Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_002947	5511548	5511583	36	3 [1]	[0] 2	PP_4839/cycA	iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease

GTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTC  >  NC_002947/5511428‑5511563                                                                                                                        |                 gTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCcta  >  1:277433/1‑135 (MQ=255)                                                                 tGGATAGTTTTGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGGCAGCGCTTGAGCCTTgtgt                  <  2:217689/56‑1 (MQ=255)                                                                 tGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTgtgt                  >  1:217689/1‑56 (MQ=255)                                                                                                                        |                 GTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTC  >  NC_002947/5511428‑5511563

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑