New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 337811 | 155 (0.580) | 80 (0.370) | 36/234 | 5.6 | 38.1% | intergenic (‑58/+71) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 337839 | 135 (0.620) | intergenic (‑86/+43) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
CGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACC > NC_002947/337662‑337960 | cgcgGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGATCTGGTCGAGGGCGTGGAAGCGGGTGCGTCGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGt < 2:3630358/150‑1 (MQ=255) cgcgGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGATGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGt < 2:4248663/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGtata < 2:5347806/150‑1 (MQ=255) tttCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGATTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTGTAgc < 1:1899073/150‑1 (MQ=255) cacaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCACGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCc‑a > 2:3226218/1‑150 (MQ=255) cacaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTGTAGCGCc‑a > 1:2277337/1‑150 (MQ=255) cacaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACACGTATAGCGCc‑a > 1:3912255/1‑150 (MQ=255) acaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCc‑ac < 2:147618/150‑1 (MQ=255) gctgGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGGGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCaa < 2:755204/150‑1 (MQ=255) gctgGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGGGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCaa > 1:755204/1‑150 (MQ=255) gctgGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCaa < 2:4017220/150‑1 (MQ=255) tgGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAgg < 2:692750/150‑1 (MQ=255) tGCTCGATCAGTTACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCTGTTGCTTAGTTGGTTGGTGTGGATGTTTTTTTGAATGGCAATGATGTGTGTTGTTTTTGTGTTCCTCTTCGCGGTCTCG‑‑CCCTC‑TCGCAAATTTATTGCGCC‑ACA‑TTCATGGTTg < 2:447915/150‑1 (MQ=255) tGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTg < 1:2959985/150‑1 (MQ=255) tGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTg < 2:447891/150‑1 (MQ=255) tGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTGAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTGTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑GCCCCCAGGGATAGCGCC‑ACA‑TTCaacggtg > 1:2998663/1‑145 (MQ=255) gCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTgg < 1:276347/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTgg < 2:5405093/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTgg < 1:4406909/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTgg < 1:531848/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTgg < 1:531844/150‑1 (MQ=255) tCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGgcg > 2:3774414/1‑150 (MQ=255) cGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGgcgc < 1:5837040/150‑1 (MQ=255) gATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGgcgca > 2:4147010/1‑149 (MQ=255) gATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGAGGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCCCAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCt > 1:4333645/1‑150 (MQ=255) tCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTgg < 1:4518522/144‑1 (MQ=255) tCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTac < 2:3673595/150‑1 (MQ=255) tCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTac < 2:3037237/150‑1 (MQ=255) cAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTaca < 1:379556/150‑1 (MQ=255) aGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑GCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGGTGgcgcaaaac > 1:1473261/1‑145 (MQ=255) ggAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACAcc > 2:2463725/1‑150 (MQ=255) gAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCaa > 2:3241742/1‑134 (MQ=255) gAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCaa < 1:3241724/134‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGtgta < 2:3465814/120‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGtgta > 1:3465814/1‑120 (MQ=255) aCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTATACCtgt < 2:5632821/150‑1 (MQ=255) aCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCtgt < 1:4802235/150‑1 (MQ=255) aCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCtgt < 2:3977568/150‑1 (MQ=255) tGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTgg < 2:2493812/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCtgt < 2:843556/145‑1 (MQ=255) cGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGc < 2:1193289/150‑1 (MQ=255) cGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGc < 2:3076926/150‑1 (MQ=255) gAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCCC‑GCCCCCAGGTATAGCGCC‑CCA‑AACAAGGTTGGCGCGGCACCCGTGGGAGCg > 1:5165178/1‑150 (MQ=255) aGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCgg < 2:3206275/150‑1 (MQ=255) ccTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGt < 2:2961841/150‑1 (MQ=255) tGGATGGGGGTGCTTCGGTGGGGGCTGTGGAGGGGGTTGGGCATGGCAAGGTTGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACTGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGc < 2:122709/150‑1 (MQ=38) tGGACGGGGGTGGTTTGGTGGGGGCTGTGGAGGTGTTTGGGCTTGGCATGGATGTGTGGTGGTTTTGCGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATCGCGCC‑ACA‑TTAAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGc < 1:3959716/150‑1 (MQ=37) gAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCCCGC‑CCCCACGGATATAGC‑CC‑CCA‑TAAAGGGTTTG‑GCGAAACCCGTGGGGGCGGGCCTGccc > 1:1084314/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑GCCCCCCCGTATAGCGCC‑CCACTAAAAGATTGGCGGT‑CACCCCGGGGAGGGGGCGGGccc > 1:2753627/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACC‑‑CCCCCGCCCCACAGG‑AAAGCGCC‑CCA‑ATAAAAGGTGGGGCGACACCAGTGGGGGCGGGCGGGccc > 1:1084425/1‑150 (MQ=255) gggTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCAC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaa > 1:3895116/1‑150 (MQ=255) gCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACACGTAAAGCGCC‑ACA‑AACAAGGTTGGCGCTACACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGcag > 1:4481040/1‑150 (MQ=39) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCAAAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGcagtc > 2:460096/1‑150 (MQ=255) ggggggggCTGTGGCGGTGGTTGGGCAGGGCACGGAGGTGTGGTGGTTTTGCGGGCCTCTGCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACCGGTTGCGCGCC‑ACA‑TTCACGGTTGGCGCTACACCTGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGcagtcagt < 2:4382073/147‑1 (MQ=37) tGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGc > 2:972573/1‑124 (MQ=255) tGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGc < 1:972573/124‑1 (MQ=255) ggggggCTTGGGCGGTGGTGGGGCTGGGCATGTTTGTGTGGGTGTTGGGCGGGCCTGTTCGCGGGCCCG‑‑CCCGC‑GCCCACCGGTATCGCCCC‑ACT‑TTCACGGTTGGCGCTACCCCGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGa < 2:1276602/149‑1 (MQ=255) gtgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCc‑a < 1:1601628/85‑1 (MQ=255) gtgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCc‑a > 2:1601628/1‑85 (MQ=255) ggAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACTGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCg > 2:1761638/1‑150 (MQ=255) gAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTgg < 2:3066520/109‑1 (MQ=255) gtTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTgg > 2:2964001/1‑103 (MQ=255) gCATGGCACGGATGTGTGGGGGTTTTGAGGGCCGCGTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGAATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTggcaggc < 2:4638748/150‑1 (MQ=38) tggtggTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACCCGCAAcccc > 2:4311613/1‑148 (MQ=255) tgggcgggCCTCGCCGCGGCCACG‑‑CCCGC‑CCCCACAGGTATCGCGCC‑ACA‑TCCACGGGTGGCGCAACCCCGGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCca < 2:1621343/145‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑ATCAAGGTTGGCGCTACACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAGCAGTCAGTGGGGTCTCAGCGGCCGTGGCCGGCATCCCCCCGCAACCACCGCGCCAGCACCTTGaa > 2:3782132/1‑150 (MQ=25) tctTCGCGGGCACG‑‑CCCAC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGaa < 2:3895116/150‑1 (MQ=255) aCG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATATCGCC‑ACA‑TTCAATGTTTGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCa > 1:1466908/1‑150 (MQ=255) g‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAGCAGTCAGGGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGc > 2:5248352/1‑150 (MQ=255) gC‑TCCCACTGGTATAGCGCC‑ACT‑TTCACGGTTGGCGCTACACCGGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGa < 1:1883685/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAAc > 2:3435524/1‑150 (MQ=25) tCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAAc > 2:5091605/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCAcgc > 1:3013503/1‑104 (MQ=14) ccACAGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga > 1:766114/1‑150 (MQ=25) ccACAGGTATAGCGCC‑ACT‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga < 2:2424347/150‑1 (MQ=255) ccACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCcagca < 1:894929/122‑1 (MQ=255) ccACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCcagca > 2:894929/1‑122 (MQ=255) ccACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga > 1:197706/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga > 2:3710499/1‑150 (MQ=255) cacaGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTggca > 2:2125769/1‑92 (MQ=14) cacaGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgag > 2:4867132/1‑150 (MQ=255) cacaGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgag > 1:58449/1‑150 (MQ=255) acaGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 2:4209544/1‑150 (MQ=25) acaGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGACTTGCACCAGCATGAACgaga > 2:1402196/1‑150 (MQ=25) acaGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCATTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 1:5712925/1‑150 (MQ=25) acaGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 1:3460804/1‑150 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGcc < 2:4472321/130‑1 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 1:4344312/1‑150 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 1:2764178/1‑150 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 2:627327/1‑150 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 2:4452668/1‑150 (MQ=255) aGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATc > 1:4001499/1‑150 (MQ=25) aGGTGTAGCGCCAACC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATc > 2:189487/1‑150 (MQ=25) aGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATc < 1:3710521/150‑1 (MQ=255) gTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAc > 2:1312837/1‑150 (MQ=255) gTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAc > 2:2133298/1‑150 (MQ=255) gTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAc > 2:2220007/1‑150 (MQ=255) tataGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCCGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAcc > 2:2706631/1‑150 (MQ=255) tataGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAcc < 1:4480638/150‑1 (MQ=255) tataGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAcc > 1:89991/1‑150 (MQ=255) | CGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACG‑‑CCCGC‑TCCCACAGGTATAGCGCC‑ACA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACC > NC_002947/337662‑337960 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |