| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 1015867 = | 15 (0.040) | 437 (1.150) | 174/286 | 0.1 | 69.3% | intergenic (‑94/‑674) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
| ? | NC_002947 | 5406744 = | 373 (0.980) | intergenic (+1123/+45) | PP_4743/PP_4745 | hypothetical protein/transposase | |||||
Only 100 of 835 total aligned reads displayed.
CACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCGGAGAGGGTGCTAAGGCCGCCTCCGGCA > NC_002947/1015720‑1016016 | gtggctgcgccacgtccttgagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGa > 2:1015646‑M1/146‑150 (MQ=255) gtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGa < 2:545206‑M1/5‑1 (MQ=255) cacaGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGa < 2:4481773/150‑1 (MQ=255) gctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGaa < 2:8494218‑M1/6‑1 (MQ=255) gctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAAtt < 1:5066495‑M1/8‑1 (MQ=255) ctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgtctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAAttt > 2:7021309‑M1/142‑150 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa > 2:1484914‑M1/141‑150 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa > 1:4081304‑M2/1‑146 (MQ=255) gccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGcc < 1:1257367‑M1/13‑1 (MQ=255) cctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGtttttt < 2:765887‑M1/20‑1 (MQ=255) cAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCCTAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatcca > 1:3741632‑M2/1‑138 (MQ=255) ctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTa > 2:5048129‑M1/130‑150 (MQ=255) tggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTAt < 1:3533258‑M1/22‑1 (MQ=255) aaCCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatcc < 1:8181615‑M2/150‑19 (MQ=255) cTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccaca < 2:7148700‑M2/150‑24 (MQ=255) gccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTaa > 2:6808592‑M1/119‑150 (MQ=255) cgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGt > 1:4884737‑M1/117‑150 (MQ=255) ccaccGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattc > 2:5843901‑M2/1‑124 (MQ=255) 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agactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGtt < 2:3125758‑M1/53‑1 (MQ=255) tAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccga < 1:2749381‑M2/150‑49 (MQ=255) tacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAgg > 2:6502214‑M1/94‑143 (MQ=255) aaTTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgat > 1:6498873‑M2/1‑101 (MQ=255) ttCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatc < 2:8117446‑M2/109‑11 (MQ=255) 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tCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgc < 2:2312162‑M2/150‑57 (MQ=255) gccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCttt > 2:1594266‑M1/80‑150 (MQ=255) gccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCttt > 2:3588670‑M1/80‑150 (MQ=255) gccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCttt > 2:289073‑M1/80‑150 (MQ=255) gccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCttt > 1:3411950‑M1/80‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |