Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_002947 | 1,515,811 | (33-bp)2→1 | pseudogene (715‑747/1851 nt) | PP_1325 ← | putative lipoprotein |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_002947 | 1515769 | 1515801 | 33 | 597 [0] | [0] 595 | PP_1325 | putative lipoprotein |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 1515768 | 0 (0.000) | pseudogene (790/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
Only 100 of 597 total aligned reads displayed.
AGCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGC > NC_002947/1515620‑1515916 | gCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttgg > 2:1170742‑M2/1‑144 (MQ=255) aTGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcag > 2:6667429‑M2/1‑140 (MQ=255) tGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGTGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggct < 2:10087460‑M2/149‑15 (MQ=255) 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cgcgGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcg < 2:3864156‑M2/149‑101 (MQ=255) cgcgGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcg < 1:7565492‑M2/149‑101 (MQ=255) gcgGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcga > 2:4873562‑M2/1‑48 (MQ=255) gCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggc > 1:9476235‑M2/1‑44 (MQ=255) cacCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgct < 2:3239858‑M2/149‑110 (MQ=255) acCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgctt < 1:4562339‑M2/149‑111 (MQ=255) acCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgctt < 2:9382668‑M2/149‑111 (MQ=255) ccGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg < 2:7582179‑M2/149‑112 (MQ=255) ggCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgcggggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggctgcggtggccgcttgct < 2:6566276‑M2/149‑114 (MQ=255) gCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctg < 1:1387307‑M2/149‑115 (MQ=255) cGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgct < 1:222230‑M2/149‑120 (MQ=255) ccTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccag < 1:3120937‑M2/149‑124 (MQ=255) ccTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccag > 2:3086514‑M2/1‑26 (MQ=255) ccTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccag > 2:7288221‑M2/1‑26 (MQ=255) ttCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccaggg > 1:4778406‑M2/1‑24 (MQ=255) gAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgct < 1:7077886‑M2/128‑110 (MQ=255) gAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgct > 2:7077886‑M2/1‑19 (MQ=255) aGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccgg < 2:972367‑M2/149‑132 (MQ=255) ggCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggc > 1:1651839‑M2/1‑17 (MQ=255) gcagcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgctt < 2:861452‑M2/149‑137 (MQ=255) 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ggCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttcacgg < 2:40037‑M2/149‑144 (MQ=255) tcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttcacggcgaag > 1:2792796‑M2/1‑1 (MQ=255) | AGCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGC > NC_002947/1515620‑1515916 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |