| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,164,075 | 0 | A | G | 7.0% | 610.3 / 18.7 | 198 | intergenic (+30/‑179) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (64/118); new base G (4/10); total (69/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
CGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAA > NC_002947/4163926‑4164223 | cTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAA < 2:220878‑M1/150‑1 (MQ=255) aGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGGGC‑TTAGCGGGGAAAACCc > 1:4875093‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGC < 1:6994666‑M1/150‑1 (MQ=255) ccAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGGGC‑TTGGCGGGGAAACCCcca > 2:4050481‑M1/1‑147 (MQ=255) ccAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCGGC‑GGCGCGGGTAAAACCGCa > 1:5419604‑M1/1‑149 (MQ=255) cAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:6808820‑M1/150‑1 (MQ=255) aGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGGAAACCCccgcc > 2:1787098‑M1/1‑145 (MQ=255) aGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCCGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC < 1:2767246‑M1/150‑1 (MQ=255) aTTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TA < 2:4159476‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACGGGTGCGTTGCTCTACGTGTGGGTGGTTGGGGGGGGGCTGGCGATTTCCGTGGGGGTGCAGTAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TAC < 1:1277207‑M1/150‑1 (MQ=255) cGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAG < 1:616860‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCCCTCC‑GACAGG > 2:7314813‑M1/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAggt > 2:6450419/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAggt < 2:3898565/150‑1 (MQ=255) aGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAggtgg < 1:6839140/150‑1 (MQ=255) aGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAggtgg < 2:1175631/150‑1 (MQ=255) aGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAggtgg < 1:2614462/150‑1 (MQ=255) aGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAggtgg < 2:504317/150‑1 (MQ=255) ggCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGtgctg < 2:764907/150‑1 (MQ=255) gCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGtgctgc > 2:3954092/1‑150 (MQ=255) ccACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGATTGGAGACCGAGTCGGCGGC‑GTGGCGGGTAAAACCCCACC‑AACAagtgggtgggggc > 1:7286436/1‑145 (MQ=255) ccACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGcc > 2:7200615/1‑150 (MQ=255) ccACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGcc < 2:90460/150‑1 (MQ=255) 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> 2:4569822/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcggg > 1:2125780‑M2/1‑89 (MQ=255) aaGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcggg < 2:2125780‑M2/103‑15 (MQ=255) gACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTc < 2:5419604/150‑1 (MQ=255) cTGGAGACCGAGTGGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCG‑TAGAGGTGGGTGGTGCGGTGAAGACGGCATGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTGACGCGCTAAGCATGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCTTTGACGTCca < 2:6686967/150‑1 (MQ=255) cTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCca < 1:2879908/150‑1 (MQ=255) cTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCca < 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CGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑TACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAA > NC_002947/4163926‑4164223 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |