New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 2559164 = | 10 (0.040) | coding (153/1881 nt) | PP_2240 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
TATACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745073‑744925 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTCGCCT > NC_002947/2559164‑2559313 aggACGTGGCGCAGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC > 2:4677801/4‑150 aggACGTGGCGCAGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGGGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC > 2:5788651/4‑150 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2:478385/150‑1 TTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTG > 2:4606847/1‑150 TCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGC > 1:5302189/1‑150 TTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCT > 1:2667793/1‑150 AGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTC < 1:5997174/150‑1 GGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCC < 1:1174952/150‑1 TGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCA < 2:2489634/109‑1 GGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGA > 1:3846445/1‑150 GGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGA < 1:4992199/150‑1 GGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGA > 1:5655795/1‑150 GGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGAC < 2:5934812/150‑1 GTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTG < 2:2762853/119‑1 GTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGG > 2:1712465/1‑58 TTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCT < 1:5884614/150‑1 CATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGT > 1:1230261/1‑150 ATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTT < 1:5723090/150‑1 TGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTT > 1:2523818/1‑150 GGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTT < 2:167085/150‑1 GATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTC > 1:3509003/1‑150 GTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTC < 2:2251894/150‑1 GTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTC > 2:2695125/1‑150 GTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTC > 1:3396978/1‑150 TACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTCGC < 1:1730948/150‑1 ACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTCGCC > 1:3365612/1‑150 CACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTCGCCT < 2:1078651/150‑1 TATACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745073‑744925 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTCGCCT > NC_002947/2559164‑2559313 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |