| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,781,367 | C→G | 13.2% | intergenic (+57/‑86) | PP_3338 → / → PP_3339 | cytochrome bd‑type quinol oxidase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,781,367 | 0 | C | G | 13.2% | 448.8 / 14.2 | 181 | intergenic (+57/‑86) | PP_3338/PP_3339 | cytochrome bd‑type quinol oxidase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/108); new base G (21/5); total (68/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TCGATCAGCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTCAACCTGC > NC_002947/3781218‑3781516 | tCGATCAGCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTgc < 1:1035099/150‑1 (MQ=255) aTCAGCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGcc > 2:5349419/1‑150 (MQ=255) aTCAGCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGcc > 1:1977768/1‑150 (MQ=255) tCAGCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCCTCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCt < 2:7309133/150‑1 (MQ=255) tCAGCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCt < 1:1296551/150‑1 (MQ=255) aGCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGc < 2:6291632/150‑1 (MQ=255) gCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGGGCCGGCg > 1:1209417/1‑150 (MQ=255) gCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGCCGGCg > 1:6654362/1‑150 (MQ=255) cATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGa < 2:2375704/150‑1 (MQ=255) aTCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGGGCCGGCGAc > 1:1662884/1‑150 (MQ=255) aTCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCACAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCGGCGAc > 1:1075830/1‑150 (MQ=255) tGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGGGCCGGCgcccaa > 1:5690322/1‑145 (MQ=255) gAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAg < 1:1883684/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGCCGGCGACAAAAAg > 1:4853140/1‑150 (MQ=255) aGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGgc < 2:3128630/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGgcgc < 2:6131025/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGgcgc < 1:7093057/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCGGCGACAAAAAGgcgc > 2:3873406/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGCCAGCGACAAAAAGgcgc > 2:115080/1‑150 (MQ=255) gCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGGGCCTGCGACAAAAAAgcgccc > 1:4761838/1‑148 (MQ=255) gCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGcac < 2:105370/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGcac > 2:4314039/1‑150 (MQ=255) gCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGGGCCGGCGCCCAAAACgcgccc > 1:730436/1‑148 (MQ=255) gCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGGCTGCGACCAAAAGGCGcac > 1:2441623/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGcacc < 1:2274973/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGcaccac < 2:1988818/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGcaccac < 2:6675276/150‑1 (MQ=255) ccccAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGGCTGCGCCAAAAAGGCGCGCCCCggccca > 2:4016303/1‑146 (MQ=255) agagCCATGGATTCATGGTGGTAGGCACAGTGTTACTCCTGCCCCTTTCGCTTGGCTGATCCGACTTTACAGGAGGGCCGCCGGCATGCGCAGCCTTTGAGCCCGCGCGTTGGTGCGCCTGCCACAAAACGGCGCCCCACGGAACTTGTa < 2:4646623/150‑1 (MQ=255) agagCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTa < 2:6157943/150‑1 (MQ=255) caaaGGCTTCATGCTGTTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCTACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCAATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGc < 2:4178915/148‑1 (MQ=255) aaGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGGGCCTGGGGCAAAATGGGGCCCCACGGAACTTGTTCAGccc > 2:1682182/1‑150 (MQ=255) ttCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCAGCGGCAAAAAGGCGCACCACGGAACGTGTACAGCCCGCAAc > 1:3031410/1‑150 (MQ=255) ttCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGCCGGCGCCAAAAAGGCGCCCCCCCGCACATGTAAAGccccccac > 1:5912432/1‑145 (MQ=255) aTGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAAGCGCACCACGCAACAATTACAGCCCGCAAAGGa > 2:2392180/1‑150 (MQ=255) tGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGGGCCGGCGCCCAAAAAGCGCCCCCCCGCACGTGGGCAGCCCCCAAccgcg > 1:3306351/1‑146 (MQ=255) cTGGTTGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCTTGTTGGCCGCCGGCTTGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGc < 2:5387268/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCACCGTGTTCACCCTCCCCAGTTCGCTGGGCTGACCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGACCCCTCGCGGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCgg < 2:4635608/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCgg < 2:7403259/150‑1 (MQ=255) acacTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGca > 2:895880/1‑110 (MQ=255) cacTGTTCATCCTGCCCTGTTCGATTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCTTGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCTACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATgc < 2:1823422/150‑1 (MQ=255) acTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAATGCGCACCACCGAACATGTAAAGCCCCCAACCGATTCGGCTTAAAgcg > 2:153898/1‑150 (MQ=255) tGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGCCGGCGGCAAAAAAGCGCCCCACCGAACATGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTTATtcgcg > 2:3543136/1‑150 (MQ=255) aTCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCGGCGCCAAAAAAGCGCCCCCCCGAACTTTTAAAGCCCGCCACCGGTGCGGCTTAATGCGCGcccaa > 1:5477360/1‑147 (MQ=255) ccTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCCACCGATGCGGCTTAATGCGCGCCCTAtt > 2:4732963/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGGGGCTGGGTGAAAAATGGGCGCCACGGGAATTTTAAAGGCCGCAAAGGTTTGGGGTTTTTGGGCGGCATAtttg > 2:971041/1‑148 (MQ=255) ccctcttCCCTTGGCTTACCCGACTGTTAATTATGCCCCCCGCAATCCCAAGCAATTGACCCCTCGCCGTGTTCCCCCTCCGAAAAAAACCCCCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCt < 2:2781524/145‑1 (MQ=255) cccAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACCGAACATTTTAAGCCCCCCACGGATGCGGCGAAATGCGCGCCCAATTCGca > 1:6743694/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGCACGTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCGTAAAGCGCGCCAAATTCGCTc > 2:5334001/1‑150 (MQ=255) tgTTCGGTTGGCTGAGCCTTCTGTTCTTGCGGGCCGCCGGCTTGCGCAGCCTTTGCGCCCGCGCGGTGGGGCGCCTCCTACAAAACGCCCCCCCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCgg < 1:4977186/149‑1 (MQ=255) ttCGTTTGGCTTATCCGACTTTTATTCATGGCCGCCGGCATGCCCACCAATTGACCCCTCCCCGTGGGGCGCATCCCAAAAAAAGCCCCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGt < 1:1216372/150‑1 (MQ=255) ttCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGGGCCAGCGGCCAAAAAGCGCACCCCCGCACATGTAAAGCCCCCAAAGGATGCGGGGTTATTGGCGCCAAATTGGcgagggg > 2:3135883/1‑144 (MQ=255) ttCGCTTGGCTGACCCGACTGTTCATTATGGCCGCCGGCTTGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCGGTGGTGCGCCTGCGAAAAAACGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGt < 2:1532296/150‑1 (MQ=255) ttGGCTGATCCGACTGTTCATTTTGGCCGCCGGCATGCGCAGCAATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTc < 2:1360417/150‑1 (MQ=255) gtGGCTGATCCTACTGTTCATTTTGGCCGCCGGAATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGAAAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTc < 2:5998767/149‑1 (MQ=255) ggCTGATCCGACTGTTCTTGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCAt < 2:5554776/150‑1 (MQ=255) ggCTGATCCGACTGTTCATGTTGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCGGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCAt < 2:5768634/150‑1 (MQ=255) gcttacccGACTGTTCTTGTTGGCCGCGGGAATGCGCAGCAATTGCGCCCTCGCGGGGGTGCGCCTGCCACAAAACGGCGCCCCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATg < 1:2312147/144‑1 (MQ=255) tCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTc < 2:3612093/150‑1 (MQ=255) cgtcttttCATGTTGGCCGCCGGCATGCGCAGCATTTGTGCCCTCGCGGTGGTGCGCCTGCGACAAAACGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTcac < 2:4838843/144‑1 (MQ=255) cGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGCGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTcac < 2:3224348/150‑1 (MQ=255) cGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTcac < 2:6592318/150‑1 (MQ=255) agtGTTCATGATGGCCGCCGGCTTGCGCCGCATTGGCGCCCTCGCCTTGGTGCGCCTGCTAAAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTcacgt < 1:550509/148‑1 (MQ=255) tGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGCCGGCGCCAAAAAGGCGCCCCCCGGCACTTGTACAGCCCCCCCCCGCTGCGGCGTAAAGAGCCCCCCATTAGCGCGGGTGCCACCTGCTTTaacctgc > 2:5103865/1‑150 (MQ=255) atgatgGCCGCCGGCCGGCGCCGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGGGCGCCTGCGACAAAACGGCGCCCCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTcacgtgcacggg < 2:5129978/150‑3 (MQ=255) atgatgGCCGCCGGCATGCGCAGCCTTTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAACGGCGCCCCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTcacgtgcacgtg < 2:5095761/150‑1 (MQ=255) atgatgGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCGGCGACAAAAACGCGCCCCCCCGCACTTGTAAACCCCCCACACGCTGCGGCTTAAAGCGCGCCAAATTCGCTCGGGGGGCGCATGCTTTaaactgcacgtg > 2:4349396/1‑150 (MQ=255) tttgggCCGCCGGCTTGCGCAGCCTTTGAGCCCCCGCGGTGGTGCGCCTGCCAAAAAATGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCacgtgcacgtgc < 1:1588701/146‑1 (MQ=255) gtgggCCGCCGGCTGGCGCCGCCTTTGCGCCCTCGCGGTGGTGCGCCTGCCAAAAAACGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCAcgtgcacgtgca < 1:6939115/147‑1 (MQ=255) ccgccgTCTTGCGCAGATTTTGCGCCCGCGCGGTGGTGCGCCTGCCACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCt < 1:3364999/150‑1 (MQ=255) ccgccgGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTcacgtgcacgtgaaagcat < 2:5114041/150‑8 (MQ=255) cgccgGCATGCGCAGCAATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCGTGCGAAAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCtt < 2:2722357/150‑1 (MQ=255) gcgggCTTGCGGAGCCTTTGAGCCCTCGCCTTGGTGGGCGTGCGACAAATTGGCGCACCACGGAACTTGTACAGACCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCTTATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCttt < 2:4927051/147‑1 (MQ=255) gccgccAGGCGCAGCCATGGCCCCCGCGCGGTGGTGCGCCCGCGACAACACGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCttt < 1:6577512/150‑1 (MQ=255) gccgGCTTGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCttt < 2:7039167/150‑1 (MQ=255) gccgGCATGCGCCGCCATTGCGCCCTCGCCGTGGGGCGCGGGTGACAAAACGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCttt < 2:2403507/150‑1 (MQ=255) gccgGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCttt < 2:6118730/150‑1 (MQ=255) cgGCTTGCGCAGCCTTTGAGCCCTCGCGGTGGTGCGCCTGCGACAAAATGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGt < 1:4818482/150‑1 (MQ=255) cgGCTTGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGGGCCTGCTACAAAATGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGt < 2:2071729/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCTTGCGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGCCAAAACGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTc < 2:5702982/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCATTGAGCCCTCGCGGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTc < 2:275979/150‑1 (MQ=255) gcAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCgc < 2:4959311/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCGCCCTCGCGGGGGTGCGCCTGCGACAAAACGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCgcctg < 2:1461107/150‑1 (MQ=255) gAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGc < 1:4284530/150‑1 (MQ=255) cgcGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAACGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGc < 2:3311314/148‑1 (MQ=255) cgcGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAACGGCCCCCCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGc < 1:5334001/148‑1 (MQ=255) cgcGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGc < 2:1938871/148‑1 (MQ=255) cTCGCCGTGGTGCGCCTACGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGc < 2:4023187/150‑1 (MQ=255) ccgcgggggtgCGCCGGCCACAAAACGGCGCCCCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCt < 1:1393009/143‑1 (MQ=255) ccGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGtt < 2:6021485/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGCCTTCTACAAATAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTc < 2:3235659/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGCGCCTGCCACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCATTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTc < 2:3368125/150‑1 (MQ=255) gtggtgCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTCa > 1:3000716/1‑150 (MQ=255) gtggcgcATGCAAAAAAACGGCCCCCCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTCAAc < 1:314414/147‑1 (MQ=255) ggtgCGCCTGCTACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTCAAc < 2:4393134/150‑1 (MQ=255) ggtgCGCCTGCTACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTAGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTCAAc < 2:5081891/150‑1 (MQ=255) ggtgCGCCTGCCACAAAATGGCCCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTCAAc < 1:3827874/150‑1 (MQ=255) tgCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCttt < 1:7239932/116‑1 (MQ=255) tgCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCttt > 2:7239932/1‑116 (MQ=255) cgcCGGCGACAAATAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTTCCTCGCCGTGCTGTTCAACctgc < 2:5490932/150‑1 (MQ=255) | TCGATCAGCATCTGGGAAGCCGCAGCGCCGCCCCAGAGCCAAGGCTTCATGCTGGTAGGCACACTGTTCATCCTGCCCAGTTCGCTTGGCTGATCCGACTGTTCATGATGGCCGCCGGCATGCGCAGCCATTGAGCCCTCGCCGTGGTGCGCCTGCGACAAAAAGGCGCACCACGGAACTTGTACAGCCCGCAACGGATGCGGCTTAATGCGCGCCATATTCGCTCGGGTGACTCATGCTTTCACGTGCACGTGCACATCTTTGTCTGTTCGCCTGCCTCGCCGTGCTGTTCAACCTGC > NC_002947/3781218‑3781516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |