‑150 (MQ=255) tGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGc < 1:1040302/150‑1 (MQ=255) gTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCt > 2:5134914/1‑150 (MQ=255) 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cTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCa > 2:790180/1‑150 (MQ=255) gTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGa > 2:5818313/1‑150 (MQ=255) gTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGAAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGa > 1:5640038/1‑150 (MQ=255) ttCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGAt < 2:2036615/150‑1 (MQ=255) caccacCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCg > 2:2343307/1‑150 (MQ=255) acgaccccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTg > 2:4800727/6‑119 (MQ=255) accaccCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGa > 2:5632081/1‑150 (MQ=255) gaccccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGAc > 1:4235979/4‑150 (MQ=255) gaccccAGCGTGATCGAGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGAc > 1:7266840/4‑150 (MQ=255) accCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActg > 2:4900494/1‑150 (MQ=255) accCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActg > 2:3126480/1‑150 (MQ=255) cccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgc < 1:4619754/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgct < 1:2171574/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgct > 2:4724321/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGActgct > 2:4123/1‑150 (MQ=255) cTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGaa > 2:3799359/1‑150 (MQ=255) cTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGaa < 1:5056013/150‑1 (MQ=255) aTCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGc < 1:3748785/150‑1 (MQ=255) aTCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGc < 1:1867788/150‑1 (MQ=255) cGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGCGTCa < 2:1175116/150‑1 (MQ=255) | TTGTAGCGGGCCGACAGCGGCAGGTGGCGTAGGATCCACAAGCTCAGCGGATTGCGTAGCAGGCGGCGCATCTTCATGTAGCCCAGGTCGCGGGTGCACAGGGTGTCGCCATGCATCAGCAGCACCTGTTCACCACCCAGCTCGATCACGCTGGGGTCGTTCAACAGCGTGCAGCCCGCAGCTTTGCAAAAGGCCTGGCCAATCAGGAAGTCACGGTTGCCATGCATCAGGTAGATGGCCGTGCCACTGTCGCTCAGCCGGCGCATGGCCTGGCAGATCGACTGCTGGAAGGGCGTCA > NC_002947/3305450‑3305747 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |