Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,206,967 | 0 | A | C | 22.8% | 1006.5 / 28.3 | 406 | Q139P (CAG→CCG) | xcpW | type II secretion pathway protein XcpW |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (245/59); new base C (1/89); total (246/160) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
TTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGAGCCCCCTATGTCTGCAC > NC_002947/1206819‑1207114 | cTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAgcg > 1:105537/1‑149 (MQ=255) gtgGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGcgcg > 1:644334/1‑149 (MQ=255) gtgGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGcgcg > 1:5153239/1‑149 (MQ=255) gtgGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGcgcg > 1:3823740/1‑149 (MQ=255) gggTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGCAGGTGGCTCGCGCCCGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCCGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCTCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGaa < 2:198421/149‑1 (MQ=255) gggTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGaa < 1:204031/149‑1 (MQ=255) gggTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGaa < 1:4688915/149‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGACCg > 2:4794926/1‑149 (MQ=255) gTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACg > 2:7630771/1‑149 (MQ=255) gTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACg > 2:3799265/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGa > 1:7136151/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGAc > 2:6098457/1‑149 (MQ=255) cAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCg > 2:8221112/1‑149 (MQ=255) cAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCg > 1:7243574/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGAccc > 2:5065100/1‑148 (MQ=255) aCCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCa > 2:3724895/1‑149 (MQ=255) gCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTc > 2:2145566/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAgc > 1:8215898/1‑149 (MQ=255) gCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAgcg > 2:1612549/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGcc > 1:2540964/1‑149 (MQ=255) gCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCAt > 2:3120082/1‑149 (MQ=255) gCCGATGGTGGCGCGCGCCTGCACCGCCAGCGCGGGCGGTTCGCGGCCCGGGACAACCGCCTGCTGCTGTAAAGCTCGGCGGACGTTTCCGCGGCTGGCGCCCCGGGGTGTGTACAGCGCCAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGaa < 2:7855653/149‑1 (MQ=255) gCCGACGGTGGCTCGCGCCTGCACCGCCAGCGCCTGCGTTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGaa < 2:6655968/149‑1 (MQ=255) cGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACg > 1:8656469/1‑149 (MQ=255) aGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACgttc > 2:2612570/1‑149 (MQ=255) gggggCGCGCGCCTGCACCCCCTGCGCCTGGGGTTCGTGGCCGGCGAGCACCGCCTGCTGGTGTAACGCGGGGCGGACCTTTACGCGGCTGGCGCCCCGGGCTGGGTACCGCGCCAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACgttct < 2:543163/146‑1 (MQ=255) gTGGCTCGCGCCTTCAACGCCAGCGCCTGGGGTTGGCGGCCCGCGTGCACCGCCGGCGGTTGGAATGCTCGGCGGACCTGGACGCCGCTGGCGCCCCGCGGGGGGTACCGCGCTAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACgttctg < 2:7447197/149‑1 (MQ=255) ggCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACgttctgtt > 1:1420771/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGCACCGCCCGCGCCGGGGGTGGGGGGCCGGGGTGCACGGCCTGCTGGTGGACGGGGGGGGGGCCGTGTCCGCGGGGGGCGCCCGGGGGGGGGTACCGCGCCCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTAcc < 2:5561135/149‑1 (MQ=255) cgcCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCa > 2:5633281/1‑149 (MQ=255) gCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGggcg > 1:8364621/1‑149 (MQ=255) cAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGggcgg > 1:3485920/1‑149 (MQ=255) aaCCCCAGCGCGTGCGTTTCGAGCCCCGACACAAACGCCTCCTGCTTTAAAGCCCGGCGCACCTGTACCCCGCTGGCGCCCCGCGCTGTTAAAAGCGCAAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGggcggc < 2:8519309/149‑1 (MQ=255) aCGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGcc > 1:6368906/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgct > 1:5955187/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgct > 2:780883/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgctgg > 1:2388673/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGCGGTTCGCGGCCCGCGAGCACCGCCTGCTGGTGTAACGCTGGGCGGACCGGTCCGCCGCTGGCGCCCCGCGGTGGTAACCGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgctggc < 2:4086465/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAATGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgctggc > 1:4493798/1‑149 (MQ=255) tGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGctggcc > 1:5231076/1‑149 (MQ=255) ttCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCtggcctggcc > 2:5745924/1‑149 (MQ=255) tCGTGGCCCGCGCGCACCGCTTGGTGGTGTAAAGCCGGGGGTACCTGTAGGCCGGGGGGCCCCCGCGGTGGTTACAGCGGTACCGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTggcctgtcct < 2:8910868/149‑1 (MQ=255) gAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTc > 1:1281159/1‑149 (MQ=255) gAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTc > 1:2648720/1‑149 (MQ=255) gAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTc > 1:7864169/1‑149 (MQ=255) cccGCGCGCAACGCCGGCTGCGGGAAAGCTGGGCGGACCTGTCCGCCGCGGGCGCCCCGCGCGGGGTACCGCGCCAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGAc < 2:2017843/149‑1 (MQ=255) cccGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGAc > 2:3892421/1‑149 (MQ=255) cgAGCAACGCCGGCGGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGCACGCCGCTGGCGCCCCGCGCGGGGTCCCGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCGACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAAc < 2:8106655/149‑1 (MQ=255) cAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGt > 2:717962/1‑149 (MQ=255) aaCGCCTGGTGCTGTAAAGCTGGGGGTACGTGTACGCGGGTGGCGCCCCGCGGTGGTTACCGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTg < 2:1246894/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGc > 2:226014/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCa > 1:3008879/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTGGTGTAATGCTCGGCTGCCCTGTCGGGGTCGGGCGCCGCGCGGTGTGTAACGCGCCCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGTGCGGCCGCTTGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTTCAc < 2:5486843/149‑1 (MQ=255) ctggtggtgGACTGCTGGGGGGACGTGTACGCGGGGGGCGCCCGGGGGGGGTTACAGGGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCAccc < 2:4903228/149‑1 (MQ=255) ctgctgctgGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCAccc > 2:8003565/1‑149 (MQ=255) ggctgctgTAAAGCTCGGGGGACCTTTAGGCCGCGGGCGCCCCGCGGTGGGTACCGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCa < 2:7491578/148‑1 (MQ=255) gtggtgGAAAGCTCTGCGGACGTGTACGCGGGTGGCGCCCCGCGGGGGGTACCGCGCGCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAgg < 2:6820327/145‑1 (MQ=255) ctgctgGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAgg > 2:4327790/1‑149 (MQ=255) 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cTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGc > 1:6898094/1‑149 (MQ=255) tgggcggACCTGTCCGCCGCGGGCGCCCCGCGCGGGGTCCCGCGCGCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCg < 2:8300350/147‑1 (MQ=255) tCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCg > 1:7652949/1‑149 (MQ=255) cggcggACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGt < 2:4985540/149‑1 (MQ=255) cggcggACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGt > 1:6619201/1‑149 (MQ=255) 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aCGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAActgctg > 1:5671186/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAActgctg > 1:5016657/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACtgctgc > 2:3268816/1‑149 (MQ=255) ccgcTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGt > 2:871103/1‑149 (MQ=255) ccgcGGGCGCCCCGCGGTGGTTACCGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGt < 2:7436819/149‑1 (MQ=255) ggggcccccccGCGGTGGGTACCGCCCCCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGa < 1:8040529/142‑1 (MQ=255) gcTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTgt > 2:5938348/1‑148 (MQ=255) ggCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATgg > 2:1496376/1‑149 (MQ=255) ggCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATgg > 1:3193254/1‑149 (MQ=255) gcgcCCCGCGGTGGTTACTGGGCTAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGa < 2:1763763/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCCACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGa > 1:7328800/1‑149 (MQ=255) ccccGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGAGcc > 2:4733023/1‑149 (MQ=255) cccGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGAGccc > 2:1171035/1‑149 (MQ=255) cccGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGAGccc > 2:735941/1‑149 (MQ=255) cccGCGCTGGGAACCGCGCGCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGAGccc < 2:2524070/149‑1 (MQ=255) 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tACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGAGCCCCCTATGTCTGc > 1:493386/1‑149 (MQ=255) tACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGAGCCCCCTATGTCTGc < 1:8291639/149‑1 (MQ=255) | TTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCACCCAGGTCGTGGTGTGCGTCTGGAACTGCTGCGTGATGGAGCCCCCTATGTCTGCAC > NC_002947/1206819‑1207114 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |