| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 744925 = | NA (NA) | 482 (0.980) | 200/294 | 0.2 | 96.6% | intergenic (‑587/+44) | PP_0636/PP_0637 | cold shock DNA‑binding domain‑containing protein/transposase |
| ? | NC_002947 | 2559164 = | 17 (0.030) | coding (153/1881 nt) | PP_2240 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein | |||||
Only 100 of 519 total aligned reads displayed.
ATACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745072‑744925‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTCGCC > NC_002947/2559164‑2559312 ggACGTGGCGCAGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC > 1:4244360/3‑149ggACGTGGCGCAGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC > 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CCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCT > 1:9210001/1‑149 CCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCT > 2:10627902/1‑149 TTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGC > 2:1758733/1‑149 AGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGT < 1:7523705/149‑1 AGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTCGCCGGGCCCGATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGT < 1:2278786/149‑1 TGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCT < 2:3121202/149‑1 TGGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCT > 2:9425203/1‑149 GGGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTG > 2:4948174/1‑149 GGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGA > 1:4469495/1‑149 GGGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGA > 2:4488065/1‑149 GGTTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGAC > 1:8604124/1‑149 TTCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGC > 1:10378420/1‑149 TCATGGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCT > 1:540824/1‑149 GGATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTT < 2:1456597/149‑1 ATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTC < 1:1000679/149‑1 ATCGGTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTC < 2:1175010/149‑1 GTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTT < 2:4828774/149‑1 GTTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTT < 2:2644214/149‑1 TTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTC > 2:8022038/1‑149 TTACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTC > 2:5218758/1‑149 TACACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTCG < 2:7404218/149‑1 ATACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745072‑744925‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CACTGCAGCCGCAACTCTGGCCGTGCGTTTTACACGCTGGGGCAGCCAGTTCTGGCAGCTTGCCGGGCCCTATTTCAGTTTCAGGCGCAGTTGGCGGCCGTTGCTGGTGTTTGCCCTGCTGCTGGTCCTGACGCTGTTTTCGGTTCGCC > NC_002947/2559164‑2559312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |