| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1785057 | 229 (0.550) | 74 (0.190) | 53/282 | 12.6 | 27.0% | intergenic (+25/+81) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| ? | NC_002947 | 1785120 = | 182 (0.460) | intergenic (+88/+18) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
CCTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACC > NC_002947/1784909‑1785204 | ccTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTACGCGGgcg > 2:6026203/1‑149 (MQ=255) cTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGgcgc > 2:6333425/1‑149 (MQ=255) tGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGgcgcg < 1:7039966/149‑1 (MQ=255) tGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGgcgcg < 1:4732755/149‑1 (MQ=255) cgcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGTGCCCGcg < 1:1060981/149‑2 (MQ=255) cgcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCt < 2:1081043/149‑1 (MQ=255) gcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCATGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTc < 2:893300/149‑1 (MQ=255) gcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGcga < 1:8030120/149‑3 (MQ=255) gcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTc < 2:5498403/149‑1 (MQ=255) cAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGcgcgcccgcgcc > 1:1653922/1‑149 (MQ=255) aGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTccc < 1:7270629/149‑1 (MQ=255) aGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTccc < 1:1153825/149‑1 (MQ=255) ggTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGTGCCCGcgaagggg < 2:5600818/149‑8 (MQ=255) ggTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCcaca < 1:8879820/149‑1 (MQ=255) ggTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCcaca < 1:5463124/149‑1 (MQ=255) tGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGt < 2:393262/149‑1 (MQ=255) aGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAct < 2:2528121/149‑1 (MQ=255) gCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActg < 2:7036987/149‑1 (MQ=255) 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gATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACACTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCTCCCACACGTAAAGAGCTGCGCGTGTAAACAACGCAGTACCAGTGGGAGCCGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGAtaacccgt > 1:6583283/1‑142 (MQ=255) atatGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAGGGGTTGAGCAG‑Cgggt > 2:5768897/1‑147 (MQ=255) atatGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCACAGGTAAATCGCGTCGCGTGAAAAAATCCCTGTAACTTTGGGAGCGGGCGTGGCCGCGCAGGGGTTGATAAA‑CGGtt > 1:5682941/1‑149 (MQ=255) tgagtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTg > 1:7503608/1‑149 (MQ=255) tgagtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAAGTCGCTGCGCGTGTAAAGAGCGCGGTAACAGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGCAGGGGTTGATCAG‑CGGGTTTg > 1:7166201/1‑149 (MQ=25) agtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCa > 2:6697771/1‑149 (MQ=255) agtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCa > 2:6697868/1‑149 (MQ=255) agtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGTACTGCGCTGCGGGTGCAATCAGCGCTGTTCCGGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGcc > 2:6148462/1‑148 (MQ=38) agtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCTCCCACACGTACAGCGCGGCGCGTGAAAACCGCGCTGTACCAGTGGGAGCCGGCGGGCCCGCGCAGGGGTTGATCAG‑CGGGTTTGCa > 1:8155110/1‑149 (MQ=255) gagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGGACTGCGCTGCGCTTGAAATAAGCCCGTTAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCCAAGGGGTTGATCAG‑CGGGTTTTCAGGa > 1:3649528/1‑149 (MQ=38) cGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGgc > 2:7274646/1‑149 (MQ=255) cGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGTACGGCGCTGCGCTTGAACTCAGCGCTGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGGGATCCG‑CGGTTTTGCAGGAAGgc > 2:8882646/1‑149 (MQ=38) cGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGACCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACACGGAATGCGCTGCGCTTTTAATCAGCGCTGTACCGGTGGGGGCGGGGGGGCCCGCGGAGGGGGTTTTAAG‑CGGGTTTTGAGGAAGgc > 2:4042921/1‑149 (MQ=255) gggTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAATGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATg > 2:7388600/1‑149 (MQ=255) tCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGACCACCCGTACTGCGCTGCCCTTTAAAAAAGCCCAGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAGGGGTTGTTAAG‑CGGTTTTGGAGgaaggcgcgaaggcgcg > 2:1501908/1‑148 (MQ=255) gTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCCGCGCTGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTccg > 2:8161095/1‑149 (MQ=255) tCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTccgc > 2:3588766/1‑149 (MQ=255) aGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCCAAGGTACAGCGCTGCGCGTGTAAACAGCGCTGTAACAGTGGGGGCGGGCGTGCCCCCGGCGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTTCAGGAAGGCGCCAATGCGCTCcgccgc > 2:8333873/1‑149 (MQ=255) aaGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCg > 2:8710877/1‑149 (MQ=255) gCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCTCCCACACGTAGATCGCTGCGCTTGAAAAAAGCGCGGTAACAGTGGGGGCGGGCGTGGCCCCGAACGGGTTGTTAAGCCGGTTTTG‑AGGTAGGCGCGCAAGCGCGCCCCCCCGTCGAAGCAATAGGcc > 2:1140790/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCCCCGGTACTGCGCTGCGCTTGTAATCAGCGCTGTACCTGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGc > 2:1337871/1‑149 (MQ=39) ggcgcCCGCTCCCACGGCTACGGGGCTGCGCTGGAAACCCGCGTGGTACGTGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAAcc < 2:7331776/148‑1 (MQ=255) | CCTGAGGGCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAG‑CGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACC > NC_002947/1784909‑1785204 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |