Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 3,984,649 | A→C | 6.9% | I325M (ATT→ATG) ‡ | cobN ← | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,984,649 | 0 | A | C | 6.9% | 1089.1 / 50.3 | 330 | I325M (ATT→ATG) ‡ | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (146/161); new base C (11/12); total (157/173) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 |
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
GCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGG > NC_002947/3984500‑3984798 | aTTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAAt < 1:6228091/150‑1 (MQ=255) tGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgc < 2:4707129/150‑1 (MQ=255) gggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcg < 2:2844451/150‑1 (MQ=255) gggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGGCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcg < 1:152369/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcgc < 2:5829535/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcgc < 2:5745369/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcgc > 1:1951838/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGcc < 2:4574041/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCATTATCACGCGCCCg < 1:4433009/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGGACGGGCGCATTATCACGCGCCCggtca < 1:4754736/150‑5 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCa < 2:4213028/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAg < 2:30615/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCt < 1:2625473/150‑1 (MQ=255) cAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTc < 1:5379086/150‑1 (MQ=255) tCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGGACGGGCGCATTATCACGCGCCCGGTCAGCttcaa < 1:121972/149‑5 (MQ=38) tCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgc > 2:6096115/1‑150 (MQ=255) tCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgc > 1:2438234/1‑150 (MQ=255) gACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATACTGCGCCCGTCCAGCTCCGgccc > 1:3274066/1‑148 (MQ=255) 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tggacgaGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGc > 2:349510/7‑150 (MQ=255) cggGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGc < 2:3615549/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATg < 1:6095905/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATgg > 2:2636751/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATgg > 1:7006725/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCa < 2:1105461/150‑1 (MQ=255) tCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAgg > 2:4894528/1‑150 (MQ=255) tCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAgg > 1:589538/1‑150 (MQ=255) cGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGCCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgc > 2:7348301/1‑150 (MQ=255) aCAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgc < 1:3851740/150‑1 (MQ=255) 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gCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTgcgc > 2:3938858/1‑150 (MQ=255) cTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGca < 1:4628239/150‑1 (MQ=255) tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGtt < 2:3310881/139‑1 (MQ=255) tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGcac > 1:6498990/1‑150 (MQ=255) ctcgctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGAt < 1:3926870/150‑1 (MQ=255) tcgctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGAGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATTCAATGTGCATGGCCAGGTCTCGCGCGCCCAGGCCCTGATCGCTCGCTACCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACATATg > 1:1557129/1‑150 (MQ=255) cgctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATgg < 2:643042/150‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCt > 1:1073186/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTgcag > 2:1210178/1‑150 (MQ=255) tGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGa < 2:1048498/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGAt < 1:1750882/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGAt < 1:555773/150‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTcg > 1:2401778/1‑150 (MQ=255) aGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcggc < 1:6185602/150‑1 (MQ=255) tggacGGGCGCATTATCACGCGCCCGGTCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGaa > 1:2028523/5‑150 (MQ=255) tGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGaa > 2:321286/1‑150 (MQ=255) ggacGGGCGCATTATCACGCGCCCGGTCAGCTTCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCGGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGaca > 1:5470443/4‑148 (MQ=255) gggCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACggg < 1:5180629/150‑1 (MQ=255) cgTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAg < 2:3644872/150‑1 (MQ=255) cgTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAg < 2:2462994/150‑1 (MQ=255) gATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGtt > 2:5356682/1‑150 (MQ=255) aTAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTg < 1:2572545/150‑1 (MQ=255) tAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTgg > 2:4440036/1‑150 (MQ=255) aaTGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTggg < 1:215748/150‑1 (MQ=255) aaTGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTggg < 2:1899203/150‑1 (MQ=255) aaTGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTggg < 2:3367654/150‑1 (MQ=255) aaTGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTggg < 1:1210092/150‑1 (MQ=255) | GCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGG > NC_002947/3984500‑3984798 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |