| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,984,651 | T→C | 6.9% | I325V (ATT→GTT) ‡ | cobN ← | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,984,651 | 0 | T | C | 6.9% | 1067.7 / 42.9 | 333 | I325V (ATT→GTT) ‡ | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (146/164); new base C (11/12); total (157/176) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.70e-01 | |||||||||||
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
ATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGC > NC_002947/3984502‑3984800 | gggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcg < 2:2844451/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcgc > 2:3238310/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcgc < 1:4986049/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcgc < 2:5745369/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGcc < 2:4574041/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGccc < 1:5415113/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGGACGGGCGCATTATCACGCGCCCggtca < 1:5750315/150‑5 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCa < 2:4213028/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGGACGGGCGCATTATCACGCGCCCggtcag > 2:3508448/1‑143 (MQ=255) tCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGGACGGGCGCATTATCACGCGCCCGGTCAGCttcaa < 1:121972/149‑5 (MQ=38) tCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgc > 2:6096115/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaat < 2:1591584/150‑1 (MQ=255) aCCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCATTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaat < 2:2503193/150‑1 (MQ=255) cccAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatg < 1:1616554/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgc > 1:113564/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgc > 1:5311488/1‑150 (MQ=255) aGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgcaa < 1:20201/150‑1 (MQ=255) gcggcgGGCCAGCTCGGCGACACAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgcaat < 1:5598870/150‑1 (MQ=255) cggcggGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGcaatgcaatg < 1:4437074/150‑1 (MQ=255) gcggGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAAtgtg > 1:1899203/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCAt < 1:6421383/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATgg > 1:7006725/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATgg > 2:2636751/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCCATGCACATTGCATTGccg < 1:4532409/150‑2 (MQ=255) gCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCa < 2:1105461/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAg < 1:4721736/150‑1 (MQ=255) tCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAgg > 2:4894528/1‑150 (MQ=255) tCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGCCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCACGGCACTGTGCATGGCCCgg > 2:383281/1‑150 (MQ=255) ggCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCg > 1:2285241/1‑125 (MQ=255) cGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgc < 2:5803067/150‑1 (MQ=255) cGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGCCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgc > 2:7348301/1‑150 (MQ=255) aCAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgc < 2:1265091/150‑1 (MQ=255) aCAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgc < 1:2024265/150‑1 (MQ=255) aaaGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGc < 2:6688641/115‑1 (MQ=255) aaaGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgcgc > 1:3560155/1‑150 (MQ=255) aaaGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCGTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgcgc > 1:6352656/1‑150 (MQ=255) gTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGcc > 1:5516812/1‑150 (MQ=255) tCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGccc < 1:6629777/150‑1 (MQ=255) tCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGccc < 1:6790130/150‑1 (MQ=255) 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cgcTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGccc < 1:2412846/150‑1 (MQ=255) ggTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGc > 2:2193755/1‑150 (MQ=255) ggTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGc < 1:7229472/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTg < 1:6207685/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTg < 1:6482902/150‑1 (MQ=255) 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tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGtt < 2:3310881/139‑1 (MQ=255) tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGtt > 1:3310881/1‑139 (MQ=255) tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGcac < 2:3095128/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGcaca < 1:2973667/150‑1 (MQ=255) cgctcgctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAg > 1:6152507/1‑150 (MQ=255) cgctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATgg < 2:643042/150‑1 (MQ=255) gctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGc > 1:3872804/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCgcgcgcgc > 2:687658/1‑93 (MQ=255) tGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCt > 1:1073186/1‑150 (MQ=255) gcCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTgca > 1:4028317/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTgcag > 2:1210178/1‑150 (MQ=255) aGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCGAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCGAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTgcagaa > 2:5849821/1‑148 (MQ=255) tGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGa < 2:1048498/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGa > 1:1880146/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTcg > 2:2800697/1‑150 (MQ=255) aaGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcgg > 1:2531059/1‑150 (MQ=255) aGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcggc < 1:6077855/150‑1 (MQ=255) cTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGa < 1:3265204/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCGTGATAATGCGCCCGGTCAGCTTCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGAt > 2:2032579/1‑135 (MQ=255) cGGGCGCGTGATAATGCGCCCGGTCAGCTTCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGAt < 1:2032579/135‑1 (MQ=255) gcgcGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGgcg > 2:1420299/1‑150 (MQ=255) gATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGtt > 2:5356682/1‑150 (MQ=255) tAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTgg > 2:4440036/1‑150 (MQ=255) aaTGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTggg < 1:1210092/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGgc > 1:3845116/1‑150 (MQ=255) tGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGgc > 2:4740594/1‑150 (MQ=255) | ATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGC > NC_002947/3984502‑3984800 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |